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for query gene Pput_1080 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_1080  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  100 
 
 
253 aa  497  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.557784  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1039  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  99.21 
 
 
253 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1036  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  95.65 
 
 
253 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4187  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  91.24 
 
 
252 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0516  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  70.66 
 
 
264 aa  361  6e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852209  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45480  twin arginine-targeting protein translocase  71.67 
 
 
265 aa  349  3e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5809  twin arginine-targeting protein translocase TatC  70.39 
 
 
267 aa  347  8e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66980  sec-independent protein translocase TatC  70.39 
 
 
267 aa  347  1e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0332914  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0382  Sec-independent periplasmic protein translocase  66.8 
 
 
266 aa  344  7e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5157  sec-independent protein translocase TatC  66.39 
 
 
266 aa  344  1e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0447  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  67.65 
 
 
263 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.497745  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5018  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  63.89 
 
 
262 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4892  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  63.89 
 
 
262 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.418116  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5068  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  66.12 
 
 
262 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57281  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0380  Sec-independent periplasmic protein translocase  63.18 
 
 
264 aa  330  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0591  Sec-independent protein translocase TatC  56.96 
 
 
255 aa  293  2e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0294622  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0741  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  55.23 
 
 
258 aa  287  9e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00562  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  56.33 
 
 
251 aa  285  5.999999999999999e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0470  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  56.38 
 
 
248 aa  274  9e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1702  Sec-independent protein translocase TatC  54.27 
 
 
269 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3060  Sec-independent periplasmic protein translocase, TatC  54.36 
 
 
250 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3422  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  54.87 
 
 
260 aa  272  4.0000000000000004e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1486  Sec-independent protein translocase TatC  55.91 
 
 
254 aa  270  1e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.450631  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3758  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  54.32 
 
 
253 aa  270  1e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.428108  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0456  Sec-independent protein translocase TatC  53.94 
 
 
261 aa  271  1e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3378  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  52.7 
 
 
251 aa  270  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.865812  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3797  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  54.66 
 
 
253 aa  269  4e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03731  TatABCE protein translocation system subunit  54.78 
 
 
258 aa  268  5e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4141  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  54.78 
 
 
258 aa  268  5e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4310  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  54.78 
 
 
258 aa  268  5e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4062  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  54.78 
 
 
258 aa  268  5e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5279  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  54.78 
 
 
258 aa  268  5e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.613586  normal  0.20665 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4359  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  54.78 
 
 
258 aa  268  5e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4221  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  54.78 
 
 
258 aa  268  5e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142004 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03680  hypothetical protein  54.78 
 
 
258 aa  268  5e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4170  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  54.78 
 
 
258 aa  268  5e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164858 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3001  sec-independent protein translocase protein TatC  53.33 
 
 
251 aa  268  8e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87318  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4051  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  56.09 
 
 
250 aa  267  1e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4242  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  55.65 
 
 
249 aa  267  1e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4255  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  54.67 
 
 
259 aa  266  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4206  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  54.67 
 
 
259 aa  266  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4362  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  54.67 
 
 
259 aa  266  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0221  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  55.65 
 
 
368 aa  266  2e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4183  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  54.67 
 
 
259 aa  266  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.335663  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4302  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  54.67 
 
 
259 aa  266  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.901815  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0132  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  51.22 
 
 
398 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0253  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  56 
 
 
256 aa  266  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.3231 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4204  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  52.28 
 
 
249 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0400  Sec-independent protein translocase TatC  53.53 
 
 
249 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3556  Sec-independent protein translocase TatC  53.11 
 
 
249 aa  265  7e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2427  hypothetical protein  56 
 
 
250 aa  264  8.999999999999999e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2610  Sec-independent protein translocase TatC  54.47 
 
 
262 aa  264  8.999999999999999e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00567  Sec-independent protein translocase protein  52.28 
 
 
249 aa  264  1e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4215  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  53.28 
 
 
269 aa  264  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3940  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  55.56 
 
 
258 aa  263  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3226  hypothetical protein  49.21 
 
 
257 aa  263  2e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.849662  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0276  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  55.56 
 
 
258 aa  263  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3910  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  54.32 
 
 
255 aa  262  4e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0318  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  51.88 
 
 
258 aa  262  4.999999999999999e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3636  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  55.56 
 
 
258 aa  261  6e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4101  sec-independent protein translocase, TatC subunit  53.48 
 
 
255 aa  261  8.999999999999999e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.84957 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0501  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  53.11 
 
 
249 aa  260  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1974  Sec-independent protein translocase TatC  51.93 
 
 
368 aa  257  1e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.812349  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3900  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  53.62 
 
 
251 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0165  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  54.44 
 
 
255 aa  256  2e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0414  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  53.62 
 
 
251 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0426  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  53.62 
 
 
251 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000454537 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0440  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  53.62 
 
 
251 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.289196 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3955  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  54.22 
 
 
256 aa  255  4e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0774266 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0260  Sec-independent protein translocase TatC  51.68 
 
 
244 aa  251  7e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0872197  hitchhiker  0.00458614 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0547  Sec-independent protein translocase TatC  49.59 
 
 
245 aa  247  1e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0576043  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001922  twin-arginine translocation protein TatC  54.08 
 
 
250 aa  246  3e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0915  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  51.07 
 
 
265 aa  245  4e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1087  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  54.66 
 
 
264 aa  245  4.9999999999999997e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3207  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  54.96 
 
 
250 aa  241  6e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3043  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  48.31 
 
 
252 aa  240  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2002  Sec-independent protein translocase TatC  46.67 
 
 
278 aa  239  2.9999999999999997e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.4915  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2305  Sec-independent protein translocase TatC  47.46 
 
 
294 aa  236  3e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.920568  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3730  Sec-independent protein translocase TatC  52.7 
 
 
249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0808  Sec-independent protein translocase TatC  48.52 
 
 
266 aa  231  7.000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0522  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  54.78 
 
 
256 aa  227  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.741843 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2322  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  47.03 
 
 
277 aa  227  2e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0472235  normal  0.432389 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0716  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  47.13 
 
 
289 aa  225  5.0000000000000005e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00206477 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3987  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  51.48 
 
 
249 aa  224  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.946493 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1740  SEC-independent protein translocase  47.83 
 
 
246 aa  219  5e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1668  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  45.49 
 
 
246 aa  217  1e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03838  twin arginine-targeting protein translocase TatC  46.03 
 
 
251 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.362627  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  44.49 
 
 
262 aa  206  3e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183813  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0783  Sec-independent protein translocase TatC  44.49 
 
 
262 aa  206  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.037642 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0117  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  47.48 
 
 
263 aa  205  5e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.433912 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  42.92 
 
 
259 aa  205  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.40732  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0699  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  46.38 
 
 
262 aa  203  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0118  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  45.53 
 
 
258 aa  202  4e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
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NC_007298  Daro_3373  Sec-independent protein translocase TatC  44.03 
 
 
275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008752  Aave_1055  Sec-independent protein translocase TatC  45.31 
 
 
265 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007951  Bxe_A0411  Sec-independent protein translocase TatC  41.56 
 
 
259 aa  197  9e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.856028  normal  0.682623 
 
 
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NC_010681  Bphyt_3547  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  41.56 
 
 
259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146328  hitchhiker  0.0021948 
 
 
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NC_007973  Rmet_3235  Sec-independent protein translocase TatC  43.28 
 
 
260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010551  BamMC406_0365  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  46.67 
 
 
261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.494968 
 
 
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NC_008390  Bamb_0356  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  46.67 
 
 
261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439865  n/a   
 
 
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