272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0245 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0245  taurine dioxygenase  100 
 
 		 291 aa  590  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311094  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  98.56 
 
 		 277 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  96.75 
 
 		 277 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  93.5 
 
 		 277 aa  534  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  78.26 
 
 		 280 aa  463  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  75.81 
 
 		 277 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  75.45 
 
 		 277 aa  431  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4563  taurine dioxygenase  61.82 
 
 		 282 aa  359  2e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.737071 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00318  taurine dioxygenase  61.09 
 
 		 283 aa  356  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3239  Taurine dioxygenase  61.09 
 
 		 283 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0397  taurine dioxygenase  61.09 
 
 		 283 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00322  hypothetical protein  61.09 
 
 		 283 aa  356  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3260  taurine dioxygenase  61.09 
 
 		 283 aa  356  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.169566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0443  taurine dioxygenase  61.09 
 
 		 283 aa  356  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0432  taurine dioxygenase  61.09 
 
 		 283 aa  356  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3692  taurine dioxygenase  61.31 
 
 		 282 aa  355  5e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3935  taurine dioxygenase  61.31 
 
 		 282 aa  355  5e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0261  taurine dioxygenase  61.31 
 
 		 282 aa  355  5e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  60.73 
 
 		 283 aa  355  5e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0799  taurine dioxygenase  60.73 
 
 		 277 aa  347  2e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229107  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0841  taurine dioxygenase  58.18 
 
 		 283 aa  342  5e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0623  taurine dioxygenase  61.09 
 
 		 277 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0658151  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  60.73 
 
 		 277 aa  339  4e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  60.73 
 
 		 335 aa  338  5e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2004  taurine dioxygenase  43.73 
 
 		 278 aa  235  5.0000000000000005e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6202  Taurine dioxygenase  46.35 
 
 		 272 aa  229  5e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  43.17 
 
 		 285 aa  228  6e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2733  taurine dioxygenase  44.21 
 
 		 295 aa  227  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488932  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4158  taurine dioxygenase  40.14 
 
 		 297 aa  225  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670587  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4329  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  44.89 
 
 		 305 aa  225  7e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02787  hypothetical protein  41.33 
 
 		 314 aa  222  6e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5742  Taurine dioxygenase  41.9 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.448505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4751  taurine dioxygenase  40.83 
 
 		 304 aa  219  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325692  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  42.51 
 
 		 306 aa  219  5e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1796  taurine dioxygenase  41.3 
 
 		 270 aa  219  5e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.404778  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5823  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  39.04 
 
 		 295 aa  215  8e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2717  taurine dioxygenase  37.85 
 
 		 305 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4218  Taurine dioxygenase  44.24 
 
 		 322 aa  212  5.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4136  taurine dioxygenase (TauD/TfdA family)  43.01 
 
 		 308 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.805351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4409  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  39.3 
 
 		 301 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425898  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7076  Taurine dioxygenase  42.38 
 
 		 282 aa  208  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30930  taurine catabolic dioxygenase protein  43.84 
 
 		 273 aa  207  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4383  Taurine dioxygenase  41.22 
 
 		 281 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0828  taurine dioxygenase  40.07 
 
 		 276 aa  204  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.297497  normal  0.696924 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34750  putative taurine catabolism dioxygenase  41.46 
 
 		 295 aa  202  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.109909  normal  0.0729012 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0978  Taurine dioxygenase  39.26 
 
 		 287 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.793561  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0137  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  40.14 
 
 		 298 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2169  taurine dioxygenase  39.26 
 
 		 302 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0153  taurine dioxygenase  41.97 
 
 		 302 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.93116 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0986  taurine dioxygenase  38.35 
 
 		 271 aa  199  5e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4704  taurine dioxygenase  42.24 
 
 		 282 aa  198  7e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04663  taurine dioxygenase  40.2 
 
 		 305 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2086  taurine dioxygenase  41.3 
 
 		 293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5058  taurine dioxygenase  39.44 
 
 		 299 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0190  taurine dioxygenase  39.86 
 
 		 299 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5292  taurine dioxygenase  39.52 
 
 		 281 aa  195  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.119745 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3776  Taurine dioxygenase  40.2 
 
 		 315 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0511  Taurine dioxygenase  39.02 
 
 		 299 aa  194  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1958  dioxygenase, TauD/TfdA  39.3 
 
 		 292 aa  193  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5119  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA (2-oxoglutarate-dependent)  40 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0188  taurine dioxygenase  39.44 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354503 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0169  TauD/TfdA family dioxygenase  39.5 
 
 		 299 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1602  taurine dioxygenase  38.83 
 
 		 281 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6251  taurine dioxygenase  39.86 
 
 		 308 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6536  taurine dioxygenase  39.86 
 
 		 308 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.788384 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2012  taurine dioxygenase  39.24 
 
 		 281 aa  192  6e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0746  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase oxidoreductase protein  41.37 
 
 		 301 aa  192  8e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4542  taurine dioxygenase  36.24 
 
 		 301 aa  191  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0422287  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5198  dioxygenase, TauD/TfdA family  37.85 
 
 		 298 aa  191  9e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0337  taurine dioxygenase  37.89 
 
 		 298 aa  191  9e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2481  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  39.72 
 
 		 321 aa  191  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  0.197499 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0021  taurine dioxygenase  38.97 
 
 		 299 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0233  taurine dioxygenase  40.29 
 
 		 301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7176  taurine dioxygenase  38.78 
 
 		 282 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0213  taurine dioxygenase  38.99 
 
 		 306 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2155  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  38.81 
 
 		 315 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2573  dioxygenase, TauD/TfdA  38.6 
 
 		 292 aa  188  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6587  taurine dioxygenase  39.86 
 
 		 308 aa  188  8e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3179  dioxygenase, TauD/TfdA  38.6 
 
 		 292 aa  188  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1409  dioxygenase, TauD/TfdA  38.6 
 
 		 292 aa  188  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.530858  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3847  taurine dioxygenase  37.72 
 
 		 282 aa  188  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2661  dioxygenase, TauD/TfdA  38.6 
 
 		 292 aa  188  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2135  dioxygenase, TauD/TfdA  38.6 
 
 		 292 aa  188  8e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6050  taurine dioxygenase  38.51 
 
 		 291 aa  188  8e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1245  taurine dioxygenase  39.86 
 
 		 308 aa  188  8e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3417  taurine dioxygenase  40.22 
 
 		 318 aa  188  8e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.63153 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3604  taurine dioxygenase  38.89 
 
 		 304 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3116  taurine dioxygenase  39.71 
 
 		 316 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362427 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2520  dioxygenase, TauD/TfdA  38.25 
 
 		 292 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5751  Taurine dioxygenase  39.78 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.278464 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2101  Taurine dioxygenase  38.11 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3924  taurine dioxygenase  39.86 
 
 		 317 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.134883  normal  0.401271 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2819  taurine dioxygenase  39.31 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.373247 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3666  Taurine dioxygenase  39.13 
 
 		 304 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1665  taurine dioxygenase  37.16 
 
 		 303 aa  186  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4976  taurine dioxygenase  40.21 
 
 		 305 aa  186  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141478 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1633  dioxygenase, TauD/TfdA  38.25 
 
 		 292 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2065  taurine dioxygenase  40.22 
 
 		 317 aa  186  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.479444  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4018  taurine dioxygenase  40.22 
 
 		 317 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3506  taurine dioxygenase  40.22 
 
 		 317 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>