216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0197 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0176  fusaric acid resistance protein region  99.57 
 
 		 695 aa  1396    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3618  hypothetical protein  70.1 
 
 		 688 aa  953    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.94953  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3378  fusaric acid resistance protein region  69.97 
 
 		 695 aa  962    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.926577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0171  fusaric acid resistance protein region  70.16 
 
 		 687 aa  971    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5051  fusaric acid resistance protein region  94.82 
 
 		 695 aa  1318    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0201  fusaric acid resistance protein region  97.27 
 
 		 695 aa  1367    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0197  fusaric acid resistance protein region  100 
 
 		 695 aa  1400    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0487942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2612  AraE family aromatic acid exporter  47.76 
 
 		 700 aa  600  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6623  Fusaric acid resistance protein conserved region  47.45 
 
 		 700 aa  591  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7722  fusaric acid resistance protein  46.92 
 
 		 710 aa  568  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5462  fusaric acid resistance protein region  48.91 
 
 		 718 aa  566  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0737125 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6148  fusaric acid resistance protein region  47.21 
 
 		 710 aa  566  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.623711 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5813  fusaric acid resistance protein region  47.9 
 
 		 707 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142587  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6177  fusaric acid resistance protein region  47.9 
 
 		 707 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6657  fusaric acid resistance protein region  47.76 
 
 		 707 aa  558  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6015  fusaric acid resistance protein region  46.11 
 
 		 713 aa  555  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5771  fusaric acid resistance protein region  47.99 
 
 		 719 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4793  putative inner membrane efflux transporter  39.11 
 
 		 659 aa  439  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310622  normal  0.638285 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4934  fusaric acid resistance protein region  40.96 
 
 		 687 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5689  hypothetical protein  37.34 
 
 		 691 aa  402  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.33226  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4083  fusaric acid resistance protein region  38.52 
 
 		 682 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1796  fusaric acid resistance protein region  34.8 
 
 		 625 aa  348  3e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00451003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4011  Fusaric acid resistance protein conserved region  34.58 
 
 		 679 aa  329  1.0000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0926911 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4098  efflux transporter  37.25 
 
 		 693 aa  319  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0870113  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  33.81 
 
 		 698 aa  311  2e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4316  Fusaric acid resistance protein conserved region  33.43 
 
 		 672 aa  306  9.000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.888384  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  33.05 
 
 		 670 aa  306  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0240  Fusaric acid resistance protein conserved region  34.02 
 
 		 680 aa  302  2e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.182295 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  32.57 
 
 		 697 aa  300  5e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0134  fusaric acid resistance protein region  32.52 
 
 		 681 aa  282  1e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.222528  normal  0.532934 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1858  Fusaric acid resistance protein conserved region  34.8 
 
 		 680 aa  280  9e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4864  fusaric acid resistance protein region  35.44 
 
 		 679 aa  279  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436364  normal  0.382045 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2406  fusaric acid resistance protein region  34.51 
 
 		 690 aa  275  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.700972 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3343  Fusaric acid resistance protein conserved region  32.43 
 
 		 688 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0867  Fusaric acid resistance protein conserved region  33.53 
 
 		 692 aa  267  5.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2320  fusaric acid resistance protein region  29.29 
 
 		 713 aa  240  8e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300913  normal  0.199301 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  28.53 
 
 		 702 aa  224  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3501  fusaric acid resistance protein region  32.39 
 
 		 639 aa  221  3.9999999999999997e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.45 
 
 		 697 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  29.19 
 
 		 704 aa  216  8e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3170  fusaric acid resistance protein region  27.68 
 
 		 716 aa  204  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.841968 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2253  Fusaric acid resistance protein conserved region  29.69 
 
 		 653 aa  191  5.999999999999999e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1167  fusaric acid resistance protein region  27.27 
 
 		 676 aa  144  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240521 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4267  fusaric acid resistance protein region  26.52 
 
 		 662 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2211  fusaric acid resistance protein region  24.73 
 
 		 670 aa  139  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0710968  hitchhiker  0.000740189 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1184  fusaric acid resistance protein region  27.08 
 
 		 662 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.476236  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1150  fusaric acid resistance protein region  25.79 
 
