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for query gene Pput_0628 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  100 
 
 
393 aa  760    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  100 
 
 
393 aa  760    Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  93.64 
 
 
393 aa  700    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  97.96 
 
 
393 aa  726    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  81.7 
 
 
401 aa  629  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  78.88 
 
 
398 aa  619  1e-176  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  79.49 
 
 
398 aa  610  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  70.84 
 
 
392 aa  551  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  70.84 
 
 
392 aa  552  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0827  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  67.18 
 
 
389 aa  473  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10090  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  65.34 
 
 
392 aa  457  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0442276  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0749  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  49.58 
 
 
498 aa  330  3e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471391  normal  0.544805 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  48.17 
 
 
426 aa  317  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4036  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  48.79 
 
 
406 aa  305  8.000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0571  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  48.59 
 
 
399 aa  301  2e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0910669  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  44.57 
 
 
407 aa  293  5e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  44.56 
 
 
414 aa  291  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2375  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  42.67 
 
 
394 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.525477 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1975  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  42.42 
 
 
394 aa  289  6e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  48.21 
 
 
424 aa  288  9e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  45.38 
 
 
412 aa  282  7.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  43.91 
 
 
412 aa  281  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  43.92 
 
 
424 aa  272  6e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  44.39 
 
 
411 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.98 
 
 
409 aa  264  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2625  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  44.67 
 
 
403 aa  263  3e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0109  conserved hypothetical protein, putative drug resistance transporter, Bcr/CflA family  37.67 
 
 
413 aa  262  6.999999999999999e-69  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456469  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.73 
 
 
400 aa  261  1e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.46 
 
 
418 aa  257  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  40.76 
 
 
399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  40.05 
 
 
399 aa  254  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.13 
 
 
403 aa  253  3e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  38.1 
 
 
426 aa  252  7e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.62 
 
 
400 aa  251  1e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.02 
 
 
409 aa  250  3e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  43.44 
 
 
412 aa  249  5e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  41.71 
 
 
392 aa  247  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5119  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  42.09 
 
 
416 aa  247  3e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.23 
 
 
405 aa  247  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0167  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.89 
 
 
398 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2001  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  43.17 
 
 
412 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0443671  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.63 
 
 
410 aa  246  6e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0848  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  43.78 
 
 
404 aa  245  8e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.48 
 
 
417 aa  245  9e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0383  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  43.19 
 
 
419 aa  244  9.999999999999999e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0372929 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.17 
 
 
405 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.97 
 
 
405 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0349  major facilitator superfamily multi-drug efflux pump  42.9 
 
 
419 aa  243  3.9999999999999997e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.7 
 
 
405 aa  242  7e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.7 
 
 
458 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.7 
 
 
434 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.7 
 
 
405 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  42.03 
 
 
396 aa  240  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4137  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.54 
 
 
409 aa  239  4e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0321092  normal  0.661568 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2346  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  42.63 
 
 
408 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0202  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.84 
 
 
419 aa  239  8e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0183  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.05 
 
 
416 aa  239  8e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000244367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0181  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.05 
 
 
416 aa  239  8e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0226  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  41.1 
 
 
416 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1841  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.87 
 
 
418 aa  238  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0170  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.53 
 
 
419 aa  238  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000813415  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0202  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  40.79 
 
 
416 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20220  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  40.16 
 
 
415 aa  238  1e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.179817 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  43.9 
 
 
414 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.53 
 
 
416 aa  238  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181141  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  36.83 
 
 
420 aa  238  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  40.27 
 
 
404 aa  237  3e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0206  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  40.53 
 
 
416 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.993392  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.95 
 
 
400 aa  236  7e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0389  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.13 
 
 
404 aa  235  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000107544  unclonable  0.00000000056227 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  43.17 
 
 
402 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3614  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  43.1 
 
 
407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3365  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.91 
 
 
436 aa  233  5e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139638  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1602  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.32 
 
 
408 aa  232  9e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.940845 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.88 
 
 
411 aa  232  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.241483 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1775  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.5 
 
 
403 aa  232  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394194  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.09 
 
 
405 aa  231  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.5 
 
 
411 aa  230  4e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0624  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.99 
 
 
402 aa  229  9e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1867  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  43.56 
 
 
406 aa  229  9e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.960562  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3262  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.18 
 
 
414 aa  228  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.35835  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0216  transport transmembrane protein  37.88 
 
 
409 aa  228  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1599  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  41.62 
 
 
384 aa  227  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22050  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  41.22 
 
 
437 aa  227  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.977582  normal  0.972538 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6143  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  40.76 
 
 
420 aa  226  7e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2049  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.32 
 
 
435 aa  225  8e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1982  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.94 
 
 
416 aa  225  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5989  sugar (and other) transporter  42.62 
 
 
411 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.291494  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1958  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  40.39 
 
 
437 aa  223  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00219492  hitchhiker  0.00000496056 
 
 
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NC_012912  Dd1591_3852  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.38 
 
 
407 aa  223  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.64308  n/a   
 
 
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NC_011989  Avi_3518  MFS permease  36.29 
 
 
401 aa  223  4e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009380  Strop_3036  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.74 
 
 
414 aa  223  4e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.340151 
 
 
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NC_007951  Bxe_A0898  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  38.79 
 
 
416 aa  223  6e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011365  Gdia_1854  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.19 
 
 
412 aa  222  9e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.888494  normal 
 
 
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NC_011145  AnaeK_3306  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  41.12 
 
 
404 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.837847  n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_003780  permease  39.47 
 
 
400 aa  220  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.142338  n/a   
 
 
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NC_014158  Tpau_1659  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.69 
 
 
398 aa  220  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_3096  major facilitator transporter  37.77 
 
 
411 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_1767  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.4 
 
 
397 aa  218  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009074  BURPS668_3008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.5 
 
 
411 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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