14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0320 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0320  Ricin B lectin  100 
 
 		 565 aa  1182    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325605  normal  0.136179 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4908  hypothetical protein  41.16 
 
 		 535 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.822853  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0300  metallopeptidase, putative  37.56 
 
 		 528 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.292389  hitchhiker  0.00022418 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0815  peptidyl-Asp metalloendopeptidase  30.43 
 
 		 417 aa  127  8.000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2257  peptidyl-Asp metalloendopeptidase  24.44 
 
 		 390 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.251039  normal  0.490974 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3429  MAM protein  26.49 
 
 		 1027 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1835  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  27.1 
 
 		 2062 aa  67  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28100  hypothetical protein  28.65 
 
 		 602 aa  57.4  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2446  hypothetical protein  29.21 
 
 		 599 aa  57  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0772125  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4897  hypothetical protein  30 
 
 		 447 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4162  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  29.85 
 
 		 596 aa  53.5  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3927  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  27.55 
 
 		 465 aa  53.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2081  hypothetical protein  25.66 
 
 		 560 aa  53.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0017  hypothetical protein  25.82 
 
 		 630 aa  49.7  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>