45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0056 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0059  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  224  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0209485 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0056  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  224  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.656239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0056  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  224  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.793416  hitchhiker  0.00127332 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0042  hypothetical protein  98.57 
 
 		 70 aa  150  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.384009  hitchhiker  0.0000029662 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2240  hypothetical protein  63.74 
 
 		 106 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.962387 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0367  hypothetical protein  53 
 
 		 109 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4809  hypothetical protein  52 
 
 		 109 aa  105  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3288  hypothetical protein  51.69 
 
 		 109 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0028  hypothetical protein  37.86 
 
 		 108 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000305269 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0042  hypothetical protein  38.83 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.773701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0042  hypothetical protein  38.83 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000312545 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0045  hypothetical protein  38.83 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0387192  normal  0.279288 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0010  hypothetical protein  36.84 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.430167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0010  hypothetical protein  36.84 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000597864  normal  0.167799 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0012  hypothetical protein  36.84 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.383277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1165  hypothetical protein  37.21 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.183778  normal  0.18975 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5376  hypothetical protein  36.36 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.290226 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3619  hypothetical protein  43.28 
 
 		 110 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5185  hypothetical protein  34.74 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.519689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2213  hypothetical protein  42.19 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0475545  normal  0.961579 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2207  hypothetical protein  45 
 
 		 86 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.810348  normal  0.0278575 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11730  hypothetical protein  47.06 
 
 		 69 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.281094  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3573  hypothetical protein  32.71 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1824  hypothetical protein  32.71 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111076  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49420  hypothetical protein  38.89 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48330  hypothetical protein  37.5 
 
 		 85 aa  52  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0629623  normal  0.0634515 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4294  hypothetical protein  40.35 
 
 		 86 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474995  normal  0.851639 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4640  hypothetical protein  36 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52960  hypothetical protein  36 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1332  hypothetical protein  39.58 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.186135 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4557  hypothetical protein  39.58 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4064  hypothetical protein  39.58 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3857  hypothetical protein  38.18 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1533  hypothetical protein  36.17 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.555679 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1427  hypothetical protein  34.38 
 
 		 84 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0853542  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4488  hypothetical protein  34.38 
 
 		 84 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3993  hypothetical protein  32.81 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0652505  normal  0.145213 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3777  hypothetical protein  32.81 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26386  hitchhiker  0.000401061 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49370  hypothetical protein  35.19 
 
 		 85 aa  45.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03960  hypothetical protein  32.14 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4154  hypothetical protein  34.69 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.211914  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22420  hypothetical protein  26.76 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000849865 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1897  hypothetical protein  26.76 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.245827  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15330  hypothetical protein  38 
 
 		 85 aa  40.4  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3370  hypothetical protein  34.62 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>