242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0104 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0089  OsmC family protein  100 
 
 
141 aa  285  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457193 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0104  OsmC family protein  100 
 
 
141 aa  285  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0104  OsmC family protein  99.29 
 
 
141 aa  284  3e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  5.09604e-07 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0107  OsmC family protein  91.49 
 
 
141 aa  266  7e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00369432 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0059  osmotically inducible protein OsmC  87.94 
 
 
141 aa  254  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00710  osmotically inducible protein OsmC  87.94 
 
 
151 aa  254  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3199  OsmC family protein  72.14 
 
 
140 aa  215  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.783352 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01800  OsmC-like protein  68.79 
 
 
141 aa  209  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0270065  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0097  OsmC-like protein  72.46 
 
 
143 aa  205  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0152  osmotically inducible protein  71.74 
 
 
143 aa  204  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4453  OsmC family protein  70.5 
 
 
141 aa  201  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3986  OsmC-like protein  70.9 
 
 
143 aa  201  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0862185  normal  0.347334 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1401  OsmC-like protein  70.9 
 
 
142 aa  201  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.655956 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5086  OsmC family protein  68.12 
 
 
143 aa  200  5e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.252827  normal  0.822138 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1421  OsmC-like protein  69.12 
 
 
142 aa  199  9e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0040  OsmC-like protein  70.29 
 
 
143 aa  198  2e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4674  OsmC family protein  68.61 
 
 
142 aa  198  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2238  OsmC family protein  68.35 
 
 
140 aa  196  8e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.8088  normal  0.565057 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0585  osmotically inducible protein OsmC  68.35 
 
 
140 aa  196  9e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3760  Peroxiredoxin  66.67 
 
 
143 aa  194  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1158  OsmC-like protein  65.96 
 
 
143 aa  194  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5463  osmotically inducible protein OsmC  70 
 
 
143 aa  193  6e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3472  OsmC family protein  67.14 
 
 
143 aa  193  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.359204  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1538  OsmC-like protein  64.96 
 
 
142 aa  190  5e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316211  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1994  OsmC family protein  65.22 
 
 
143 aa  186  7e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300128  normal  0.0352029 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0488  OsmC family protein  64.75 
 
 
140 aa  184  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.358629  normal  0.188349 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1145  putative OsmC-like protein  64.75 
 
 
141 aa  181  2e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.764464  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5465  OsmC family protein  64.75 
 
 
141 aa  181  2e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0303  OsmC-like protein  64.03 
 
 
140 aa  182  2e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.263241 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2041  OsmC family protein  62.59 
 
 
142 aa  178  3e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.811079  normal  0.341975 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2091  Peroxiredoxin  63.31 
 
 
142 aa  177  4e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.481334  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2175  OsmC family protein  61.87 
 
 
143 aa  171  2e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01452  hypothetical protein  61.87 
 
 
143 aa  171  2e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.219956  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1780  peroxiredoxin OsmC  61.15 
 
 
143 aa  172  2e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.778339  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1567  peroxiredoxin OsmC  61.87 
 
 
143 aa  171  2e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1664  peroxiredoxin OsmC  61.87 
 
 
143 aa  171  2e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1679  peroxiredoxin OsmC  61.15 
 
 
143 aa  172  2e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.495721 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01440  osmotically inducible, stress-inducible membrane protein  61.87 
 
 
143 aa  171  2e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.21953  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1602  peroxiredoxin OsmC  61.15 
 
 
143 aa  172  2e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.746338  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2165  OsmC family protein  61.87 
 
 
143 aa  171  2e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.294382  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1677  peroxiredoxin OsmC  61.15 
 
 
143 aa  172  2e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1740  peroxiredoxin OsmC  61.15 
 
 
143 aa  172  2e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1745  peroxiredoxin OsmC  61.87 
 
 
143 aa  170  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.234599  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2450  OsmC family protein  60.58 
 
 
143 aa  170  6e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.72544 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2094  peroxiredoxin OsmC  61.15 
 
 
143 aa  169  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3133  OsmC family protein  64.75 
 
 
143 aa  168  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0138842  normal  0.07408 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0924  OsmC family protein  61.76 
 
 
140 aa  167  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.872356 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0144  OsmC family protein  57.14 
 
 
141 aa  167  4e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.30653  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2261  OsmC family protein  57.66 
 
