288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4803 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_4803  diadenosine tetraphosphatase  100 
 
 
288 aa  589  1e-167  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.817765  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0433  diadenosine tetraphosphatase  89.9 
 
 
288 aa  537  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0399  diadenosine tetraphosphatase  89.9 
 
 
288 aa  537  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0430  diadenosine tetraphosphatase  89.9 
 
 
288 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213762  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5137  diadenosine tetraphosphatase  73.67 
 
 
293 aa  437  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4015  diadenosine tetraphosphatase  75.46 
 
 
272 aa  425  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0734  diadenosine tetraphosphatase  71.89 
 
 
283 aa  418  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0549  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase, symmetrical  72.49 
 
 
300 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07700  diadenosine tetraphosphatase  74.54 
 
 
283 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0256257 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46850  diadenosine tetraphosphatase  71.38 
 
 
277 aa  405  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4629  diadenosine tetraphosphatase  67.13 
 
 
291 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.475096 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1049  diadenosine tetraphosphatase  54.07 
 
 
275 aa  303  2.0000000000000002e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0099941  normal  0.793665 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3506  diadenosine tetraphosphatase  50.74 
 
 
267 aa  288  5.0000000000000004e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.767842  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0735  diadenosine tetraphosphatase  52.42 
 
 
271 aa  282  5.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0922  diadenosine tetraphosphatase  53.36 
 
 
272 aa  276  4e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0753757  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00053  diadenosinetetraphosphatase  52.08 
 
 
280 aa  270  2e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3550  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  52.08 
 
 
280 aa  270  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00052  hypothetical protein  52.08 
 
 
280 aa  270  2e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0043  diadenosine tetraphosphatase  52.08 
 
 
280 aa  270  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0053  diadenosine tetraphosphatase  52.08 
 
 
282 aa  270  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.627509  normal  0.566701 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3606  diadenosine tetraphosphatase  52.08 
 
 
280 aa  270  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367142 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0099  diadenosine tetraphosphatase  51.32 
 
 
282 aa  269  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0093  diadenosine tetraphosphatase  51.32 
 
 
282 aa  269  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.413361 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0097  diadenosine tetraphosphatase  51.32 
 
 
282 aa  269  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0092  diadenosine tetraphosphatase  51.32 
 
 
282 aa  269  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.533237 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0094  diadenosine tetraphosphatase  51.32 
 
 
282 aa  269  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0055  diadenosine tetraphosphatase  51.7 
 
 
280 aa  269  4e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2728  diadenosine tetraphosphatase  51.47 
 
 
270 aa  269  4e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0053  diadenosine tetraphosphatase  51.7 
 
 
280 aa  269  4e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0296879  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0054  diadenosine tetraphosphatase  51.7 
 
 
282 aa  268  5e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.257316  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3834  diadenosine tetraphosphatase  49.81 
 
 
281 aa  268  8e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0722  diadenosine tetraphosphatase  50.19 
 
 
283 aa  267  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.914947 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3637  diadenosine tetraphosphatase  48.68 
 
 
281 aa  259  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0561  diadenosine tetraphosphatase  50.19 
 
 
281 aa  259  3e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1197  diadenosine tetraphosphatase  49.25 
 
 
278 aa  259  3e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0643097  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0206  diadenosine tetraphosphatase  48.19 
 
 
275 aa  259  4e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0600  diadenosine tetraphosphatase  48.3 
 
 
280 aa  256  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0467  diadenosine tetraphosphatase  49.07 
 
 
277 aa  257  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0215595  normal  0.520135 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0223  diadenosine tetraphosphatase  46.62 
 
 
279 aa  257  2e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3932  diadenosine tetraphosphatase  49.45 
 
 
276 aa  256  3e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0774  diadenosine tetraphosphatase  49.43 
 
 
289 aa  256  3e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0469096  normal  0.0479876 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0598  diadenosine tetraphosphatase  47.92 
 
 
282 aa  255  6e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.158681  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3575  diadenosine tetraphosphatase  49.06 
 
 
289 aa  254  8e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1983  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  51.92 
 
 
275 aa  254  8e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26306  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3446  diadenosine tetraphosphatase  49.06 
 
 
289 aa  254  9e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.645105  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3454  diadenosine tetraphosphatase  50.38 
 
 
265 aa  251  1e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2156  diadenosine tetraphosphatase  46.59 
 
 
281 aa  250  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.699429 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0240  diadenosine tetraphosphatase  50.39 
 
 
279 aa  248  7e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.589484  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3200  diadenosine tetraphosphatase  47.69 
 
