More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0179 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  97.34 
 
 		 828 aa  1663    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  46.91 
 
 		 701 aa  649    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 828 aa  1704    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  62.15 
 
 		 794 aa  1018    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  75.22 
 
 		 797 aa  1252    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0458  ferrichrome-iron receptor  46.3 
 
 		 696 aa  641    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000766311 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0398  ferrichrome-iron receptor  46.15 
 
 		 698 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  49.49 
 
 		 736 aa  684    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  47.06 
 
 		 696 aa  660    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  47.51 
 
 		 705 aa  656    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  62.73 
 
 		 820 aa  1018    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0395  ferrichrome-iron receptor  46 
 
 		 696 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.458077  hitchhiker  0.000000000000143872 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0416  ferrichrome-iron receptor  46.15 
 
 		 696 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0404  ferrichrome-iron receptor  46.3 
 
 		 696 aa  641    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000262521 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  93.36 
 
 		 828 aa  1601    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2736  TonB-dependent siderophore receptor  45.49 
 
 		 705 aa  599  1e-170  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111092 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  44.53 
 
 		 729 aa  564  1.0000000000000001e-159  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  39.57 
 
 		 833 aa  548  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  39 
 
 		 797 aa  535  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  38.66 
 
 		 806 aa  529  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  39.64 
 
 		 729 aa  497  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  36.61 
 
 		 808 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  39.22 
 
 		 729 aa  495  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  39.24 
 
 		 747 aa  493  9.999999999999999e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  38.95 
 
 		 747 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  39.09 
 
 		 747 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  38.07 
 
 		 829 aa  492  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  39.36 
 
 		 729 aa  490  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  39.19 
 
 		 729 aa  488  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0208  ferrichrome outer membrane transporter  39.19 
 
 		 703 aa  489  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0209  ferrichrome outer membrane transporter  39.19 
 
 		 703 aa  489  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  39.33 
 
 		 752 aa  488  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  36.23 
 
 		 806 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  38.67 
 
 		 747 aa  479  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0350  TonB-dependent siderophore receptor  35.66 
 
 		 810 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0376  TonB-dependent siderophore receptor  35.78 
 
 		 810 aa  482  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  38.67 
 
 		 747 aa  479  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  38.81 
 
 		 747 aa  481  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  35.84 
 
 		 810 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  37.35 
 
 		 828 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  38.64 
 
 		 745 aa  476  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  35.68 
 
 		 802 aa  474  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  35.9 
 
 		 810 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  37.62 
 
 		 778 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  39.97 
 
 		 717 aa  469  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3452  TonB-dependent siderophore receptor  38.67 
 
 		 747 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.380409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0155  ferrichrome outer membrane transporter  38.67 
 
 		 747 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  37.71 
 
 		 735 aa  459  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  37.5 
 
 		 799 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  37.63 
 
 		 831 aa  456  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3895  TonB-dependent siderophore receptor  38.48 
 
 		 753 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495237  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  37.04 
 
 		 801 aa  451  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3272  TonB-dependent siderophore receptor  39.47 
 
 		 750 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46801  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  35.12 
 
 		 829 aa  449  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1319  TonB-dependent siderophore receptor  38.18 
 
 		 740 aa  445  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  35.62 
 
 		 797 aa  441  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  36.5 
 
 		 779 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  35.63 
 
 		 821 aa  436  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  39.83 
 
 		 769 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  34.8 
 
 		 808 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  34.34 
 
 		 817 aa  431  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  37.55 
 
 		 789 aa  425  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7042  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  37.31 
 
 		 689 aa  422  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  33.84 
 
 		 863 aa  421  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  35.36 
 
 		 723 aa  421  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1079  TonB-dependent siderophore receptor  37.76 
 
 		 714 aa  422  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.181404  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  36.24 
 
 		 733 aa  420  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  34.06 
 
 		 819 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  34.68 
 
 		 791 aa  415  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4798  TonB-dependent siderophore receptor  36.73 
 
 		 724 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  33.9 
 
 		 791 aa  412  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6866  TonB-dependent siderophore receptor  36.54 
 
 		 748 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2654  TonB-dependent siderophore receptor  38.57 
 
 		 757 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0434213 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  37.12 
 
 		 745 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4489  TonB-dependent siderophore receptor  36.44 
 
 		 785 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  37.54 
 
 		 771 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  33.75 
 
 		 815 aa  409  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  35.3 
 
 		 799 aa  407  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4121  TonB-dependent siderophore receptor  36.3 
 
 		 785 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.922703 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  35.04 
 
 		 812 aa  406  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0008  TonB-dependent siderophore receptor  34.76 
 
 		 713 aa  404  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000108759 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  33.13 
 
 		 799 aa  402  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2374  TonB-dependent siderophore receptor  32.2 
 
 		 822 aa  398  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  36.95 
 
 		 771 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4602  TonB-dependent siderophore receptor  36.46 
 
 		 784 aa  398  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4673  TonB-dependent siderophore receptor  35.86 
 
 		 727 aa  396  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  34.68 
 
 		 701 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2192  ferrioxamine B receptor precursor protein  34.76 
 
 		 724 aa  383  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.411084  decreased coverage  0.00773577 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2415  TonB-dependent siderophore receptor  35.7 
 
 		 738 aa  385  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0592424  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1474  TonB-dependent siderophore receptor  36.38 
 
 		 715 aa  384  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.052337 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2867  TonB-dependent siderophore receptor  34.85 
 
 		 733 aa  385  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132982  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1945  ferric malleobactin transporter  35.36 
 
 		 753 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342742  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2091  TonB-dependent siderophore receptor  35.36 
 
 		 737 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.552144  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4098  TonB-dependent siderophore receptor  35.36 
 
 		 754 aa  382  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1930  ferric malleobactin transporter  35.36 
 
 		 753 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1178  TonB-dependent siderophore receptor  34.83 
 
 		 741 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0776508  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0285  TonB-dependent siderophore receptor  34.83 
 
 		 752 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0472595  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1436  TonB-dependent siderophore receptor  34.88 
 
 		 750 aa  378  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0876  TonB-dependent siderophore receptor  34.83 
 
 		 736 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195373  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1622  TonB-dependent siderophore receptor  34.83 
 
 		 736 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>