19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0087 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0087  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  221  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0071  hypothetical protein  92.38 
 
 		 153 aa  203  7e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.664883  hitchhiker  0.0000574078 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0087  hypothetical protein  94.79 
 
 		 101 aa  191  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.723367  hitchhiker  0.00000000000806538 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0090  hypothetical protein  85.42 
 
 		 100 aa  181  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.218001  hitchhiker  0.0000147409 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5302  hypothetical protein  71.58 
 
 		 97 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5157  hypothetical protein  69.47 
 
 		 97 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.429191  normal  0.50237 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5247  hypothetical protein  68.42 
 
 		 132 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2468  hypothetical protein  40.59 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3468  hypothetical protein  40 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.773986  normal  0.882727 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4773  hypothetical protein  35.48 
 
 		 76 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0890871 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2300  hypothetical protein  38.46 
 
 		 78 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.750268 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4043  hypothetical protein  33.7 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.131676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4933  hypothetical protein  34.65 
 
 		 93 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000154034  hitchhiker  0.0000000705895 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0691  hypothetical protein  32.61 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000978963 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3661  hypothetical protein  32.08 
 
 		 112 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000704866  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0223  hypothetical protein  35.23 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.841238 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0693  hypothetical protein  32.61 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000477278 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4916  hypothetical protein  29.36 
 
 		 108 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000000285344  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5362  hypothetical protein  30.48 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.11263  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>