182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4795 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_4795  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  100 
 
 
254 aa  500  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.424531  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0407  heat shock protein DnaJ domain protein  87.06 
 
 
255 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0441  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  86.67 
 
 
255 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.524438  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0438  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  86.27 
 
 
255 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5129  heat shock protein DnaJ-like  66.54 
 
 
255 aa  342  4e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.583171  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0557  DnaJ-like protein DjlA, putative  59.45 
 
 
255 aa  291  5e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4621  heat shock protein DnaJ, N-terminal  59.06 
 
 
255 aa  290  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418995  normal  0.628986 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4007  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  60 
 
 
253 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0742  hypothetical protein  53.15 
 
 
252 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0971129  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07800  hypothetical protein  51.97 
 
 
252 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0234725 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46770  heat shock protein DnaJ-like protein  53.15 
 
 
253 aa  184  8e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0104  Dna-J like membrane chaperone protein  29.15 
 
 
271 aa  113  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000467525  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1907  Dna-J like membrane chaperone protein  30.57 
 
 
271 aa  110  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2075  Dna-J like membrane chaperone protein  29.89 
 
 
270 aa  110  3e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000570933  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2106  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  32.17 
 
 
260 aa  108  8.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0020  Dna-J like membrane chaperone protein  35.51 
 
 
276 aa  107  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1055  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.37 
 
 
267 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00001887  normal  0.815768 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0910  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.61 
 
 
268 aa  105  5e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.2781  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0100  heat shock protein DnaJ-like protein  34.62 
 
 
257 aa  105  8e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0892  Dna-J like membrane chaperone protein  31.33 
 
 
257 aa  103  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.448212  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03410  Dna-J like membrane chaperone protein  29.07 
 
 
288 aa  102  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3415  Dna-J like membrane chaperone protein  25.17 
 
 
284 aa  99.4  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.258634  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1051  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28.05 
 
 
268 aa  97.4  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0059  Dna-J like membrane chaperone protein  29.56 
 
 
271 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000613097  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3569  Dna-J like membrane chaperone protein  29.79 
 
 
277 aa  96.3  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000771944  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0768  Dna-J like membrane chaperone protein  29.79 
 
 
277 aa  96.3  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128794  normal  0.0201885 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3544  heat shock protein DnaJ domain protein  29.56 
 
 
271 aa  95.5  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  3.15628e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0061  Dna-J like membrane chaperone protein  29.56 
 
 
271 aa  95.5  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000128159  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3600  Dna-J like membrane chaperone protein  29.56 
 
 
271 aa  95.5  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000271898  hitchhiker  0.00000323028 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0061  Dna-J like membrane chaperone protein  30.11 
 
 
271 aa  95.1  8e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000204638  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0059  Dna-J like membrane chaperone protein  29.56 
 
 
271 aa  95.1  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000026636  normal  0.688624 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00058  hypothetical protein  29.56 
 
 
271 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000167853  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00059  Dna-J like membrane chaperone protein  29.56 
 
 
271 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000486823  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3440  Dna-J like membrane chaperone protein  29.43 
 
 
277 aa  94.7  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000544251  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0100  Dna-J like membrane chaperone protein  29.39 
 
 
270 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000327368  normal  0.0501049 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0101  Dna-J like membrane chaperone protein  29.39 
 
 
270 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000130204  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0106  Dna-J like membrane chaperone protein  29.39 
 
 
270 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000540131  normal  0.839324 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0104  Dna-J like membrane chaperone protein  29.39 
 
 
270 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000141328  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0099  Dna-J like membrane chaperone protein  29.39 
 
 
270 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0868  Dna-J like membrane chaperone protein  28.35 
 
 
259 aa  93.6  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4522  Dna-J like membrane chaperone protein  29.78 
 
 
275 aa  93.2  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2882  Dna-J like membrane chaperone protein  28.29 
 
 
259 aa  92.8  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450671  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0604  Dna-J like membrane chaperone protein  28.83 
 
 
273 aa  92.8  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000356276  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0885  Dna-J like membrane chaperone protein  28.96 
 
 
258 aa  92.8  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00720639  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0049  Dna-J like membrane chaperone protein  28.83 
 
 
271 aa  92.4  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000477601  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3109  Dna-J like membrane chaperone protein  29.89 
 
 
262 aa  92.4  7e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0792555  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0728  Dna-J like membrane chaperone protein  29.56 
 
 
273 aa  90.9  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000304706  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0911  Dna-J like membrane chaperone protein  29.5 
 
 
262 aa  90.1  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0269993  normal  0.373919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3203  Dna-J like membrane chaperone protein  29.5 
 
 
262 aa  90.5  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.967283 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1747  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28.73 
 
