10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0472 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0472  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  285  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000830985  normal  0.0146685 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0439  hypothetical protein  97.16 
 
 		 154 aa  253  5e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000459183  unclonable  0.000000225098 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0469  hypothetical protein  94.33 
 
 		 141 aa  245  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.101572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4764  hypothetical protein  85.82 
 
 		 141 aa  229  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000255391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4562  hypothetical protein  52.08 
 
 		 142 aa  130  9e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00149977  normal  0.65254 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0612  hypothetical protein  51.41 
 
 		 142 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.653535  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5094  hypothetical protein  50.34 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000148168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08640  hypothetical protein  49.06 
 
 		 234 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000854998  hitchhiker  0.000197864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0818  hypothetical protein  44.23 
 
 		 234 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349242  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3924  sporulation domain-containing protein  51.58 
 
 		 225 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>