 
143 aa  165  3e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.427996 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5223  OsmC family protein  62.59 
 
 
141 aa  164  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0610628  normal  0.18726 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2579  OsmC family protein  56.93 
 
 
143 aa  163  9e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal  0.332433 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2304  OsmC family protein  56.93 
 
 
143 aa  160  4e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783308  hitchhiker  0.00777358 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2067  OsmC-like protein  56.12 
 
 
141 aa  157  5e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0381  OsmC family protein  54.68 
 
 
136 aa  154  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.639142 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03308  osmotically inducible protein  55.47 
 
 
144 aa  153  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271298  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0009  OsmC family protein  53.15 
 
 
145 aa  146  9e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1691  peroxiredoxin OsmC  64.6 
 
 
116 aa  146  1e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0742  OsmC-like protein  54.14 
 
 
143 aa  144  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2339  OsmC family protein  52.14 
 
 
136 aa  144  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.537023 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4150  OsmC family protein  51.41 
 
 
145 aa  140  5e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.882481 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0007  OsmC family protein  51.41 
 
 
145 aa  140  5e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0956  OsmC family protein  52.41 
 
 
145 aa  140  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3664  Peroxiredoxin  54.23 
 
 
146 aa  140  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444391  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7145  OsmC family protein  53.52 
 
 
138 aa  140  7e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2374  OsmC-like protein  51.11 
 
 
142 aa  139  1e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0467379 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0580  OsmC-like protein  51.75 
 
 
144 aa  139  2e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.207251  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5772  OsmC family protein  47.52 
 
 
140 aa  137  4e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.255484  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2252  osmotically inducible protein  49.31 
 
 
145 aa  137  4e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.599611  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3893  OsmC family protein  51.94 
 
 
165 aa  136  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254046  normal  0.0151662 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1008  OsmC family protein  53.19 
 
 
143 aa  134  5e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.739928 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3272  osmotically inducible protein C  50 
 
 
161 aa  133  7e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4026  OsmC family protein  51.09 
 
 
138 aa  132  2e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2716  peroxiredoxin, OsmC subfamily  51.43 
 
 
139 aa  131  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.126465  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0059  redox protein, regulator of disulfide bond formation  51.06 
 
 
145 aa  130  4e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00217443  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2586  OsmC family protein  50 
 
 
139 aa  130  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.32042  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02004  peroxiredoxin OsmC  50.72 
 
 
144 aa  126  8e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3669  OsmC family protein  51.77 
 
 
147 aa  125  2e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3240  OsmC-like protein  51.72 
 
 
146 aa  124  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1364  OsmC family protein  49.29 
 
 
140 aa  123  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.680071  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2726  peroxiredoxin, OsmC subfamily  43.17 
 
 
138 aa  123  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.102217 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1350  OsmC family protein  47.48 
 
 
138 aa  122  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0526  OsmC-like protein protein  42.45 
 
 
145 aa  122  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.455269 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1108  OsmC family protein  47.14 
 
 
139 aa  116  1e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2843  osmotically inducible protein  49.22 
 
 
139 aa  114  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0142  OsmC-like protein  42.66 
 
 
146 aa  112  1e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2899  OsmC family protein  43.26 
 
 
141 aa  113  1e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1962  OsmC family protein  47.86 
 
 
141 aa  108  2e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000828142  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1603  OsmC family protein  45.32 
 
 
142 aa  109  2e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.85336e-11 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7122  OsmC family protein  44.76 
 
 
171 aa  108  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1609  OsmC family protein  43.88 
 
 
143 aa  107  4e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.250786  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0962  OsmC family protein  47.48 
 
 
142 aa  104  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0697  putative ATP/GTP binding protein  45.99 
 
 
141 aa  104  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2185  OsmC family protein  46.76 
 
 
143 aa  103  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2252  OsmC family protein  44.37 
 
 
142 aa  102  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.11482 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5540  peroxiredoxin, OsmC subfamily  43.66 
 
 
141 aa  101  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0957781 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32410  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  42.55 
 
 
146 aa  100  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0060  OsmC family protein  44.6 
 
 
141 aa  100  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1608  OsmC family protein  45.71 
 
 
142 aa  99  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.486647  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2232  OsmC family protein  39.57 
 
 
152 aa  98.2  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0122  OsmC family protein  41.84 
 
 
146 aa  98.6  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>