More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0432 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0398  thiosulfate sulfurtransferase  100 
 
 		 110 aa  229  9e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0432  thiosulfate sulfurtransferase  100 
 
 		 110 aa  229  9e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.822865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0429  thiosulfate sulfurtransferase  95.45 
 
 		 110 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0835156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4804  thiosulfate sulfurtransferase  90.91 
 
 		 109 aa  205  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.598839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4016  thiosulfate sulfurtransferase  78.18 
 
 		 109 aa  183  6e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4630  thiosulfate sulfurtransferase  78.5 
 
 		 106 aa  179  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5138  thiosulfate sulfurtransferase  76.36 
 
 		 109 aa  179  9.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.945855  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0548  rhodanese-like domain protein  76.64 
 
 		 106 aa  174  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07690  thiosulfate sulfurtransferase  74.77 
 
 		 110 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0582831 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0733  thiosulfate sulfurtransferase  72.9 
 
 		 110 aa  168  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46860  thiosulfate sulfurtransferase  69.72 
 
 		 112 aa  162  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4128  Thiosulfate sulfurtransferase  56.73 
 
 		 107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.801099  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3931  Thiosulfate sulfurtransferase  56.73 
 
 		 107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0289  Thiosulfate sulfurtransferase  55.14 
 
 		 106 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0229  Thiosulfate sulfurtransferase  50.47 
 
 		 106 aa  122  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.369653  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4733  thiosulfate sulfurtransferase  51.4 
 
 		 108 aa  120  9e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0289  thiosulfate sulfurtransferase  50.47 
 
 		 108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03276  thiosulfate sulfurtransferase  50.47 
 
 		 108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.757846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0289  Rhodanese domain protein  50.47 
 
 		 108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3995  thiosulfate sulfurtransferase  54.81 
 
 		 109 aa  117  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3901  thiosulfate sulfurtransferase  50.47 
 
 		 108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0159  thiosulfate sulfurtransferase  54.81 
 
 		 109 aa  117  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3755  thiosulfate sulfurtransferase  54.81 
 
 		 109 aa  117  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03228  hypothetical protein  50.47 
 
 		 108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.801313  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3705  thiosulfate sulfurtransferase  50.47 
 
 		 108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3622  thiosulfate sulfurtransferase  50.47 
 
 		 108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4638  thiosulfate sulfurtransferase  52.88 
 
 		 108 aa  117  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3807  thiosulfate sulfurtransferase  50.47 
 
 		 108 aa  116  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3834  thiosulfate sulfurtransferase  50 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0925193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3940  rhodanese domain-containing protein  54.64 
 
 		 102 aa  114  5e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00983264  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4482  rhodanese domain-containing protein  51.55 
 
 		 101 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0767225  normal  0.0196392 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0056  rhodanese domain-containing protein  51.55 
 
 		 101 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000464911  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4342  rhodanese domain-containing protein  51.55 
 
 		 101 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00306912  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4287  Rhodanese domain protein  51.55 
 
 		 101 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.137948  hitchhiker  0.000000372785 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3903  rhodanese domain-containing protein  51.55 
 
 		 123 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00219695  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3726  thiosulfate sulfurtransferase  47.66 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3833  thiosulfate sulfurtransferase  47.66 
 
 		 108 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.851697 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3895  thiosulfate sulfurtransferase  47.66 
 
 		 108 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3717  thiosulfate sulfurtransferase  47.66 
 
 		 108 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3902  rhodanese domain-containing protein  51.55 
 
 		 101 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000421055  normal  0.492067 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3792  thiosulfate sulfurtransferase  47.66 
 
 		 108 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.332585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2416  thiosulfate sulfurtransferase  50.94 
 
 		 106 aa  110  5e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293751  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0063  thiosulfate sulfurtransferase  48.51 
 
 		 106 aa  110  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4672  glpE protein  51.55 
 
 		 101 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4106  rhodanese domain-containing protein  51.55 
 
 		 101 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000617215  normal  0.479241 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0096  glpE protein  52.53 
 
 		 103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00139877  normal  0.0140048 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0122  thiosulfate sulfurtransferase  50.49 
 
 		 108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00276  thiosulfate sulfurtransferase  51.96 
 
 		 106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3994  rhodanese domain-containing protein  50.52 
 
 		 101 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000232889  normal  0.0196861 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2899  thiosulfate sulfurtransferase  48.11 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.105523  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002142  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  51.96 
 
 		 106 aa  106  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000271125  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0099  rhodanese domain-containing protein  48.98 
 
 		 102 aa  105  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.973774  normal  0.0985137 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0923  rhodanese-like protein  58.75 
 
 		 110 aa  103  7e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0562249  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3711  rhodanese domain-containing protein  49.5 
 
 		 101 aa  103  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0105  rhodanese domain-containing protein  47.96 
 
 		 102 aa  102  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294035  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0063  rhodanese domain-containing protein  45 
 
 		 102 aa  100  7e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00465337  unclonable  0.0000000104645 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0701  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  44.76 
 
 		 107 aa  100  8e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.6297700000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3617  rhodanese-like protein  47.42 
 
 		 102 aa  99.4  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000690475  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0337  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase (rhodanese)  45.36 
 
 		 100 aa  97.1  8e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1048  rhodanese domain-containing protein  46.15 
 
 		 106 aa  94.7  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00818929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0160  thiosulfate sulfurtransferase  41.9 
 
 		 158 aa  87.4  6e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.460236  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1220  Rhodanese domain protein  40.78 
 
 		 260 aa  87  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000562605 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1502  ankyrin repeat protein/rhodanese-like domain protein  40.78 
 
 		 260 aa  87  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00068  glpE protein  46.67 
 
 		 103 aa  86.7  9e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0147  rhodanese domain-containing protein  42.31 
 
 		 263 aa  85.1  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0469  rhodanese domain-containing protein  39.8 
 
 		 272 aa  83.6  9e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  40.62 
 
 		 656 aa  83.6  9e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2170  putative thiosulfate sulfurtransferase  42.86 
 
 		 245 aa  79  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2117  rhodanese-like domain/ankyrin repeat-containing protein  40 
 
 		 254 aa  74.3  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  37.86 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1458  rhodanese-like protein  36.26 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  39.13 
 
 		 282 aa  68.2  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 102 aa  67.8  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4022  rhodanese-like protein  40.86 
 
 		 102 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.203152  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  37.5 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  36.08 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  36.84 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  34.44 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  36.59 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  36.84 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  36.36 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  36.08 
 
 		 278 aa  64.3  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2044  Rhodanese domain protein  35.79 
 
 		 114 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  36.84 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  31 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  38.89 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0047  rhodanese-like protein  32.98 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  36.84 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  32.35 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  37.66 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0134  Rhodanese domain protein  36.08 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.410653 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  34.02 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4164  Rhodanese domain protein  38.71 
 
 		 102 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.741744  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48690  Rhodanese-like protein with Ankyrin repeat  35.35 
 
 		 261 aa  61.6  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4138  Rhodanese domain protein  38.71 
 
 		 102 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  32.18 
 
 		 229 aa  61.2  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  32.41 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>