37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0167 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0149  hypothetical protein  97.53 
 
 		 651 aa  1285    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0399959 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5078  hypothetical protein  91.67 
 
 		 652 aa  1187    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574905 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0165  hypothetical protein  95.83 
 
 		 648 aa  1267    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5469  hypothetical protein  74.88 
 
 		 653 aa  990    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6262  hypothetical protein  67.14 
 
 		 652 aa  818    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5024  hypothetical protein  75.19 
 
 		 653 aa  989    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.551196 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01810  hypothetical protein  66.92 
 
 		 664 aa  841    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.925728  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0106  hypothetical protein  77.09 
 
 		 653 aa  1009    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0167  hypothetical protein  100 
 
 		 648 aa  1311    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.753668 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4438  hypothetical protein  69.22 
 
 		 651 aa  842    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72110  hypothetical protein  66.72 
 
 		 652 aa  816    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0201799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1790  hypothetical protein  42.16 
 
 		 598 aa  430  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.304981  normal  0.460878 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00855  hypothetical protein  43.59 
 
 		 623 aa  421  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00443533  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06072  hypothetical protein  43.59 
 
 		 623 aa  421  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00242349  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1333  hypothetical protein  23.99 
 
 		 625 aa  68.6  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123258 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0551  hypothetical protein  24.82 
 
 		 630 aa  60.1  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000916398 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0538  hypothetical protein  25.31 
 
 		 631 aa  59.3  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0544605  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40880  hypothetical protein  26.22 
 
 		 620 aa  59.7  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.276542  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0062  hypothetical protein  26.52 
 
 		 668 aa  57.4  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.554758  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0050  hypothetical protein  26.22 
 
 		 665 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0248559  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0513  hypothetical protein  25.75 
 
 		 670 aa  55.8  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975602 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4507  hypothetical protein  26.82 
 
 		 617 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.766692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2920  hypothetical protein  27.27 
 
 		 648 aa  55.1  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000352229 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0710  hypothetical protein  25.95 
 
 		 617 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0398425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3342  hypothetical protein  24.73 
 
 		 622 aa  54.3  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0046  hypothetical protein  26.06 
 
 		 664 aa  54.3  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4261  hypothetical protein  25.16 
 
 		 617 aa  53.9  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.965638  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0678  hypothetical protein  27.49 
 
 		 620 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.760375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0709  hypothetical protein  25.43 
 
 		 617 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.740824  normal  0.0355501 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1197  hypothetical protein  25.14 
 
 		 617 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4871  hypothetical protein  22.19 
 
 		 617 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4587  hypothetical protein  25.47 
 
 		 617 aa  52  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.279648  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2012  hypothetical protein  26.87 
 
 		 678 aa  50.8  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5220  hypothetical protein  27.84 
 
 		 618 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60580  hypothetical protein  27.84 
 
 		 618 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.73851 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2201  hypothetical protein  26.5 
 
 		 629 aa  48.5  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2797  hypothetical protein  28.57 
 
 		 619 aa  43.9  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>