More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_5060 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  39.01 
 
 		 8682 aa  2549    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  62.81 
 
 		 5218 aa  3699    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  41.76 
 
 		 9030 aa  2673    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  39.7 
 
 		 6753 aa  2791    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  100 
 
 		 5962 aa  11260    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  42.94 
 
 		 4678 aa  504  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  35.29 
 
 		 7149 aa  436  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.54 
 
 		 5839 aa  434  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.06 
 
 		 4836 aa  423  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  35.96 
 
 		 6662 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.96 
 
 		 6683 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.42 
 
 		 2239 aa  404  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  35.05 
 
 		 6779 aa  399  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.5 
 
 		 4122 aa  355  2e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.59 
 
 		 5787 aa  345  2e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  32.47 
 
 		 4848 aa  325  1.9999999999999998e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  36.72 
 
 		 2542 aa  238  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  45.39 
 
 		 4285 aa  227  4e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  40.74 
 
 		 3259 aa  197  7e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  40.15 
 
 		 5444 aa  189  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.01 
 
 		 4220 aa  138  3.9999999999999996e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  29.45 
 
 		 1699 aa  126  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  50 
 
 		 2768 aa  122  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  43.18 
 
 		 2524 aa  122  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  40.83 
 
 		 4214 aa  122  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  44.1 
 
 		 5442 aa  122  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0594  von Willebrand factor, type A  43.43 
 
 		 686 aa  119  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.855968  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  53.21 
 
 		 16322 aa  119  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0681  structural toxin protein RtxA  28.32 
 
 		 7919 aa  117  9e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1310  hypothetical protein  44.38 
 
 		 542 aa  113  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0330443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  42.77 
 
 		 1166 aa  112  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  45.34 
 
 		 2887 aa  111  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  41.81 
 
 		 4854 aa  110  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0699  structural toxin protein RtxA  28.42 
 
 		 7679 aa  108  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  44.88 
 
 		 2812 aa  107  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  41.03 
 
 		 8321 aa  104  7e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1806  hemolysin-type calcium-binding region  33.12 
 
 		 3184 aa  102  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.387385 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4420  hypothetical protein  52.98 
 
 		 912 aa  101  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0816667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  42.76 
 
 		 2743 aa  99.8  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  42.36 
 
 		 3229 aa  98.2  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  36.69 
 
 		 2704 aa  97.8  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  42.26 
 
 		 260 aa  97.8  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  45.61 
 
 		 4106 aa  96.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  39.11 
 
 		 16311 aa  97.1  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  37.99 
 
 		 1883 aa  94.4  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  40.26 
 
 		 5769 aa  93.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  44 
 
 		 2452 aa  93.6  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  37.66 
 
 		 4791 aa  92.4  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  46.79 
 
 		 2251 aa  92  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  39.29 
 
 		 202 aa  88.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  39.29 
 
 		 202 aa  88.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0747  outer membrane adhesin like proteiin  49.09 
 
 		 1598 aa  88.6  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.525894 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  40.4 
 
 		 980 aa  87.8  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  55 
 
 		 2346 aa  86.7  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  41.03 
 
 		 2105 aa  86.7  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  37.82 
 
 		 5171 aa  85.9  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  45.16 
 
 		 1164 aa  86.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  55.06 
 
 		 475 aa  86.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.41 
 
 		 1795 aa  85.9  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  35 
 
 		 686 aa  86.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  41.06 
 
 		 460 aa  85.9  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  43.66 
 
 		 946 aa  85.9  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  53.93 
 
 		 3314 aa  85.5  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1029  hemolysin-type calcium-binding region  27.08 
 
 		 1529 aa  85.1  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297534 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  53.93 
 
 		 475 aa  85.1  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  43.36 
 
 		 1424 aa  84  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6263  hemolysin-type calcium-binding region  35.53 
 
 		 260 aa  83.2  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0113819 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1997  Hemolysin-type calcium-binding region  47.47 
 
 		 786 aa  83.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.177214 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  42.77 
 
 		 3619 aa  83.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  42.14 
 
 		 3619 aa  82.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  51.65 
 
 		 485 aa  82.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0008  Hemolysin-type calcium-binding region  35.59 
 
 		 2336 aa  82.8  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  34 
 
 		 9867 aa  83.2  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3548  glycoside hydrolase family 16  39.73 
 
 		 486 aa  82.8  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0276  outer membrane adhesin like proteiin  46.6 
 
 		 3091 aa  82  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.26 
 
 		 2067 aa  82  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  55 
 
 		 1499 aa  81.6  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.46 
 
 		 1553 aa  81.6  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  41.27 
 
 		 820 aa  81.6  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  40.85 
 
 		 219 aa  81.6  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  38.78 
 
 		 3182 aa  81.6  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1560  heme peroxidase  41.91 
 
 		 3094 aa  81.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.508144 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  56.25 
 
 		 1156 aa  80.9  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  41.13 
 
 		 491 aa  80.9  0.0000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1998  Hemolysin-type calcium-binding region  51.14 
 
 		 817 aa  80.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0671214 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3922  hemolysin-type calcium-binding protein  39.47 
 
 		 313 aa  80.9  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  40.33 
 
 		 219 aa  80.5  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3160  hemolysin-type calcium-binding region  64.06 
 
 		 523 aa  80.5  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.243046 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  39.78 
 
 		 585 aa  80.5  0.0000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  39.25 
 
 		 582 aa  79.3  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  51.55 
 
 		 467 aa  79.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1637  VCBS  38.5 
 
 		 2127 aa  79.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  59.72 
 
 		 1538 aa  79.7  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  38 
 
 		 813 aa  79.3  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  36.6 
 
 		 615 aa  79  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2705  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  50 
 
 		 517 aa  79.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4562  hemolysin-type calcium-binding region  36.97 
 
 		 245 aa  79  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  40.56 
 
 		 4798 aa  79  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.65 
 
 		 2678 aa  78.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3878  lipase  47.25 
 
 		 709 aa  78.2  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0292806 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>