21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0776 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_0776  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  325  1e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0748  hypothetical protein  95.54 
 
 
157 aa  311  2e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0117939  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0789  hypothetical protein  91.72 
 
 
157 aa  300  5e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4441  hypothetical protein  75.16 
 
 
157 aa  248  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61450  hypothetical protein  69.23 
 
 
157 aa  224  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.428854 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5293  hypothetical protein  69.87 
 
 
157 aa  223  6e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0560  hypothetical protein  43.42 
 
 
159 aa  143  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.95108 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0732  hypothetical protein  38.16 
 
 
154 aa  120  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.136479  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3327  hypothetical protein  38.82 
 
 
154 aa  117  5e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3247  hypothetical protein  38.82 
 
 
156 aa  117  7e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2080  hypothetical protein  38.96 
 
 
158 aa  112  2e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0034  hypothetical protein  43.55 
 
 
159 aa  108  2e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1896  hypothetical protein  36.67 
 
 
165 aa  105  3e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.936352 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0620  hypothetical protein  38.56 
 
 
159 aa  103  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.573395  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0984  hypothetical protein  35.37 
 
 
160 aa  97.1  8e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.229596  normal  0.532531 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0187  hypothetical protein  34.75 
 
 
159 aa  94.7  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02633  hypothetical protein  33.11 
 
 
180 aa  95.1  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3978  hypothetical protein  32.47 
 
 
169 aa  86.7  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0248075  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0927  hypothetical protein  31.65 
 
 
156 aa  81.6  3e-15  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  5.34724e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5656  hypothetical protein  25.36 
 
 
167 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1319  O-antigen related protein  32.81 
 
 
67 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0766792  normal  0.774627 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>