105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0452 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0418  GDSL family lipase  98.09 
 
 
629 aa  1253    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0624363  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0569  autotransporting lipase, GDSL family  59.72 
 
 
640 aa  748    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4606  Outer membrane autotransporter barrel  59.09 
 
 
640 aa  734    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310199  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5117  Outer membrane autotransporter barrel  60.58 
 
 
636 aa  736    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67510  esterase EstA  60.46 
 
 
646 aa  757    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00791226  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0452  outer membrane autotransporter  100 
 
 
629 aa  1274    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5845  esterase EstA  61.78 
 
 
646 aa  751    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0449  outer membrane autotransporter  90.22 
 
 
626 aa  1135    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.616315  normal  0.432339 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4784  outer membrane autotransporter  88.24 
 
 
629 aa  1127    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.336852 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2645  outer membrane autotransporter  26.9 
 
 
630 aa  154  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3188  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.85 
 
 
617 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01843  lipase; esterase  27.72 
 
 
594 aa  141  3.9999999999999997e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0065  outer membrane autotransporter  26.64 
 
 
662 aa  138  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2327  outer membrane autotransporter  24.81 
 
 
628 aa  137  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.542072 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1985  outer membrane autotransporter  25.88 
 
 
597 aa  134  3.9999999999999996e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0877  Outer membrane autotransporter barrel  25.81 
 
 
628 aa  133  7.999999999999999e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2063  lipase/esterase  25.38 
 
 
597 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0682  lipase 1  26.35 
 
 
656 aa  114  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.668862  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0616  lipase 1  26.35 
 
 
656 aa  114  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0623  lipase 1  26.5 
 
 
656 aa  114  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0738  lipase 1  25.93 
 
 
584 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1186  lipolytic protein  30.86 
 
 
337 aa  92.4  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0761  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.03 
 
 
629 aa  84.3  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3849  Outer membrane autotransporter barrel  23.73 
 
 
684 aa  84  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0448048  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4652  Outer membrane autotransporter barrel  23.45 
 
 
664 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3183  lipolytic protein  28.7 
 
 
349 aa  82  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0162266 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0756  Outer membrane autotransporter barrel  27.51 
 
 
647 aa  81.6  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.745695 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3239  Phosphatidylcholine--sterol O-acyltransferase  30.26 
 
 
288 aa  81.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.579995  normal  0.0847319 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0319  lipolytic protein G-D-S-L family  31.45 
 
 
329 aa  80.9  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0326  lipolytic protein G-D-S-L family  31.45 
 
 
329 aa  80.9  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0915  outer membrane autotransporter  26.33 
 
 
658 aa  80.1  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1770  lipolytic protein  27.54 
 
 
319 aa  79.3  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.949793  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1266  Outer membrane autotransporter  21.6 
 
 
684 aa  75.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.384296 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2331  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.81 
 
 
330 aa  73.9  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.622531  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0488  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.87 
 
 
774 aa  71.2  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4377  outer membrane autotransporter barrel domain protein  20.64 
 
 
641 aa  70.5  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3764  putative esterase/lipase/outer membrane autotransporter  24.23 
 
 
723 aa  69.3  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216349  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0620  Outer membrane autotransporter barrel  28.52 
 
 
759 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.553237 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5638  Outer membrane autotransporter barrel  31.37 
 
 
488 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190969  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3229  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.65 
 
 
418 aa  63.9  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0911391  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4161  putative esterase/lipase/outer membrane autotransporter  22.66 
 
 
607 aa  62.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.930949  normal  0.682493 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2377  protein tyrosine/serine phosphatase  27.97 
 
 
636 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  24.51 
 
 
816 aa  61.6  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0714  autotransporter, putative  27.38 
 
 
763 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0104  GDSL family lipase  27.13 
 
 
268 aa  60.5  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1039  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.73 
 
 
1865 aa  59.3  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.429609  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1722  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.73 
 
