More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0304 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0304  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  678    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192287 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0309  hypothetical protein  95.02 
 
 		 326 aa  640    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420571  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4924  hypothetical protein  91.88 
 
 		 331 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000671683 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0218  hypothetical protein  83.83 
 
 		 357 aa  532  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01730  hypothetical protein  87.41 
 
 		 298 aa  518  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0103063  normal  0.483581 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2425  hypothetical protein  75.1 
 
 		 340 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.832144  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0766  hypothetical protein  74.7 
 
 		 336 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.08603  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1835  hypothetical protein  73.9 
 
 		 340 aa  401  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0409  hypothetical protein  73.09 
 
 		 338 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2513  protein of unknown function DUF344  71.6 
 
 		 405 aa  393  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197532  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0751  protein of unknown function DUF344  64.98 
 
 		 314 aa  387  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000230323  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0141  hypothetical protein  69.65 
 
 		 393 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16850  hypothetical protein  69.08 
 
 		 329 aa  382  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.502638  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1846  hypothetical protein  69.6 
 
 		 297 aa  384  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.259888  normal  0.104135 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4684  hypothetical protein  66.79 
 
 		 367 aa  376  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2217  hypothetical protein  66.42 
 
 		 391 aa  375  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.326652 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1113  hypothetical protein  66.02 
 
 		 364 aa  375  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739002  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1858  hypothetical protein  67.83 
 
 		 375 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0434  hypothetical protein  69.65 
 
 		 372 aa  370  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778819 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1833  hypothetical protein  65.62 
 
 		 263 aa  368  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.795184  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0324  hypothetical protein  60.92 
 
 		 369 aa  369  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000113156 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1162  hypothetical protein  67.07 
 
 		 365 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03430  hypothetical protein  58.7 
 
 		 314 aa  366  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0906844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2934  hypothetical protein  65.75 
 
 		 318 aa  364  1e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.367284 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4762  hypothetical protein  65.87 
 
 		 383 aa  363  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1910  hypothetical protein  65.23 
 
 		 324 aa  362  4e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6987  protein of unknown function DUF344  65.25 
 
 		 327 aa  360  2e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.839871 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3838  protein of unknown function DUF344  65.49 
 
 		 310 aa  358  5e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0123  protein of unknown function DUF344  63.85 
 
 		 296 aa  358  6e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.30296 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0730  protein of unknown function DUF344  65.73 
 
 		 316 aa  352  4e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0772  hypothetical protein  66.13 
 
 		 303 aa  352  4e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal  0.621258 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0187  protein of unknown function DUF344  63.57 
 
 		 296 aa  352  7e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.520088  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09420  hypothetical protein  63.71 
 
 		 304 aa  340  2.9999999999999998e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0791  hypothetical protein  65.59 
 
 		 294 aa  339  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.763019 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0796  hypothetical protein  65.59 
 
 		 294 aa  339  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0811  hypothetical protein  65.59 
 
 		 294 aa  339  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242825  normal  0.0896484 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24090  hypothetical protein  62.5 
 
 		 301 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160014  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3681  protein of unknown function DUF344  62.5 
 
 		 311 aa  335  5e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.153491  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1900  protein of unknown function DUF344  60.94 
 
 		 328 aa  333  2e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.276444  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19510  hypothetical protein  62.1 
 
 		 296 aa  332  5e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.150154  normal  0.0265241 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0172  protein of unknown function DUF344  62.35 
 
 		 310 aa  332  6e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3897  protein of unknown function DUF344  63.16 
 
 		 299 aa  322  4e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000198104  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1381  hypothetical protein  53.21 
 
 		 289 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01037  hypothetical protein  58.47 
 
 		 256 aa  305  8.000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1356  protein of unknown function DUF344  59.23 
 
 		 293 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.442869  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0117  hypothetical protein  56.33 
 
 		 300 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.249433 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4669  protein of unknown function DUF344  60.71 
 
 		 320 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.320669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13261  transcriptional regulatory protein pvdS  52.21 
 
 		 295 aa  299  6e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.422206 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2784  protein of unknown function DUF344  60.09 
 
 		 276 aa  297  2e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.669041  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0176  protein of unknown function DUF344  53.75 
 
 		 293 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0345368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4701  hypothetical protein  62.67 
 
