15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0095 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0095  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0080  hypothetical protein  95.12 
 
 		 205 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000365782 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0095  hypothetical protein  76.59 
 
 		 184 aa  295  3e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000456218 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0098  hypothetical protein  73.66 
 
 		 182 aa  289  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000660133 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0028  hypothetical protein  49.07 
 
 		 219 aa  195  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.163788  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36450  hypothetical protein  32.85 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00361093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3127  hypothetical protein  31.73 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.51 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.38 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.866991  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0880  hypothetical protein  26.67 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.533635  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2018  NAD-binding protein, putative  28.95 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2728  hypothetical protein  24.22 
 
 		 213 aa  42.7  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.763149  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  25 
 
 		 211 aa  42  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1882  putative NADH-flavin reductase-like protein  26.49 
 
 		 207 aa  41.6  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1725  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 		 214 aa  41.6  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>