43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0369 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0369  lipopolysaccharide kinase  100 
 
 		 268 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0344  lipopolysaccharide kinase  99.63 
 
 		 268 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.048106  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0372  lipopolysaccharide kinase  97.39 
 
 		 268 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.982942  normal  0.29184 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4859  lipopolysaccharide kinase  93.66 
 
 		 268 aa  521  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.59895 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0468  lipopolysaccharide kinase  85.82 
 
 		 268 aa  481  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0523  lipopolysaccharide kinase  82.84 
 
 		 268 aa  461  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0582  lipopolysaccharide kinase  83.02 
 
 		 265 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0422457 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5000  lipopolysaccharide core biosynthesis protein WaaP  82.09 
 
 		 268 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66220  lipopolysaccharide kinase WaaP  79.85 
 
 		 268 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5744  lipopolysaccharide kinase WaaP  79.85 
 
 		 268 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.867323  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44830  Lipopolysaccharide kinase  75.29 
 
 		 271 aa  414  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.83472  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5000  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaP  58.3 
 
 		 265 aa  316  2e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.120387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0081  lipopolysaccharide kinase  58.3 
 
 		 265 aa  316  3e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.382008  hitchhiker  0.000743328 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4131  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaP  58.3 
 
 		 265 aa  316  3e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00183874  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3839  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaP  57.92 
 
 		 265 aa  315  3e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000421355  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4055  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaP  58.3 
 
 		 265 aa  316  3e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03439  hypothetical protein  58.3 
 
 		 265 aa  315  4e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03487  kinase that phosphorylates core heptose of lipopolysaccharide  58.3 
 
 		 268 aa  315  4e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3965  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaP  57.92 
 
 		 265 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0509856  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0075  lipopolysaccharide kinase  56.7 
 
 		 265 aa  311  7.999999999999999e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4108  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  54.83 
 
 		 265 aa  301  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.184564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4001  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  54.83 
 
 		 265 aa  301  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00922523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4046  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaP  54.44 
 
 		 265 aa  299  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.710683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3938  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaP  54.44 
 
 		 265 aa  299  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3920  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaP  54.05 
 
 		 265 aa  296  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.773448  hitchhiker  0.00444896 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0755  lipopolysaccharide kinase  46.69 
 
 		 278 aa  233  3e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0921452 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0318  lipopolysaccharide kinase  41.7 
 
 		 287 aa  205  6e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2794  lipopolysaccharide kinase  43.14 
 
 		 286 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.329017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1275  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  38.66 
 
 		 278 aa  179  5.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1265  putative LPS biosynthesis enzyme  33.2 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0901  lipopolysaccharide kinase  32.98 
 
 		 268 aa  84  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5743  hypothetical protein  29.01 
 
 		 244 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.744614  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66210  hypothetical protein  29.01 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0469  lipopolysaccharide core biosynthesis protein, putative  28.77 
 
 		 244 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.365356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0524  lipopolysaccharide kinase  29.91 
 
 		 244 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4999  lipopolysaccharide core biosynthesis protein, putative  29.46 
 
 		 244 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1364  lipopolysaccharide kinase  28.19 
 
 		 253 aa  48.5  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44820  lipopolysaccharide kinase  27.38 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47028  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4858  lipopolysaccharide kinase  28.66 
 
 		 244 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2479  lipopolysaccharide kinase  24.63 
 
 		 234 aa  43.5  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.274981  normal  0.508504 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2498  hypothetical protein  24.49 
 
 		 415 aa  43.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0464385  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0525  lipopolysaccharide kinase  22.04 
 
 		 259 aa  42.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0345  lipopolysaccharide kinase  29.27 
 
 		 244 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>