107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4784 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0418  GDSL family lipase  88.24 
 
 		 629 aa  1124    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0624363  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0569  autotransporting lipase, GDSL family  57.68 
 
 		 640 aa  726    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4606  Outer membrane autotransporter barrel  57.99 
 
 		 640 aa  717    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5117  Outer membrane autotransporter barrel  59.94 
 
 		 636 aa  730    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67510  esterase EstA  59.29 
 
 		 646 aa  744    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00791226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0452  outer membrane autotransporter  88.24 
 
 		 629 aa  1127    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5845  esterase EstA  60.89 
 
 		 646 aa  740    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0449  outer membrane autotransporter  86.12 
 
 		 626 aa  1085    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.616315  normal  0.432339 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4784  outer membrane autotransporter  100 
 
 		 629 aa  1274    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.336852 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3188  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.98 
 
 		 617 aa  159  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2645  outer membrane autotransporter  27.27 
 
 		 630 aa  158  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2327  outer membrane autotransporter  26.07 
 
 		 628 aa  147  6e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542072 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01843  lipase; esterase  28.4 
 
 		 594 aa  144  7e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0877  Outer membrane autotransporter barrel  26.48 
 
 		 628 aa  142  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1985  outer membrane autotransporter  26.17 
 
 		 597 aa  134  5e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0065  outer membrane autotransporter  25.7 
 
 		 662 aa  130  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2063  lipase/esterase  25.12 
 
 		 597 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0682  lipase 1  25.87 
 
 		 656 aa  112  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.668862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0616  lipase 1  25.87 
 
 		 656 aa  112  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0623  lipase 1  25.62 
 
 		 656 aa  110  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0738  lipase 1  26.09 
 
 		 584 aa  100  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1186  lipolytic protein  30.91 
 
 		 337 aa  97.4  7e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0756  Outer membrane autotransporter barrel  27.02 
 
 		 647 aa  97.1  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.745695 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3183  lipolytic protein  30.12 
 
 		 349 aa  87.4  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0162266 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3849  Outer membrane autotransporter barrel  22.89 
 
 		 684 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0448048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4652  Outer membrane autotransporter barrel  23.17 
 
 		 664 aa  82  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1266  Outer membrane autotransporter  23.83 
 
 		 684 aa  81.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.384296 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0915  outer membrane autotransporter  25.95 
 
 		 658 aa  80.9  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0326  lipolytic protein G-D-S-L family  30.5 
 
 		 329 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0319  lipolytic protein G-D-S-L family  30.5 
 
 		 329 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1770  lipolytic protein  27.25 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.949793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3239  Phosphatidylcholine--sterol O-acyltransferase  29.05 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.579995  normal  0.0847319 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2331  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.39 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.622531  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0761  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.48 
 
 		 629 aa  76.3  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4377  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.4 
 
 		 641 aa  74.7  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3764  putative esterase/lipase/outer membrane autotransporter  23.05 
 
 		 723 aa  70.1  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0104  GDSL family lipase  28.92 
 
 		 268 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0299  putative lipase / esterase protein  29.3 
 
 		 353 aa  65.9  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.151241  normal  0.0780281 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3229  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.88 
 
 		 418 aa  64.3  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0911391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5638  Outer membrane autotransporter barrel  30.32 
 
 		 488 aa  63.9  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190969  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4565  lipase  27.41 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0620  Outer membrane autotransporter barrel  27.8 
 
 		 759 aa  60.8  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.553237 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  32.02 
 
 		 3506 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0855  lipolytic protein G-D-S-L family  24.75 
 
 		 284 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4267  outer membrane autotransporter  25.1 
 
 		 939 aa  60.1  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0714  autotransporter, putative  27.8 
 
 		 763 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0488  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25 
 
 		 774 aa  59.7  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0580  putative lipase / esterase protein  28.3 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3285  lipase  22.76 
 
 		 317 aa  56.6  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.195379  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0584  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.71 
 
