More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0969 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  100 
 
 		 124 aa  252  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  99.19 
 
 		 124 aa  251  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  99.19 
 
 		 124 aa  249  7e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  93.55 
 
 		 155 aa  238  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  79.03 
 
 		 124 aa  201  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  74.38 
 
 		 145 aa  193  7e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  77.57 
 
 		 122 aa  181  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  66.97 
 
 		 125 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  70.97 
 
 		 125 aa  136  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  63 
 
 		 211 aa  131  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  69.66 
 
 		 140 aa  131  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  67.02 
 
 		 199 aa  130  6.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  61.82 
 
 		 114 aa  128  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  61 
 
 		 230 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  61 
 
 		 230 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  61 
 
 		 242 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  61 
 
 		 242 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  61 
 
 		 211 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  48.76 
 
 		 127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  61 
 
 		 211 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  63.92 
 
 		 142 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  61 
 
 		 211 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12600  Rare lipoprotein A, RplA  57.41 
 
 		 123 aa  127  8.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817198  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  62.92 
 
 		 150 aa  125  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1191  rare lipoprotein A  49.58 
 
 		 137 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0103428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  57.14 
 
 		 358 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1099  rare lipoprotein A  49.58 
 
 		 137 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  62.5 
 
 		 200 aa  124  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1159  rare lipoprotein A  49.58 
 
 		 137 aa  124  6e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  60.44 
 
 		 170 aa  124  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3199  rare lipoprotein A  49.58 
 
 		 137 aa  124  6e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.476215 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  60.44 
 
 		 163 aa  123  9e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  59.34 
 
 		 171 aa  122  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  62.5 
 
 		 200 aa  122  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  58.43 
 
 		 163 aa  122  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  54.17 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  59.34 
 
 		 360 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  59.34 
 
 		 360 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  58.33 
 
 		 285 aa  120  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  55.56 
 
 		 342 aa  120  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  62.64 
 
 		 124 aa  120  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  58.7 
 
 		 165 aa  120  6e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3972  rare lipoprotein A  57.29 
 
 		 145 aa  120  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0134475  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  54.95 
 
 		 167 aa  120  6e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  53.6 
 
 		 181 aa  120  7e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  61.54 
 
 		 171 aa  120  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  56.41 
 
 		 121 aa  120  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  54.55 
 
 		 341 aa  120  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  55 
 
 		 203 aa  120  9e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  49.49 
 
 		 293 aa  119  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4116  rare lipoprotein A  55.21 
 
 		 144 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000656887  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  52.83 
 
 		 339 aa  119  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  55.56 
 
 		 332 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  55 
 
 		 203 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  60.42 
 
 		 139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  54 
 
 		 202 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  56.12 
 
 		 324 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  52.53 
 
 		 342 aa  118  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3389  rare lipoprotein A  54 
 
 		 214 aa  118  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  51.55 
 
 		 186 aa  118  3e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  54.55 
 
 		 325 aa  118  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  56.7 
 
 		 286 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  56.25 
 
 		 238 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  60.19 
 
 		 134 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  65.59 
 
 		 121 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  54.55 
 
 		 333 aa  117  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  54.55 
 
 		 333 aa  117  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  51.52 
 
 		 342 aa  117  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0121  rare lipoprotein A  58.33 
 
 		 199 aa  117  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  65.17 
 
 		 324 aa  117  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  61.46 
 
 		 367 aa  117  7e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  53.54 
 
 		 333 aa  117  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  52.58 
 
 		 163 aa  116  7.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2034  rare lipoprotein A  62.64 
 
 		 168 aa  116  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0135  rare lipoprotein A  56.25 
 
 		 122 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  58.33 
 
 		 322 aa  115  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0709  rare lipoprotein A  75 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  55.1 
 
 		 282 aa  115  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  51.55 
 
 		 335 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2367  rare lipoprotein A  56.52 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  52 
 
 		 203 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  64.84 
 
 		 335 aa  115  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  53.54 
 
 		 342 aa  115  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2925  rare lipoprotein A  47.66 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.542762  normal  0.960084 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  65.59 
 
 		 371 aa  114  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  53.61 
 
 		 257 aa  115  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  52 
 
 		 213 aa  114  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  54.08 
 
 		 259 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  51.52 
 
 		 337 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  50.53 
 
 		 265 aa  114  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  64.77 
 
 		 119 aa  114  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2820  rare lipoprotein A  52 
 
 		 213 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1489  rare lipoprotein A  55.05 
 
 		 122 aa  114  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  51.02 
 
 		 243 aa  114  6e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  49.47 
 
 		 264 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  50 
 
 		 246 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1475  rare lipoprotein A  73.75 
 
 		 124 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0060  rare lipoprotein A  46.15 
 
 		 129 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  55.91 
 
 		 262 aa  113  7.999999999999999e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2322  rare lipoprotein A  56.73 
 
 		 255 aa  113  7.999999999999999e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.260351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>