 		 285 aa  296  3e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.44507  decreased coverage  0.00228171 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1595  putative polyphosphate kinase 2  51.07 
 
 		 289 aa  295  6e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560788  normal  0.483146 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004376  hypothetical protein  62.38 
 
 		 258 aa  294  1e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.106116  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0166  protein of unknown function DUF344  53.04 
 
 		 293 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.134346 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2353  hypothetical protein  55.02 
 
 		 294 aa  292  6e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146636  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0707  hypothetical protein  59.73 
 
 		 293 aa  290  2e-77  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0146  hypothetical protein  56.36 
 
 		 288 aa  290  2e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.805007 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1708  protein of unknown function DUF344  55.32 
 
 		 281 aa  288  8e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000362162  normal  0.0572402 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0497  hypothetical protein  54.55 
 
 		 294 aa  287  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1088  PvdS  60 
 
 		 276 aa  287  1e-76  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186123  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0262  hypothetical protein  58.48 
 
 		 258 aa  287  2e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.322774  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0013  hypothetical protein  51.71 
 
 		 299 aa  285  8e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0814  hypothetical protein  54.07 
 
 		 292 aa  285  1.0000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0703207  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2784  hypothetical protein  55.74 
 
 		 269 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.36222  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1884  hypothetical protein  56.12 
 
 		 284 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0550  hypothetical protein  59.64 
 
 		 316 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3148  hypothetical protein  60 
 
 		 305 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4178  hypothetical protein  55.88 
 
 		 324 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.622827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1274  hypothetical protein  58.37 
 
 		 305 aa  281  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0286  polyphosphate kinase 2 family protein  57.73 
 
 		 513 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.520623  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14980  hypothetical protein  53.33 
 
 		 305 aa  280  3e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2997  hypothetical protein  58.3 
 
 		 304 aa  279  4e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.628972  normal  0.723362 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0380  hypothetical protein  52.55 
 
 		 314 aa  279  4e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2424  protein of unknown function DUF344  58.3 
 
 		 304 aa  279  4e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1583  hypothetical protein  53.88 
 
 		 301 aa  279  5e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.60862  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2560  hypothetical protein  56.71 
 
 		 304 aa  279  6e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0310  hypothetical protein  48.25 
 
 		 319 aa  278  7e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0297  hypothetical protein  48.25 
 
 		 319 aa  278  7e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0147  polyphosphate kinase 2  52.21 
 
 		 269 aa  278  8e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.612041  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4078  hypothetical protein  56.07 
 
 		 310 aa  278  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1774  hypothetical protein  54.44 
 
 		 309 aa  277  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3630  hypothetical protein  55.56 
 
 		 305 aa  277  2e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0975997 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33240  hypothetical protein  58.56 
 
 		 304 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.476246  normal  0.0402084 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4500  hypothetical protein  51.81 
 
 		 307 aa  277  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2168  hypothetical protein  51.74 
 
 		 294 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.219464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2825  hypothetical protein  58.56 
 
 		 304 aa  276  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.243756  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4019  protein of unknown function DUF344  59.09 
 
 		 306 aa  276  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4264  hypothetical protein  58.37 
 
 		 310 aa  276  3e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1834  hypothetical protein  55.98 
 
 		 316 aa  276  4e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0278  polyphosphate kinase 2  55.84 
 
 		 308 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0915897  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1067  hypothetical protein  56.95 
 
 		 337 aa  276  4e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37617  normal  0.971255 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1729  putative transcriptional regulator  55.84 
 
 		 308 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0830363  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1318  putative transcriptional regulator  55.84 
 
 		 308 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0013  hypothetical protein  53.82 
 
 		 294 aa  275  5e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.501718  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1642  hypothetical protein  50 
 
 		 294 aa  275  6e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.263612  normal  0.391802 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4287  hypothetical protein  57.27 
 
 		 324 aa  275  6e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.322073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1813  polyphosphate kinase 2 family protein  55.41 
 
 		 308 aa  275  9e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563855  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4575  protein of unknown function DUF344  57.64 
 
 		 304 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0554102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0614  hypothetical protein  57.85 
 
 		 307 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5312  protein of unknown function DUF344  52.57 
 
 		 286 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0163958  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>