 
285 aa  248  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.238496 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0367  diadenosine tetraphosphatase  49.07 
 
 
273 aa  247  2e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0168  diadenosine tetraphosphatase  46.84 
 
 
273 aa  246  4e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.049626 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1518  diadenosine tetraphosphatase  43.75 
 
 
284 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.635994  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2384  diadenosine tetraphosphatase  47.76 
 
 
273 aa  244  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1281  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  47.13 
 
 
287 aa  244  9.999999999999999e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2854  diadenosine tetraphosphatase  48.13 
 
 
273 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.772738 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3856  diadenosine tetraphosphatase  43.55 
 
 
283 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.605525  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0159  diadenosine tetraphosphatase  48.46 
 
 
278 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0562  diadenosine tetraphosphatase  46.09 
 
 
288 aa  239  2.9999999999999997e-62  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1345  diadenosine tetraphosphatase  45.59 
 
 
278 aa  239  5e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.399511  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0262  diadenosine tetraphosphatase  46.33 
 
 
279 aa  237  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2859  diadenosine tetraphosphatase  47.37 
 
 
269 aa  237  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000394159  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1149  diadenosine tetraphosphatase  47.08 
 
 
280 aa  236  4e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1064  diadenosine tetraphosphatase  47.86 
 
 
281 aa  235  6e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.512077  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0743  diadenosine tetraphosphatase  47.81 
 
 
279 aa  235  7e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0760  diadenosine tetraphosphatase  47.41 
 
 
279 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.406612 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1658  diadenosine tetraphosphatase  44.44 
 
 
282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0876  diadenosine tetraphosphatase  47.41 
 
 
292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.461919 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1143  diadenosine tetraphosphatase  47.86 
 
 
281 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.281223  normal  0.514398 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0877  diadenosine tetraphosphatase  43.98 
 
 
274 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2993  diadenosine tetraphosphatase  49.61 
 
 
276 aa  234  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2853  diadenosine tetraphosphatase  49.61 
 
 
276 aa  234  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001667  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase (symmetrical)  46.67 
 
 
268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2736  diadenosine tetraphosphatase  48.85 
 
 
293 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1046  diadenosine tetraphosphatase  46.3 
 
 
276 aa  233  3e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.78168  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3081  diadenosine tetraphosphatase  44.24 
 
 
272 aa  231  1e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3805  diadenosine tetraphosphatase  48.21 
 
 
292 aa  230  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2518  diadenosine tetraphosphatase  45.88 
 
 
278 aa  230  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.284049 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0666  diadenosine tetraphosphatase  45.17 
 
 
344 aa  230  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00806  diadenosine tetraphosphatase  47.08 
 
 
268 aa  229  3e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3027  diadenosine tetraphosphatase  44.11 
 
 
282 aa  229  5e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.591029  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3968  diadenosine tetraphosphatase  47.01 
 
 
279 aa  228  8e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.383712  normal  0.638877 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0097  diadenosine tetraphosphatase  44.03 
 
 
291 aa  228  9e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0908  diadenosine tetraphosphatase  44.78 
 
 
278 aa  228  1e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00140647  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1468  diadenosine tetraphosphatase  46.43 
 
 
282 aa  228  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.85659  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0841  diadenosine tetraphosphatase  46.48 
 
 
279 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00290055 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1354  diadenosine tetraphosphatase  47.17 
 
 
294 aa  226  4e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.226554  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2085  diadenosine tetraphosphatase  44.03 
 
 
291 aa  226  4e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1290  diadenosine tetraphosphatase  47.17 
 
 
295 aa  226  4e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0711  diadenosine tetraphosphatase  47.62 
 
 
277 aa  224  9e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0625  diadenosine tetraphosphatase  47.27 
 
 
282 aa  224  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0388  diadenosine tetraphosphatase  46.43 
 
 
279 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0870  diadenosine tetraphosphatase  46.43 
 
 
279 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211203  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03416  diadenosine tetraphosphatase  43.56 
 
 
275 aa  223  3e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0436512  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2321  diadenosine tetraphosphatase  45.67 
 
 
282 aa  223  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.127373 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1558  diadenosine tetraphosphatase  43.4 
 
 
273 aa  223  3e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1077  diadenosine tetraphosphatase  43.82 
 
 
274 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.944594  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0681  diadenosine tetraphosphatase  48.43 
 
 
283 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0573  diadenosine tetraphosphatase  45.22 
 
 
296 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0975  diadenosine tetraphosphatase  44.19 
 
 
274 aa  221  7e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.382734  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1044  diadenosine tetraphosphatase  43.82 
 
 
274 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.395277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>