More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0040 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  100 
 
 		 301 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 301 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 301 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 301 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  56.51 
 
 		 299 aa  328  6e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  52.92 
 
 		 312 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  53.33 
 
 		 326 aa  320  1.9999999999999998e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  56.16 
 
 		 299 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  55.64 
 
 		 304 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  56.42 
 
 		 316 aa  296  3e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  56.42 
 
 		 316 aa  296  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  55.16 
 
 		 305 aa  295  9e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  55.16 
 
 		 305 aa  295  9e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2218  cation diffusion facilitator family transporter  52.6 
 
 		 297 aa  292  5e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0353679 
 
 
-
 
NC_004310  BR0498  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  55.02 
 
 		 297 aa  285  9e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0501  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  55.02 
 
 		 297 aa  284  2.0000000000000002e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0340413  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  50 
 
 		 300 aa  281  7.000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  50 
 
 		 300 aa  281  7.000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3473  cation diffusion facilitator family transporter  57.43 
 
 		 319 aa  278  5e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  49.67 
 
 		 305 aa  278  6e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  51.03 
 
 		 313 aa  277  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  48.42 
 
 		 305 aa  272  6e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  51.06 
 
 		 299 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  51.03 
 
 		 299 aa  259  3e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0184  cation diffusion facilitator family transporter  47.68 
 
 		 304 aa  255  6e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.421209  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  43.52 
 
 		 302 aa  250  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0171  cation diffusion facilitator family transporter  47.1 
 
 		 307 aa  249  5e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  42.07 
 
 		 299 aa  248  9e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  41.72 
 
 		 299 aa  246  3e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3389  cation diffusion facilitator family transporter  45.03 
 
 		 305 aa  246  3e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.400984 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  41.22 
 
 		 299 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  44.56 
 
 		 305 aa  244  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  41.38 
 
 		 299 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0389  cation diffusion facilitator family transporter  44.74 
 
 		 308 aa  239  4e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  41.95 
 
 		 299 aa  237  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  41.72 
 
 		 299 aa  237  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  41.61 
 
 		 299 aa  236  4e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3631  cation diffusion facilitator family transporter  47.39 
 
 		 305 aa  235  9e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.492249  decreased coverage  0.00000526062 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  41.61 
 
 		 299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  41.61 
 
 		 299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0610  cation diffusion facilitator family transporter  45.15 
 
 		 306 aa  233  3e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049806 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  39.79 
 
 		 315 aa  232  6e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  42.09 
 
 		 307 aa  231  9e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4903  cation diffusion facilitator family transporter  43.81 
 
 		 308 aa  231  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  41.85 
 
 		 295 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4444  cation diffusion facilitator family transporter  45 
 
 		 305 aa  230  3e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  39.58 
 
 		 342 aa  228  6e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  43.07 
 
 		 327 aa  226  3e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  39.93 
 
 		 314 aa  223  4e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  38.71 
 
 		 298 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3496  cation diffusion facilitator family transporter  42.37 
 
 		 300 aa  221  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25900  cation diffusion facilitator family transporter  40.82 
 
 		 304 aa  219  5e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  40.51 
 
 		 327 aa  218  1e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  37.32 
 
 		 298 aa  216  4e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1370  cation diffusion facilitator family transporter  40.21 
 
 		 333 aa  216  5e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4544  cation diffusion facilitator family transporter  43.62 
 
 		 356 aa  214  9.999999999999999e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.586592 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  40.29 
 
 		 312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  42.09 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  42.65 
 
 		 309 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  37.08 
 
 		 398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  40.29 
 
 		 312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  40.29 
 
 		 312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13910  cation diffusion facilitator family transporter  40.61 
 
 		 303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  43.45 
 
 		 312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2300  cation efflux protein  45.76 
 
 		 300 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3226  cation diffusion facilitator family transporter  41.64 
 
 		 352 aa  212  7e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  40.36 
 
 		 316 aa  211  9e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0425  cation diffusion facilitator family transporter  43.05 
 
 		 308 aa  211  9e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6162  cation diffusion facilitator family transporter  42.86 
 
 		 309 aa  211  9e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30010  cation diffusion facilitator family transporter  44.12 
 
 		 307 aa  211  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000713084  normal  0.287518 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4570  cation diffusion facilitator family transporter  40.57 
 
 		 340 aa  209  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0525  cation diffusion facilitator family transporter  42.18 
 
 		 306 aa  208  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3234  cation diffusion facilitator family transporter  37.85 
 
 		 323 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.34559  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2626  cation diffusion facilitator family transporter  38 
 
 		 313 aa  206  4e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208162  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0712  cation diffusion facilitator family transporter  38.04 
 
 		 301 aa  206  4e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1344  cation diffusion facilitator family transporter  44.19 
 
 		 307 aa  205  9e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.123489  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  39.71 
 
 		 326 aa  203  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0868  cation diffusion facilitator family transporter  42.49 
 
 		 309 aa  203  3e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  40.56 
 
 		 310 aa  203  4e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  40.54 
 
 		 312 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  40.54 
 
 		 312 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  40.54 
 
 		 312 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  40.2 
 
 		 312 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4118  cation diffusion facilitator family transporter  39.86 
 
 		 325 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1148  cation diffusion facilitator family transporter  38.79 
 
 		 340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.280865  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0885  zinc transporter ZitB  40.54 
 
 		 312 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4276  cation efflux protein  39.86 
 
 		 325 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  38.97 
 
 		 331 aa  198  9e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3080  zinc transporter ZitB  39.47 
 
 		 310 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0672  zinc transporter ZitB  42.76 
 
 		 313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00307439  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2216  cation diffusion facilitator family transporter  42.28 
 
 		 305 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  39.19 
 
 		 298 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19860  cation diffusion facilitator family transporter  37.91 
 
 		 308 aa  195  8.000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.163356  decreased coverage  0.00158825 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4476  cation diffusion facilitator family transporter  37.45 
 
 		 312 aa  194  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4311  cation diffusion facilitator family transporter  40.96 
 
 		 307 aa  194  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  0.413634 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3334  cation diffusion facilitator family transporter  37.83 
 
 		 305 aa  194  1e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6519  cation diffusion facilitator family transporter  43.22 
 
 		 328 aa  193  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1582  cation diffusion facilitator family transporter  37.46 
 
 		 321 aa  192  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.496669 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0853  Hsp12 variant C  43.88 
 
 		 306 aa  192  6e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.401096  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2220  cation diffusion facilitator family transporter  37.72 
 
 		 325 aa  191  9e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.157536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>