33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0576 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0576  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.664353  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0537  transcriptional regulator, putative  96.57 
 
 		 278 aa  461  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0582  transcriptional regulator  87.5 
 
 		 233 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.794333 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0589  transcriptional regulator  67.67 
 
 		 233 aa  322  3e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0623  peptidase S24, S26A and S26B  42.19 
 
 		 243 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0721  transcriptional regulator, putative  41.77 
 
 		 243 aa  186  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4997  transcriptional regulator  37.34 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  31.98 
 
 		 256 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  30.46 
 
 		 256 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  27.97 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  25.97 
 
 		 259 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  27.12 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  25.52 
 
 		 243 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  31.62 
 
 		 229 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  25.32 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2990  prophage LambdaSo, Cro/CI family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2563  putative phage repressor  31.62 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  30.88 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  25.82 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  27.94 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  30.15 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  27.94 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  27.94 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  24.9 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1135  phage repressor  31.58 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  24.26 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  24.26 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  23.9 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4049  putative phage repressor  29.82 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00309972  hitchhiker  0.0000000001929 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1875  putative phage repressor  25 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3211  putative phage repressor  32.35 
 
 		 248 aa  47  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.02032 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1011  putative phage repressor  24.11 
 
 		 218 aa  47  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.763396  unclonable  0.00000301408 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3749  hypothetical protein  36.36 
 
 		 210 aa  41.6  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>