 		 2302 aa  56.6  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.212067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1039  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.52 
 
 		 1865 aa  57  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.429609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1283  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.71 
 
 		 3015 aa  56.6  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1722  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.52 
 
 		 1842 aa  57  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0890877 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1723  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.71 
 
 		 1953 aa  56.2  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0576481  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2264  lysophospholipase A  23.17 
 
 		 309 aa  55.5  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  25.23 
 
 		 816 aa  55.5  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2291  lysophospholipase A  23.17 
 
 		 309 aa  54.7  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0304  hypothetical protein  30.3 
 
 		 379 aa  54.3  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.882729  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2377  protein tyrosine/serine phosphatase  28.29 
 
 		 636 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188756 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0599  hypothetical protein  30.3 
 
 		 379 aa  54.3  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2433  hypothetical protein  30.3 
 
 		 379 aa  54.3  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0046  hypothetical protein  30.3 
 
 		 379 aa  54.3  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.354332  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2743  putative lipase/esterase  26.54 
 
 		 339 aa  53.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0921024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3385  outer membrane autotransporter  22.88 
 
 		 972 aa  53.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  28.21 
 
 		 1222 aa  53.5  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1491  lipolytic protein G-D-S-L family  29.71 
 
 		 372 aa  53.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.530351  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2238  putative Outer membrane autotransporter protein  25.13 
 
 		 1025 aa  52.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.669565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1537  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.7 
 
 		 3152 aa  52.8  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6375  lipolytic protein  26.21 
 
 		 454 aa  52  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.804625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  32.16 
 
 		 985 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1005  lipase  29.87 
 
 		 379 aa  51.2  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3436  PEP motif-containing protein  29.01 
 
 		 310 aa  51.2  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3937  lipase  22.44 
 
 		 317 aa  51.6  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0841  hypothetical protein  29.87 
 
 		 379 aa  51.2  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.682529  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0846  hypothetical protein  29.87 
 
 		 379 aa  51.2  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4161  putative esterase/lipase/outer membrane autotransporter  21.86 
 
 		 607 aa  51.2  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.930949  normal  0.682493 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  26.42 
 
 		 1369 aa  50.8  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3162  putative hemagglutinin-related protein  23.58 
 
 		 1012 aa  49.3  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5952  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like  25.61 
 
 		 375 aa  49.3  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0670  hypothetical protein  30.74 
 
 		 379 aa  48.9  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1704  lipolytic enzyme, G-D-S-L family protein  26.5 
 
 		 341 aa  49.3  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.135355  normal  0.0632285 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0947  putative autotransporter protein  22.61 
 
 		 728 aa  49.7  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  25.13 
 
 		 3954 aa  49.7  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3276  hypothetical protein  22.61 
 
 		 728 aa  49.7  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.393702  hitchhiker  0.00000976174 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0998  outer membrane autotransporter  22.61 
 
 		 728 aa  49.7  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1981  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.03 
 
 		 1242 aa  49.3  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  29.52 
 
 		 995 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  24.75 
 
 		 4238 aa  47.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  26.62 
 
 		 1011 aa  47.4  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  25.84 
 
 		 1119 aa  47.4  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1155  autotransporter domain-containing protein  26.06 
 
 		 1677 aa  47.4  0.0008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2894  hypothetical protein  21.46 
 
 		 433 aa  47  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.39 
 
 		 1227 aa  46.6  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  24.75 
 
 		 3822 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  24.75 
 
 		 4238 aa  47  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2640  hypothetical protein  27.93 
 
 		 516 aa  46.2  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2510  hypothetical protein  27.93 
 
 		 516 aa  46.2  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2749  hypothetical protein  21.03 
 
 		 433 aa  46.2  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1194  autotransporter domain-containing protein  23.19 
 
 		 1068 aa  45.8  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.170523 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0535  hypothetical protein  24.18 
 
 		 315 aa  45.4  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>