More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0721 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0689  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 85 aa  170  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0721  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 85 aa  170  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.71975 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0721  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 85 aa  170  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.980566  normal  0.0233999 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4496  50S ribosomal protein L27  94.12 
 
 		 85 aa  161  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.191975  normal  0.508112 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4859  50S ribosomal protein L27  91.76 
 
 		 85 aa  156  8e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3681  50S ribosomal protein L27  89.41 
 
 		 85 aa  152  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0798  ribosomal protein L27  89.16 
 
 		 91 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0702  50S ribosomal protein L27  89.16 
 
 		 91 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.616074 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5207  50S ribosomal protein L27  82.35 
 
 		 85 aa  148  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121929  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60450  50S ribosomal protein L27  82.35 
 
 		 85 aa  148  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0112062 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40780  50S ribosomal protein L27  81.18 
 
 		 85 aa  144  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4237  50S ribosomal protein L27  76.47 
 
 		 85 aa  134  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000765087  hitchhiker  0.00000018706 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0475  50S ribosomal protein L27  74.12 
 
 		 85 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0828621  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0892  50S ribosomal protein L27  72.94 
 
 		 85 aa  128  3e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0670599 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1009  50S ribosomal protein L27  74.12 
 
 		 85 aa  128  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000911893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0526  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 		 85 aa  128  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0856  50S ribosomal protein L27  74.12 
 
 		 86 aa  127  5.0000000000000004e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.701213  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0846  50S ribosomal protein L27  74.39 
 
 		 86 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3207  ribosomal protein L27  70.59 
 
 		 85 aa  124  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1572  50S ribosomal protein L27  71.76 
 
 		 85 aa  124  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.355414  normal  0.759943 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1754  50S ribosomal protein L27  71.76 
 
 		 85 aa  124  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.163114  normal  0.0575884 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  73.49 
 
 		 85 aa  124  5e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3621  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 85 aa  123  8.000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000351057  normal  0.260967 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0246  50S ribosomal protein L27  72.62 
 
 		 85 aa  123  8.000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000945082  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3662  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 85 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.0000324123  normal  0.0701159 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3493  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 85 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310399  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001672  LSU ribosomal protein L27p  73.81 
 
 		 85 aa  122  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000226464  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0284  50S ribosomal protein L27  70.59 
 
 		 86 aa  122  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.349085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0461  50S ribosomal protein L27  70.59 
 
 		 86 aa  122  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297252 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3564  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 85 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3600  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 85 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00592088  normal  0.834432 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3495  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 85 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000222447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00801  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 		 85 aa  122  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3478  ribosomal protein L27  72.62 
 
 		 85 aa  122  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000653762  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3359  ribosomal protein L27  72.62 
 
 		 85 aa  122  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000421163  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0362  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 		 85 aa  122  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000249852  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2854  50S ribosomal protein L27  71.76 
 
 		 86 aa  121  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000234792  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0865  50S ribosomal protein L27  71.95 
 
 		 87 aa  121  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3322  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 84 aa  120  6e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000182867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1070  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 84 aa  120  6e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000153229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1037  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 84 aa  120  6e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000911721  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0968  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 84 aa  120  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000160226  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3651  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 84 aa  120  7e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2006  ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 86 aa  120  7e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.962508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0896  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 84 aa  120  7e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3124  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 84 aa  120  7e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000107863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3218  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 84 aa  120  7e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0980  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 84 aa  120  7e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000110997  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2828  50S ribosomal protein L27  71.95 
 
 		 84 aa  120  8e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000113295  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0870  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 84 aa  120  9e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000545576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2926  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 84 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000309766  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0559  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 85 aa  119  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00191418  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3737  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 85 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000346028  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3088  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 84 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0853  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 84 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152445  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03050  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 85 aa  118  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00726587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0522  ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 85 aa  118  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000023922  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2247  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 85 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000479005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03001  hypothetical protein  69.05 
 
 		 85 aa  118  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0066535  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3756  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 85 aa  118  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000137777  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3611  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 85 aa  118  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000711047  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0515  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 85 aa  118  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000794781  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3481  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 85 aa  118  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000491459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3670  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 85 aa  118  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000967389  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4507  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 85 aa  118  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000060246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3585  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 85 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000250774  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1005  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 84 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000876711  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0955  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 84 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.455715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3975  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 85 aa  118  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000219143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3378  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 85 aa  118  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.4045e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3471  50S ribosomal protein L27  70.59 
 
 		 87 aa  118  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00282639  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0794  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 85 aa  118  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000203934  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3525  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 87 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.986116  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2522  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 87 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.587643  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3523  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 87 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.122565  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1304  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 87 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1141  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 87 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3489  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 87 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.562103  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0445  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 87 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3259  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 87 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0474  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 85 aa  117  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000537628  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4511  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 85 aa  117  4.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1632  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 87 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.848306  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3066  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 86 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0552  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 87 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000367957  normal  0.045539 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3667  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 87 aa  117  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000345306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2656  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 86 aa  117  6e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0134308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0510  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 87 aa  117  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0309377  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0100  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 87 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00352754  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03730  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 85 aa  117  6e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00000322672  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0485  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 87 aa  117  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0162621  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0582  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 87 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00040366  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2801  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 87 aa  117  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000884705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1847  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 85 aa  117  7e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2821  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 86 aa  116  9e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000571878  normal  0.308516 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2703  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 92 aa  115  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2575  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 92 aa  115  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1816  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0508  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 87 aa  114  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.868007  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 95 aa  115  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>