 		 662 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0139844  normal  0.271992 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4120  hypothetical protein  26.77 
 
 		 679 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215585  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2911  hypothetical protein  25.21 
 
 		 726 aa  132  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0110  fusaric acid resistance protein, putative  32.34 
 
 		 749 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  43.05 
 
 		 664 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  41.72 
 
 		 664 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0216  fusaric acid resistance protein region  25.34 
 
 		 699 aa  124  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.42737  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5075  fusaric acid resistance protein region  26.71 
 
 		 726 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0750969  normal  0.788772 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2682  fusaric acid resistance protein region  24.47 
 
 		 691 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1263  fusaric acid resistance protein  27.37 
 
 		 676 aa  118  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3787  fusaric acid resistance protein region  28.18 
 
 		 673 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4581  fusaric acid resistance protein region  28.18 
 
 		 673 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5724  fusaric acid resistance protein region  28.18 
 
 		 673 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.367852 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3193  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.57 
 
 		 699 aa  115  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.624391  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03100  p-hydroxybenzoic acid efflux system component  22.31 
 
 		 655 aa  114  6e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3723  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  22.31 
 
 		 655 aa  114  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03051  hypothetical protein  22.31 
 
 		 655 aa  114  6e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0466  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  22.31 
 
 		 655 aa  114  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4557  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  22.31 
 
 		 655 aa  114  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0466  Fusaric acid resistance protein conserved region  22.31 
 
 		 655 aa  114  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3536  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  22.12 
 
 		 655 aa  114  7.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3536  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  22.31 
 
 		 655 aa  114  7.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3429  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  22.31 
 
 		 655 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1345  AraE family aromatic acid exporter  25.36 
 
 		 736 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3555  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  21.21 
 
 		 655 aa  112  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1583  fusaric acid resistance protein region  25.21 
 
 		 744 aa  112  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3724  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  21.21 
 
 		 655 aa  111  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.269228 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3627  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  21.21 
 
 		 655 aa  111  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.35242  normal  0.2133 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3556  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  21.21 
 
 		 655 aa  111  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.374606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3662  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  21.21 
 
 		 655 aa  110  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.250155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1551  fusaric acid resistance domain protein  23.32 
 
 		 679 aa  109  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6856  fusaric acid resistance protein  25.17 
 
 		 700 aa  109  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33190  hypothetical protein  25.61 
 
 		 724 aa  109  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014137 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1902  fusaric acid resistance domain-containing protein  23.32 
 
 		 679 aa  109  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.48277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2821  hypothetical protein  25.39 
 
 		 724 aa  108  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.596664  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1611  fusaric acid resistance domain-containing protein  23.32 
 
 		 679 aa  108  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.461133  normal  0.751418 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1733  fusaric acid resistance domain protein  23.32 
 
 		 679 aa  107  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105287  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1538  fusaric acid resistance domain protein  23.18 
 
 		 679 aa  107  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0513426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2782  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.79 
 
 		 739 aa  107  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.747937 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4798  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.9 
 
 		 722 aa  107  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0857117  hitchhiker  0.0000430951 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3677  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  22.35 
 
 		 655 aa  107  8e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0939  fusaric acid resistance protein region  25.48 
 
 		 730 aa  107  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3197  fusaric acid resistance protein region  28.63 
 
 		 727 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1218  fusaric acid resistance protein, putative  26.15 
 
 		 728 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555217  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1264  fusaric acid resistance protein region  25.29 
 
 		 725 aa  105  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4459  fusaric acid resistance protein region  25.29 
 
 		 725 aa  105  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1837  fusaric acid resistance domain protein  25.21 
 
 		 670 aa  105  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0235624  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1490  fusaric acid resistance protein region  39.88 
 
 		 662 aa  105  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0264  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  22.9 
 
 		 662 aa  104  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1175  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  21.87 
 
 		 651 aa  104  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193331 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0485  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  21.87 
 
 		 651 aa  104  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0421  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  21.87 
 
 		 651 aa  104  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1553  fusaric acid resistance domain-containing protein  25.04 
 
 		 670 aa  103  8e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.266646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2357  fusaric acid resistance domain protein  24.57 
 
 		 663 aa  103  9e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000905484  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>