 
1842 aa  59.3  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0890877 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0855  lipolytic protein G-D-S-L family  25.08 
 
 
284 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0584  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.73 
 
 
2302 aa  58.9  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.212067  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1283  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.73 
 
 
3015 aa  58.9  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1723  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.73 
 
 
1953 aa  58.5  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0576481  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2264  lysophospholipase A  22.94 
 
 
309 aa  57.4  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0580  putative lipase / esterase protein  27.99 
 
 
347 aa  57.4  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1194  autotransporter domain-containing protein  23.02 
 
 
1068 aa  57.4  0.0000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.170523 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0299  putative lipase / esterase protein  26.24 
 
 
353 aa  57.4  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.151241  normal  0.0780281 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3285  lipase  23.79 
 
 
317 aa  57.4  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.195379  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2291  lysophospholipase A  22.94 
 
 
309 aa  56.6  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1537  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.33 
 
 
3152 aa  56.6  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2238  putative Outer membrane autotransporter protein  27.11 
 
 
1025 aa  55.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.669565  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4267  outer membrane autotransporter  25.34 
 
 
939 aa  55.5  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  26.13 
 
 
3954 aa  54.3  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.48 
 
 
913 aa  54.3  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3436  PEP motif-containing protein  29.37 
 
 
310 aa  54.3  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4565  lipase  24.44 
 
 
316 aa  53.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  24.88 
 
 
4238 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  29.03 
 
 
1222 aa  53.1  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  29.61 
 
 
3506 aa  52  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3937  lipase  23.47 
 
 
317 aa  52.4  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  24.88 
 
 
4238 aa  51.6  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1877  protein tyrosine/serine phosphatase  27.97 
 
 
637 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.880378 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  24.88 
 
 
3822 aa  51.2  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  32.3 
 
 
985 aa  50.8  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3162  putative hemagglutinin-related protein  24.44 
 
 
1012 aa  50.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0947  putative autotransporter protein  21.84 
 
 
728 aa  50.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3276  hypothetical protein  21.84 
 
 
728 aa  50.1  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.393702  hitchhiker  0.00000976174 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0998  outer membrane autotransporter  21.84 
 
 
728 aa  50.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1704  lipolytic enzyme, G-D-S-L family protein  25.14 
 
 
341 aa  49.7  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.135355  normal  0.0632285 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1491  lipolytic protein G-D-S-L family  28.26 
 
 
372 aa  48.9  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.530351  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  26.67 
 
 
1119 aa  48.1  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3385  outer membrane autotransporter  23.11 
 
 
972 aa  48.1  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.02 
 
 
1227 aa  48.1  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0485  lipolytic protein G-D-S-L family  26.42 
 
 
347 aa  48.1  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2640  hypothetical protein  27.93 
 
 
516 aa  47.8  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  27.07 
 
 
1011 aa  47.4  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2510  hypothetical protein  27.93 
 
 
516 aa  47.4  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1082  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.67 
 
 
915 aa  47.4  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2313  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like  20.93 
 
 
340 aa  46.6  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0175563 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1155  autotransporter domain-containing protein  22.66 
 
 
1677 aa  46.6  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  24.27 
 
 
1369 aa  46.6  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2717  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.64 
 
 
877 aa  47  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1005  lipase  27.16 
 
 
379 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6375  lipolytic protein  25.81 
 
 
454 aa  45.8  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.804625  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0841  hypothetical protein  27.16 
 
 
379 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.682529  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0846  hypothetical protein  27.16 
 
 
379 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0304  hypothetical protein  26.92 
 
 
379 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.882729  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0599  hypothetical protein  26.92 
 
 
379 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2433  hypothetical protein  26.92 
 
 
379 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0046  hypothetical protein  26.92 
 
 
379 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.354332  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  29.79 
 
 
986 aa  45.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04290  hypothetical protein  26.04 
 
 
647 aa  45.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00560134  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>