173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_5082 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03892  predicted transporter  64.18 
 
 
543 aa  644  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4256  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  64.18 
 
 
543 aa  644  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.471943  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4441  sodium-dependent inorganic phosphate  63.06 
 
 
543 aa  637  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72230  hypothetical protein  68.66 
 
 
582 aa  717  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.785925  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5082  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  100 
 
 
552 aa  1088  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0387022 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4564  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  64.18 
 
 
543 aa  644  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3770  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  62.22 
 
 
548 aa  636  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4483  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  64.85 
 
 
549 aa  669  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844603  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0163  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  95.29 
 
 
552 aa  1048  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4601  sodium-dependent inorganic phosphate  63.06 
 
 
543 aa  637  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.635464  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4473  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  63.99 
 
 
543 aa  641  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4010  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  64.18 
 
 
543 aa  644  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0189192 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0223  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  63.06 
 
 
543 aa  643  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.344534 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4443  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  73.85 
 
 
546 aa  759  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0034  Na/Pi cotransporter II-like  81.52 
 
 
552 aa  872  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.148674  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4402  sodium-dependent inorganic phosphate  63.06 
 
 
543 aa  637  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433029  normal  0.437823 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3977  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  64.18 
 
 
543 aa  644  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3948  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  61.84 
 
 
548 aa  637  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00173095  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0145  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  95.29 
 
 
552 aa  1049  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.610668  normal  0.131446 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03852  hypothetical protein  64.18 
 
 
543 aa  644  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0161  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  94.2 
 
 
552 aa  1036  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5490  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  64.18 
 
 
543 aa  646  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6270  hypothetical protein  68.84 
 
 
582 aa  721  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0118  Na/Pi cotransporter family protein  80.51 
 
 
550 aa  847  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4524  sodium-dependent inorganic phosphate  63.06 
 
 
543 aa  637  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0767506  normal  0.405258 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4514  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  64.18 
 
 
543 aa  643  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4527  sodium-dependent inorganic phosphate  63.06 
 
 
543 aa  637  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0069  Na+/Pi-cotransporter:Na/Pi cotransporter II-related  81.11 
 
 
550 aa  862  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0371  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  61.65 
 
 
548 aa  617  1e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0461  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  60.07 
 
 
548 aa  610  1e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01780  Na/Pi cotransporter II protein  62.07 
 
 
568 aa  591  1e-167  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0218  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  56.8 
 
 
562 aa  578  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.720634  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0751  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  60.53 
 
 
570 aa  580  1e-164  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0476826  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4205  Na+/phosphate symporter  56.8 
 
 
565 aa  550  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0511  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  56.72 
 
 
561 aa  542  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.791872  normal  0.154315 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0365  Na/Pi cotransporter II-related  52.82 
 
 
563 aa  542  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0312  Na/Pi cotransporter II-related  54.14 
 
 
558 aa  539  1e-152  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3231  Na/Pi-cotransporter II-related protein  47.21 
 
 
552 aa  476  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3461  Na/Pi-cotransporter II-related protein  45.35 
 
 
576 aa  465  1e-130  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.677583 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5386  Na/Pi-cotransporter II-related protein  45.86 
 
 
577 aa  465  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.626198  normal  0.600286 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3401  Na/Pi-cotransporter II-related protein  45.56 
 
 
556 aa  460  1e-128  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.161334  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2737  Na/Pi-cotransporter II-related protein  45.56 
 
 
556 aa  459  1e-128  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.751665  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1104  Na/Pi-cotransporter II-related protein  47.4 
 
 
559 aa  455  1e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178797 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1260  Na/Pi-cotransporter II-related protein  45.34 
 
 
553 aa  443  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.170885  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3851  Na/Pi cotransporter II-related  48.11 
 
 
553 aa  443  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1430  Na/Pi cotransporter II-related  45.66 
 
 
548 aa  430  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2073  Na/Pi cotransporter II-related  39.51 
 
 
563 aa  380  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209133  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3921  putative Na+/phosphate transporter  37.66 
 
 
565 aa  356  6e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146511  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0455  Na/Pi-cotransporter II-related protein  38.79 
 
 
565 aa  341  2e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.147011 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1406  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  35.09 
 
 
548 aa  306  7e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.677902  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4223  Na/Pi-cotransporter II-related protein  37.18 
 
 
562 aa  303  4e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149684  normal  0.481953 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9037  hypothetical protein  36.33 
 
