20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0019 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0021  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  238  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0019  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  238  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.46801  normal  0.0246998 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0019  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  196  6e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.417471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3040  hypothetical protein  63.79 
 
 		 116 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2393  hypothetical protein  49.12 
 
 		 113 aa  111  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320552  hitchhiker  0.00184098 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4012  hypothetical protein  42.5 
 
 		 81 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5176  hypothetical protein  76.19 
 
 		 45 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2209  hypothetical protein  34.23 
 
 		 114 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.116211  normal  0.0459101 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5179  hypothetical protein  37.21 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6285  hypothetical protein  36.22 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.892062  normal  0.385427 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0511  hypothetical protein  34.13 
 
 		 155 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0329  putative lipoprotein  34.13 
 
 		 155 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738731  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2049  hypothetical protein  34.13 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3043  hypothetical protein  34.13 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3373  hypothetical protein  34.13 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0316  putative lipoprotein  32.26 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.956648  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5689  hypothetical protein  37.84 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.118692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3399  hypothetical protein  33.62 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4768  hypothetical protein  33.62 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4117  hypothetical protein  33.62 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.943652 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>