110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0770 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0742  hypothetical protein  98.48 
 
 
328 aa  664    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.64643  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0770  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  100 
 
 
328 aa  672    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780127  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0783  FAD dependent oxidoreductase  98.48 
 
 
328 aa  663    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.918451  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4447  hypothetical protein  94.51 
 
 
328 aa  620  1e-176  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61600  hypothetical protein  74.01 
 
 
327 aa  510  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0728796 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5306  hypothetical protein  74.01 
 
 
327 aa  510  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1075  FAD dependent oxidoreductase  74.31 
 
 
328 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.817137 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1126  amine oxidase, flavin-containing protein  71.95 
 
 
328 aa  499  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4732  FAD dependent oxidoreductase  75.54 
 
 
328 aa  486  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.528339 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0965  amine oxidase, flavin-containing  72.56 
 
 
328 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41390  FAD dependent oxidoreductase  66.87 
 
 
329 aa  429  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.196664  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1481  FAD dependent oxidoreductase  38.44 
 
 
341 aa  209  7e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01726  lipoprotein, putative  39.14 
 
 
344 aa  205  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  42.77 
 
 
330 aa  200  3e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  40.36 
 
 
354 aa  190  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0886  putative transmembrane protein  36.34 
 
 
329 aa  186  4e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1229  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  37.98 
 
 
324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0596771  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  35.16 
 
 
843 aa  182  9.000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4301  FAD dependent oxidoreductase  37.09 
 
 
339 aa  176  5e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2285  FAD dependent oxidoreductase  35.98 
 
 
314 aa  175  8e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1655  FAD dependent oxidoreductase  34.09 
 
 
333 aa  175  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2933  FAD dependent oxidoreductase  36.18 
 
 
383 aa  171  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2903  FAD dependent oxidoreductase  36.13 
 
 
358 aa  168  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0779713  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0533  putative transmembrane protein  36.58 
 
 
343 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0999  hypothetical protein  37.19 
 
 
320 aa  163  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.277798  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1906  FAD dependent oxidoreductase  33.91 
 
 
351 aa  160  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.118317  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0049  FAD dependent oxidoreductase  33.95 
 
 
313 aa  159  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0425  putative transmembrane protein  34.81 
 
 
355 aa  155  9e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133341  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0410  putative transmembrane protein  33.83 
 
 
332 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0126834 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4048  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
407 aa  154  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0468618 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1983  FAD dependent oxidoreductase  32.36 
 
 
367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460512  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1783  FAD dependent oxidoreductase  32.36 
 
 
367 aa  134  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4982  FAD dependent oxidoreductase  31.7 
 
 
368 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3125  FAD dependent oxidoreductase  31.45 
 
 
360 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1735  hypothetical protein  30.61 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4691  FAD dependent oxidoreductase  33.13 
 
 
323 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0114981 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1151  FAD dependent oxidoreductase  30.84 
 
 
338 aa  112  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.493674  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  28.91 
 
 
346 aa  112  9e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1925  hypothetical protein  28.16 
 
 
347 aa  107  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.315657  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0204  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  27.46 
 
 
389 aa  107  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.508635  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3031  FAD dependent oxidoreductase  30.21 
 
 
369 aa  106  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1154  hypothetical protein  31.58 
 
 
337 aa  107  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177743  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1750  hypothetical protein  29.34 
 
 
313 aa  106  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0825  hypothetical protein  30.49 
 
 
316 aa  102  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0625  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  26.36 
 
 
413 aa  102  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.484917 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 
361 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4120  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  31.14 
 
 
348 aa  95.5  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254972  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0160  hypothetical protein  28.74 
 
 
319 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443199  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2015  hypothetical protein  28.93 
 
 
347 aa  94.4  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.509344 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  25.57 
 
 
359 aa  90.9  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0435  FAD dependent oxidoreductase  26.38 
 
 
347 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164811  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2190  FAD dependent oxidoreductase  26.77 
 
 
344 aa  86.7  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4414  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  27.36 
 
 
381 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288059  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4204  FAD dependent oxidoreductase  24.85 
 
 
346 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.429398 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1276  putative NAD/FAD-dependent oxidoreductase  26.1 
 
 
340 aa  83.2  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1426  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  25.38 
 
 
362 aa  80.9  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0132  hypothetical protein  26.22 
 
 
349 aa  73.9  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.751971  normal  0.181819 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39046  FAD dependent oxidoreductase precursor  25.88 
 
 
439 aa  67  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48060  predicted protein  24.82 
 
 
523 aa  65.1  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.387117  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0536  FAD dependent oxidoreductase  26.24 
 
 
342 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.84854  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0540  FAD dependent oxidoreductase  26.82 
 
 
342 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0507  FAD dependent oxidoreductase  25.95 
 
 
342 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770202  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32874  predicted protein  26.41 
 
 
484 aa  58.5  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2785  FAD dependent oxidoreductase  24.83 
 
 
335 aa  57.4  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.81235  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0027  FAD dependent oxidoreductase  27.19 
 
 
344 aa  53.5  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  34.74 
 
 
421 aa  50.1  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23230  Flavin containing amine oxidoreductase  41.43 
 
 
415 aa  50.1  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.807494  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  30.21 
 
 
456 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2164  putative amine oxidase  45.61 
 
 
537 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0082  amine oxidase  41.38 
 
 
436 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  38.46 
 
 
502 aa  47.4  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  38.46 
 
 
502 aa  47.4  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0926  amine oxidase  35.38 
 
 
435 aa  46.6  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00368983  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1381  UDP-galactopyranose mutase  33.04 
 
 
463 aa  46.2  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.399176  normal  0.525187 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1428  hypothetical protein  28.93 
 
 
381 aa  45.8  0.0009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.521801  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0845  amine oxidase  47.92 
 
 
492 aa  45.8  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  42.19 
 
 
469 aa  45.8  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2213  protoporphyrinogen oxidase  31.65 
 
 
451 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0753  amine oxidase  43.64 
 
 
410 aa  45.8  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2259  protoporphyrinogen oxidase  31.65 
 
 
451 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.685145  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2202  protoporphyrinogen oxidase  31.65 
 
 
451 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.294018  normal  0.368539 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1529  hypothetical protein  24.29 
 
 
468 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1146  hypothetical protein  24.29 
 
 
468 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  51.02 
 
 
436 aa  44.7  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0804  hypothetical protein  24.29 
 
 
468 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.230959  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  31.37 
 
 
445 aa  44.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  28.12 
 
 
482 aa  44.3  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2093  phytoene desaturase  43.64 
 
 
493 aa  44.3  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456364  decreased coverage  0.00855511 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  44.44 
 
 
479 aa  43.9  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1220  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  31.71 
 
 
487 aa  43.9  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.462072  normal  0.673117 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  29.2 
 
 
469 aa  43.9  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1579  UDP-galactopyranose mutase  30.93 
 
 
392 aa  43.5  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1885  protoporphyrinogen oxidase  38.1 
 
 
466 aa  43.1  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000633111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1919  protoporphyrinogen oxidase  38.1 
 
 
466 aa  43.1  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206772  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8301  D-nopaline dehydrogenase  44.44 
 
 
464 aa  43.5  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.909485  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  33.8 
 
 
456 aa  43.1  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  41.51 
 
 
482 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  41.51 
 
 
490 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  41.51 
 
 
482 aa  42.7  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  41.51 
 
 
485 aa  42.7  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>