More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_5157 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2556  chromate transporter  80.22 
 
 
450 aa  703    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0100116 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3159  chromate transporter  80.67 
 
 
450 aa  685    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896141  normal  0.125861 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2247  chromate transporter  82.64 
 
 
453 aa  758    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0538278  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3555  chromate transporter  77.51 
 
 
454 aa  677    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2144  chromate transporter  75.89 
 
 
447 aa  647    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4327  chromate transporter  76.06 
 
 
444 aa  659    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.685407 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3384  chromate transporter  95.38 
 
 
456 aa  852    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5157  chromate transporter  100 
 
 
456 aa  897    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4365  chromate transporter  72.91 
 
 
455 aa  633  1e-180  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6524  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43910  Chromate transporter  76.3 
 
 
453 aa  599  1e-170  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0450  chromate transporter  70.34 
 
 
456 aa  589  1e-167  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2526  CHR transporter  71.3 
 
 
445 aa  569  1e-161  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5759  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  72.31 
 
 
457 aa  566  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4886  chromate transporter  69.11 
 
 
456 aa  560  1e-158  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0285  chromate transporter  68.58 
 
 
446 aa  553  1e-156  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0316  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  72.41 
 
 
447 aa  542  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3067  chromate transporter  68.97 
 
 
452 aa  539  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0932406  normal  0.975583 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1239  chromate transporter  62.36 
 
 
442 aa  526  1e-148  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.132611  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0081  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  61.07 
 
 
450 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.826612 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0797  chromate transporter  63.4 
 
 
451 aa  486  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.755683 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4100  chromate transporter  64.16 
 
 
454 aa  486  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.343432 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3651  chromate transporter  49.68 
 
 
469 aa  415  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.947336 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2656  chromate transporter  56.48 
 
 
507 aa  392  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1753  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  50.32 
 
 
467 aa  394  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1891  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  51.35 
 
 
469 aa  391  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.861826 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1475  chromate transporter  50.54 
 
 
467 aa  387  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.215191 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6162  chromate transporter  48.28 
 
 
466 aa  382  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3191  chromate transporter  46.53 
 
 
483 aa  384  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4736  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  50.32 
 
 
471 aa  381  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0153  chromate transporter  48.03 
 
 
466 aa  381  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.193683  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2389  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  49.79 
 
 
473 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.443126  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2674  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  46.42 
 
 
441 aa  369  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2523  chromate transporter  48.59 
 
 
471 aa  365  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.600118 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2724  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  49.57 
 
 
473 aa  365  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.506221  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4665  putative chromate transporter  46.68 
 
 
463 aa  364  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154177  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4194  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  49.67 
 
 
469 aa  362  9e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2237  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  50.78 
 
 
469 aa  355  7.999999999999999e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0139  chromate transporter  46.58 
 
 
462 aa  352  7e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6097  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  49.89 
 
 
469 aa  349  6e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0742  chromate transporter  46.67 
 
 
461 aa  348  8e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1532  chromate transporter  47.45 
 
 
452 aa  342  5.999999999999999e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0300  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  47.67 
 
 
467 aa  336  5e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.178358 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3583  chromate transporter  46.07 
 
 
460 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35339  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2679  chromate transporter  46.4 
 
 
443 aa  326  6e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2446  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  45.68 
 
 
465 aa  324  2e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.853251  decreased coverage  0.0000000439073 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2538  chromate transporter  47.99 
 
 
465 aa  323  3e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5828  chromate transport protein chrA  43.99 
 
 
463 aa  321  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.42625  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2237  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  45.54 
 
 
468 aa  318  1e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4248  chromate transporter  48.59 
 
 
450 aa  314  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1601  chromate transporter  42.65 
 
 
443 aa  308  1.0000000000000001e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646731  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2804  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  43.7 
 
 
470 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3131  chromate transporter  45.86 
 
 
454 aa  306  4.0000000000000004e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3337  chromate transporter  45.86 
 
 
454 aa  306  4.0000000000000004e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3349  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  41.91 
 
 
441 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.102603 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1633  chromate transporter  44.95 
 
 
432 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3060  chromate transporter  41.63 
 
 
449 aa  266  8e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.904181  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  41.19 
 
 
428 aa  265  1e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3638  chromate transporter  44.27 
 
 
431 aa  262  6.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46355  normal  0.675394 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2332  putative chromate transport protein  43.09 
 
 
417 aa  249  5e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00115086  normal  0.80205 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0092  chromate transporter  33.5 
 
 
428 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  30.72 
 
 
396 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4148  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.91 
 
 
472 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.377842 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  30.05 
 
 
385 aa  167  5e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  30.73 
 
 
396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3911  chromate transporter  36.21 
 
 
388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00929243  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  30.73 
 
 
396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  29.45 
 
 
397 aa  164  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  30.5 
 
 
396 aa  163  6e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  29.33 
 
 
392 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  28.87 
 
 
392 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4108  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.54 
 
 
472 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  30.41 
 
 
394 aa  159  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1226  chromate transporter  51.39 
 
 
418 aa  158  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.48 
 
 
404 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.05 
 
 
395 aa  157  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  31.9 
 
 
382 aa  151  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3318  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.61 
 
 
393 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.966219 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  28.92 
 
 
383 aa  149  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2961  hypothetical protein  81.82 
 
 
145 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.026338  normal  0.521297 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.95 
 
 
392 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  29.58 
 
 
389 aa  148  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.28 
 
 
386 aa  145  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.93 
 
 
379 aa  143  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.21 
 
 
382 aa  143  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  28.96 
 
 
401 aa  139  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1206  chromate transporter  28.72 
 
 
398 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405124  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2996  chromate transporter  28.24 
 
 
376 aa  138  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000942409  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  24.61 
 
 
420 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  25.4 
 
 
416 aa  132  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2622  chromate transporter  25.55 
 
 
393 aa  131  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2503  chromate transporter  26.96 
 
 
399 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6455  chromate transporter  27.48 
 
 
390 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1803  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.05 
 
 
400 aa  130  6e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  42.67 
 
 
379 aa  121  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2688  chromate transporter  43.28 
 
 
378 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2467  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  42.66 
 
 
391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  37.18 
 
 
393 aa  110  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  38.89 
 
 
387 aa  110  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  38.89 
 
 
387 aa  110  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1495  chromate transport protein  35.29 
 
 
188 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>