 
251 aa  89.4  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000151297  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1085  Dna-J like membrane chaperone protein  28.19 
 
 
262 aa  89  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367802  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3633  Dna-J like membrane chaperone protein  28.41 
 
 
262 aa  88.2  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2813  Dna-J like membrane chaperone protein  29.28 
 
 
256 aa  87.8  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0603068  normal  0.639961 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2262  Dna-J like membrane chaperone protein  26.8 
 
 
296 aa  86.7  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0995  Dna-J like membrane chaperone protein  28.35 
 
 
262 aa  86.7  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.555246  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3073  Dna-J like membrane chaperone protein  29.57 
 
 
257 aa  85.9  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.70305  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1020  Dna-J like membrane chaperone protein  26.89 
 
 
259 aa  85.9  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.325317  normal  0.0319615 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2289  Dna-J like membrane chaperone protein  26.8 
 
 
296 aa  85.5  7e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0397  heat shock protein DnaJ-like  28.78 
 
 
250 aa  85.5  7e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1291  Dna-J like membrane chaperone protein  29.07 
 
 
289 aa  84.7  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000651268  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2989  Dna-J like membrane chaperone protein  33.33 
 
 
264 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.787211  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001661  DnaJ-like protein DjlA  28.52 
 
 
284 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0970  Dna-J like membrane chaperone protein  27.48 
 
 
259 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0207673  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2865  Dna-J like membrane chaperone protein  27.59 
 
 
284 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000787957  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00812  Dna-J like membrane chaperone protein  28.29 
 
 
286 aa  84  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0983  Dna-J like membrane chaperone protein  29.15 
 
 
262 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.193447  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1052  Dna-J like membrane chaperone protein  29.15 
 
 
262 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0982922  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0372  Dna-J like membrane chaperone protein  28.77 
 
 
283 aa  81.6  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3306  Dna-J like membrane chaperone protein  28.16 
 
 
262 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.044478  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2252  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.07 
 
 
266 aa  80.9  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3631  Dna-J like membrane chaperone protein  28.23 
 
 
291 aa  79  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.181642  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3828  Dna-J like membrane chaperone protein  28.24 
 
 
296 aa  76.6  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.985148  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0668  DnaJ domain-containing protein  20.93 
 
 
265 aa  70.9  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.165012  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1630  silent information regulator protein Sir2  21.83 
 
 
244 aa  70.1  0.00000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.071584  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0557  DnaJ domain-containing protein  23.45 
 
 
246 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.223519  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1837  DnaJ domain-containing protein  24.56 
 
 
264 aa  67  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0977  DnaJ domain-containing protein  24.24 
 
 
212 aa  66.6  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0827  DnaJ domain-containing protein  24.24 
 
 
212 aa  67  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3513  Fis family transcriptional regulator  31.22 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1034  DnaJ domain-containing protein  23.74 
 
 
212 aa  63.9  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0627693  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2408  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  27.8 
 
 
236 aa  64.3  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.553614  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0606  Dna-J like membrane chaperone protein  27.16 
 
 
305 aa  61.2  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21113  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0546  DnaJ-like protein  24.1 
 
 
256 aa  60.5  0.00000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2092  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  25.32 
 
 
233 aa  56.2  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.764372  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1897  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28.57 
 
 
235 aa  54.7  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.394264  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0880  heat shock protein DnaJ domain protein  27.1 
 
 
241 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161205  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0961  hypothetical protein  26.61 
 
 
257 aa  52.4  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.483965  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03720  DnaJ domain containing protein  23.48 
 
 
249 aa  52  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.338466  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0567  Dna-J like membrane chaperone protein  35.94 
 
 
318 aa  52  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0637761  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0217  heat shock protein DnaJ domain protein  45 
 
 
412 aa  52  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0826  heat shock protein DnaJ domain protein  25 
 
 
241 aa  50.8  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000315568  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4909  protein of unknown function DUF1332  27.14 
 
 
245 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.296192  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3389  heat shock protein DnaJ-like  23.38 
 
 
235 aa  50.1  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2868  protein of unknown function DUF1332  24.37 
 
 
235 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.96346 
 
 
-
 
NC_004310  BR2024  DnaJ domain-containing protein  42.62 
 
 
209 aa  49.7  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0763655  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1947  DnaJ domain-containing protein  42.62 
 
 
209 aa  49.7  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.673449  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0629  chaperone protein DnaJ  43.4 
 
 
393 aa  49.3  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0971  chaperone protein DnaJ  40 
 
 
359 aa  48.1  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4375  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  27.92 
 
 
240 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.283206  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0737  heat shock protein DnaJ domain protein  22.22 
 
 
227 aa  48.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.120141  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>