 
561 aa  303  5e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4758  Na/Pi-cotransporter II-related protein  36.4 
 
 
601 aa  300  5e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554336  normal  0.516218 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4873  Na+cotransporter  32.65 
 
 
557 aa  296  5e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00339774  normal  0.833034 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1792  Na/Pi-cotransporter II-related protein  36.83 
 
 
553 aa  291  2e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1871  Na/Pi cotransporter II-related  32.9 
 
 
548 aa  290  6e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860374  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3965  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  36.67 
 
 
547 aa  289  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.162548  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0141  Na+/Pi-cotransporter  32.85 
 
 
556 aa  285  1e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1481  Na/Pi-cotransporter family protein  32.6 
 
 
558 aa  284  2e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1685  Na+ cotransporter  32.67 
 
 
560 aa  282  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1437  Na/Pi-cotransporter family protein  32.42 
 
 
558 aa  281  2e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2784  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  33.64 
 
 
548 aa  265  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.407322 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0855  Na+/Pi-cotransporter  32.33 
 
 
548 aa  258  3e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3048  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  33.7 
 
 
548 aa  254  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.235169 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7452  putative Na+/phosphate symporter  32.97 
 
 
578 aa  253  4e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0337065  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3286  hypothetical protein  37.81 
 
 
561 aa  253  7e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.969266  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4023  Na+/Pi-cotransporter  38.27 
 
 
561 aa  248  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3291  putative Na+/phosphate symporter  38.27 
 
 
564 aa  242  1e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0969  Na+/Pi-cotransporter family protein  30.87 
 
 
562 aa  230  6e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0614993  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2745  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.16 
 
 
567 aa  217  5e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0272264  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1817  Na/Pi cotransporter II-related  30.11 
 
 
535 aa  214  4e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0816  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  32.48 
 
 
542 aa  211  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.568995  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63750  hypothetical protein  34.22 
 
 
555 aa  208  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0197236  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5541  hypothetical protein  34.78 
 
 
555 aa  207  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510391  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1378  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.1 
 
 
556 aa  197  4e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  1.90084e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0990  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.6 
 
 
566 aa  194  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  5.11336e-08  hitchhiker  0.000255335 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1685  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.09 
 
 
563 aa  194  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00916616  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1264  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.5 
 
 
558 aa  192  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2362  putative transporter  23.43 
 
 
537 aa  189  9e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000947639  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2677  Na/Pi-cotransporter family protein/PhoU family protein  23.05 
 
 
537 aa  186  7e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.227034  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0057  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.5 
 
 
549 aa  169  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0512585  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1672  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.69 
 
 
565 aa  169  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0649  Na/Pi-cotransporter II-related protein  23.76 
 
 
551 aa  169  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  1.07719e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0220  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.1 
 
 
541 aa  167  5e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.759835  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0948  Na/Pi-cotransporter family protein  24.72 
 
 
551 aa  167  6e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.88119e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0880  Na/Pi-cotransporter family protein  24.13 
 
 
551 aa  166  1e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17253e-34 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1692  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.1 
 
 
541 aa  166  1e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2381  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.51 
 
 
643 aa  165  2e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0850551  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0696  sodium-dependent phosphate transporter  23.94 
 
 
551 aa  165  2e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.23681e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0476  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.27 
 
 
586 aa  165  2e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0785  Na/Pi-cotransporter family protein  24.54 
 
 
551 aa  165  2e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  4.37184e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0748  Na/Pi-cotransporter family protein  24.54 
 
 
551 aa  165  2e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000512565  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0878  Na/Pi-cotransporter family protein  24.13 
 
 
544 aa  164  5e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  2.42556e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0908  Na/Pi-cotransporter II-related protein  23.81 
 
 
541 aa  164  5e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4496  Na/Pi-cotransporter family protein  24.13 
 
 
551 aa  163  7e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  1.04541e-08  decreased coverage  5.21204e-15 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1501  Na/Pi-cotransporter II-related protein  23.21 
 
 
539 aa  162  1e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0840  Na/Pi-cotransporter family protein  24.35 
 
 
551 aa  162  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0001183  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0683  sodium-dependent phosphate transporter  23.94 
 
 
551 aa  161  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  2.53455e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0092  Na/Pi-cotransporter II-related protein  23.66 
 
 
555 aa  157  5e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1525  Na/Pi-cotransporter II-related protein  23.86 
 
 
541 aa  157  5e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>