More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_5013 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0205  putative oxidoreductase  95.64 
 
 
574 aa  1142    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.321427  normal  0.765338 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4093  putative oxidoreductase  81.05 
 
 
574 aa  987    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.668775  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3676  putative oxidoreductase  67.31 
 
 
582 aa  800    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5013  putative oxidoreductase  100 
 
 
574 aa  1200    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2801  putative oxidoreductase  67.6 
 
 
578 aa  810    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.312547  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1887  putative oxidoreductase  81.18 
 
 
579 aa  985    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217811  normal  0.846517 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0678  putative oxidoreductase  65.02 
 
 
578 aa  788    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.434606 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4067  putative oxidoreductase  62.14 
 
 
569 aa  744    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.594531 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3785  putative oxidoreductase/HEAT repeat-containing protein  59.61 
 
 
954 aa  686    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824517  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3163  putative oxidoreductase  86.12 
 
 
576 aa  1053    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.410228  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5287  putative oxidoreductase  81.01 
 
 
579 aa  984    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0886566 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1478  putative oxidoreductase  66.08 
 
 
591 aa  780    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4884  putative oxidoreductase  66.78 
 
 
578 aa  798    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245713  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3351  putative oxidoreductase  67.49 
 
 
582 aa  801    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.583827  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6149  putative oxidoreductase  67.43 
 
 
583 aa  793    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6105  putative oxidoreductase  80.31 
 
 
579 aa  962    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224874  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4205  putative oxidoreductase  81.05 
 
 
574 aa  987    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4191  putative oxidoreductase  68.2 
 
 
580 aa  805    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991116  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4196  putative oxidoreductase  66.43 
 
 
580 aa  780    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.616255  normal  0.708004 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1960  putative oxidoreductase  81.36 
 
 
579 aa  988    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34900  putative oxidoreductase  85.19 
 
 
574 aa  1037    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000183064  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1972  putative oxidoreductase  80.49 
 
 
579 aa  964    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1298  putative oxidoreductase  82.58 
 
 
579 aa  1004    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.10343 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1996  putative oxidoreductase  80.49 
 
 
579 aa  965    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2224  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  42.48 
 
 
610 aa  444  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0271  putative oxidoreductase  36.56 
 
 
573 aa  367  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.144882 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02120  adenylylsulfate reductase subunit alpha  31.34 
 
 
574 aa  267  2.9999999999999995e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0788  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  29.55 
 
 
579 aa  234  3e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1710  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.3 
 
 
594 aa  232  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2057  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.82 
 
 
556 aa  212  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1191  adenylylsulfate reductase subunit alpha  28 
 
 
563 aa  194  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1830  adenylylsulfate reductase subunit alpha  27.31 
 
 
566 aa  173  9e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0924  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.89 
 
 
590 aa  171  4e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1080  adenylylsulfate reductase subunit alpha  26.59 
 
 
635 aa  163  8.000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1048  adenylylsulfate reductase subunit alpha  26.38 
 
 
634 aa  161  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0255965  normal  0.0162611 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0065  adenylylsulfate reductase, alpha subunit  26.28 
 
 
632 aa  158  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.683279  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2282  adenylylsulfate reductase subunit alpha  25.75 
 
 
622 aa  157  7e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0350  adenylylsulfate reductase subunit alpha  25.96 
 
 
622 aa  156  8e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.823555  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1428  adenylylsulfate reductase subunit alpha  27.04 
 
 
627 aa  156  9e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.102541 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1235  adenylylsulfate reductase subunit alpha  26.87 
 
 
629 aa  148  3e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1889  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.17 
 
 
591 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000177663  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  25.79 
 
 
568 aa  147  5e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3522  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.17 
 
 
564 aa  147  8.000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000707251  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0273  adenylylsulfate reductase subunit alpha  26.51 
 
 
635 aa  140  7e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.00000000319347  hitchhiker  0.0000001391 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3577  adenylylsulfate reductase subunit alpha  25.6 
 
 
625 aa  137  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000483589  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0637  adenylylsulfate reductase subunit alpha  25.38 
 
 
624 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0998  adenylylsulfate reductase subunit alpha  24.6 
 
 
659 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000010424  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5284  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  25.87 
 
 
563 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1885  adenylylsulfate reductase subunit alpha  25.38 
 
 
629 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00911706  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.13 
 
 
578 aa  125  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0677  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.09 
 
 
566 aa  124  3e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0486405  hitchhiker  0.0000605931 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1425  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.73 
 
 
588 aa  124  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00837732  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2816  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.42 
 
 
588 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0572429  normal  0.870607 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1206  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  25.44 
 
 
596 aa  121  3.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0039  adenylylsulfate reductase subunit alpha  24.4 
 
 
658 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0540157  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1114  succinate dehydrogenase subunit A  25.72 
 
 
573 aa  119  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.358332  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1869  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.92 
 
 
598 aa  119  1.9999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.462567  normal  0.466053 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1687  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.43 
 
 
575 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0263858 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1612  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.35 
 
 
590 aa  118  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1585  adenylylsulfate reductase subunit alpha  23.83 
 
 
657 aa  118  3e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000155329  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1835  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.51 
 
 
588 aa  118  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0132672  normal  0.110124 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2952  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.91 
 
 
600 aa  118  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.090106  decreased coverage  0.000187391 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004114  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.96 
 
 
588 aa  118  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3278  fumarate reductase flavoprotein subunit  23.26 
 
 
603 aa  118  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2358  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.11 
 
 
581 aa  117  5e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.479481  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1653  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.14 
 
 
588 aa  117  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00109405  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1265  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.42 
 
 
588 aa  117  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.648217  normal  0.132874 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0140  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.74 
 
 
542 aa  117  5e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1882  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.12 
 
 
575 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.764609  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0887  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.85 
 
 
583 aa  117  6e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1856  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.12 
 
 
575 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0210  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  24.32 
 
 
579 aa  117  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1569  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.91 
 
 
575 aa  116  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2127  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.43 
 
 
582 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2510  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.91 
 
 
588 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000247676  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4278  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.27 
 
 
605 aa  114  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0671  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.34 
 
 
581 aa  115  3e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.745903 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1633  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.83 
 
 
588 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00339414  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1708  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.83 
 
 
588 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.563088  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3894  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.93 
 
 
605 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.197251  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1708  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.83 
 
 
588 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0194037  normal  0.398143 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  23.27 
 
 
532 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01353  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.44 
 
 
588 aa  114  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1224  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.87 
 
 
588 aa  114  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0959958 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1388  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.99 
 
 
580 aa  114  5e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.394605 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2217  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25 
 
 
588 aa  114  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2254  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.91 
 
 
588 aa  113  7.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.453422  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2007  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.75 
 
 
590 aa  113  9e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.82203  normal  0.426549 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.76 
 
 
605 aa  113  9e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.609874  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1834  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.74 
 
 
588 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00255629  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1675  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.35 
 
 
588 aa  113  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.506283  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2185  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.08 
 
 
588 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00800222  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12591  succinate dehydrogenase  24.5 
 
 
584 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0949259  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2517  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.74 
 
 
588 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000102318  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2630  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.74 
 
 
588 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0015925  normal  0.0726397 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3691  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.74 
 
 
590 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44030  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.74 
 
 
590 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04830  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.49 
 
 
595 aa  111  3e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0174  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  25.59 
 
 
542 aa  111  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0476634  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2345  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.78 
 
 
588 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00170465  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>