77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4829 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4829  hypothetical protein  100 
 
 		 52 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.658257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0399  hypothetical protein  98.08 
 
 		 52 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.350701  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0373  hypothetical protein  96.15 
 
 		 52 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.485112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0403  hypothetical protein  96.15 
 
 		 52 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5163  hypothetical protein  94.23 
 
 		 52 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129995 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1072  hypothetical protein  84.62 
 
 		 57 aa  89.4  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0505681  hitchhiker  0.0000834558 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4676  hypothetical protein  82.69 
 
 		 53 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00000747615  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0507  hypothetical protein  82.69 
 
 		 53 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1753  Pmp3 family protein  80.77 
 
 		 52 aa  88.2  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000804754  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1445  hypothetical protein  82.69 
 
 		 52 aa  87.8  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.344873  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3915  hypothetical protein  80.77 
 
 		 55 aa  86.3  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.932934 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2519  hypothetical protein  80.39 
 
 		 52 aa  84.7  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0701281  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0694  hypothetical protein  80.39 
 
 		 52 aa  84.7  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1757  protein of unknown function UPF0057  78.85 
 
 		 52 aa  83.6  9e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.575281 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0810  hypothetical protein  78.85 
 
 		 52 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3802  hypothetical protein  75 
 
 		 52 aa  82.8  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4039  hypothetical protein  94.23 
 
 		 74 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.255953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0670  hypothetical protein  94.23 
 
 		 52 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.741123  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1940  protein of unknown function UPF0057  78.85 
 
 		 52 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07370  hypothetical protein  94.23 
 
 		 52 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.400909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0952  hypothetical protein  73.08 
 
 		 53 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000215986  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3465  hypothetical protein  71.15 
 
 		 52 aa  81.3  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3187  hypothetical protein  71.15 
 
 		 52 aa  80.9  0.000000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00459993  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1909  hypothetical protein  73.08 
 
 		 52 aa  80.1  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0986312 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6707  protein of unknown function UPF0057  69.23 
 
 		 52 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570236  normal  0.473948 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5980  stress induced protein  69.23 
 
 		 52 aa  77.8  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04740  hypothetical protein  84.62 
 
 		 52 aa  77.4  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4140  hypothetical protein  86.54 
 
 		 52 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.520127  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1824  hypothetical protein  70.59 
 
 		 56 aa  76.3  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.248733 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3215  protein of unknown function UPF0057  73.08 
 
 		 54 aa  73.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2905  protein of unknown function UPF0057  73.08 
 
 		 54 aa  73.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1257  hypothetical protein  84.62 
 
 		 52 aa  71.6  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0887  hypothetical protein  67.92 
 
 		 55 aa  70.9  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.141786 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4529  protein of unknown function UPF0057  73.08 
 
 		 52 aa  65.5  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2734  hypothetical protein  61.54 
 
 		 52 aa  62.8  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2801  hypothetical protein  62.75 
 
 		 52 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02522  predicted membrane protein  62.75 
 
 		 52 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1017  protein of unknown function UPF0057  62.75 
 
 		 52 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02486  hypothetical protein  62.75 
 
 		 52 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3908  hypothetical protein  62.75 
 
 		 52 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.363662 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3215  hypothetical protein  62.75 
 
 		 52 aa  60.8  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2786  hypothetical protein  62.75 
 
 		 52 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.313284 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1040  hypothetical protein  62.75 
 
 		 52 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2946  hypothetical protein  62.75 
 
 		 52 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3147  hypothetical protein  57.69 
 
 		 52 aa  60.8  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000486244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3317  protein of unknown function UPF0057  51.92 
 
 		 58 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2993  hypothetical protein  61.54 
 
 		 52 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.761732  normal  0.0250059 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3098  hypothetical protein  61.54 
 
 		 52 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.532788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2909  hypothetical protein  61.54 
 
 		 52 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2941  hypothetical protein  61.54 
 
 		 52 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0778428 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2976  hypothetical protein  61.54 
 
 		 52 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.318311  normal  0.0724443 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0450  hypothetical protein  50.98 
 
 		 56 aa  57.4  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0361  protein of unknown function UPF0057  48.08 
 
 		 58 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.869004  normal  0.794905 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01010  cation transport-related protein, putative  70 
 
 		 57 aa  55.5  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.249867  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1858  hypothetical protein  46 
 
 		 57 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.208589 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1531  hypothetical protein  62.5 
 
 		 58 aa  52  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.647152 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31254  predicted protein  46.94 
 
 		 52 aa  52  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2651  hypothetical protein  52.5 
 
 		 66 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45467  predicted protein  47.06 
 
 		 144 aa  50.8  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.564065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3240  hypothetical protein  50 
 
 		 54 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.696832  normal  0.0916248 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3564  protein of unknown function UPF0057  50 
 
 		 54 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.295411  normal  0.13478 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3712  protein of unknown function UPF0057  50 
 
 		 53 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0309  hypothetical protein  75 
 
 		 52 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2324  hypothetical protein  47.73 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.653065  normal  0.0692425 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3436  protein of unknown function UPF0057  46 
 
 		 54 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.668514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1812  salt-stress induced hydrophobic peptide  46.03 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02312  stress response RCI peptide, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10590)  45.1 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000114001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_36994  predicted protein  41.18 
 
 		 81 aa  46.2  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.384013  normal  0.185346 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02650  hypothetical protein  51.28 
 
 		 51 aa  44.7  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001339  plasma membrane protein involved in salt tolerance  34 
 
 		 54 aa  44.3  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.9667  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0895  hypothetical protein  43.59 
 
 		 54 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56298  predicted protein  40 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.727803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2980  protein of unknown function UPF0057  58.82 
 
 		 55 aa  40.8  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0290  hypothetical protein  43.59 
 
 		 55 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.710224  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0302  protein of unknown function UPF0057  43.59 
 
 		 55 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.390806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0298  hypothetical protein  43.59 
 
 		 55 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.571873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0297  hypothetical protein  43.59 
 
 		 55 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00916161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>