More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4768 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  91.33 
 
 		 475 aa  856    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  74.26 
 
 		 474 aa  715    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  74.74 
 
 		 475 aa  711    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  77.64 
 
 		 503 aa  732    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  91.33 
 
 		 473 aa  856    Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  70.56 
 
 		 475 aa  661    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  91.33 
 
 		 473 aa  864    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  100 
 
 		 472 aa  964    Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  64.56 
 
 		 468 aa  611  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  62.56 
 
 		 447 aa  570  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  59.83 
 
 		 480 aa  560  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  40.35 
 
 		 459 aa  362  1e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  39.62 
 
 		 470 aa  360  3e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  44.89 
 
 		 479 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  46.98 
 
 		 517 aa  352  1e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  38.98 
 
 		 490 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  39.24 
 
 		 470 aa  324  2e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1087  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  43.49 
 
 		 460 aa  311  1e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00818194  normal  0.118313 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  42.98 
 
 		 448 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  44.5 
 
 		 490 aa  303  6.000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  40.93 
 
 		 513 aa  302  7.000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  37.85 
 
 		 439 aa  301  1e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  37.05 
 
 		 491 aa  299  6e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2811  peptidase M23B  36.52 
 
 		 472 aa  298  1e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000654378  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  44.44 
 
 		 491 aa  298  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1314  M24/M37 family peptidase  36.76 
 
 		 482 aa  296  6e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  36.09 
 
 		 477 aa  295  1e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  37.21 
 
 		 475 aa  295  1e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3059  peptidase M23B  36.69 
 
 		 466 aa  294  3e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000244164  normal  0.0231551 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  37.61 
 
 		 741 aa  293  4e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  35.87 
 
 		 477 aa  293  6e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  42.44 
 
 		 462 aa  291  1e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  35.7 
 
 		 468 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2881  peptidase M23B  36.27 
 
 		 466 aa  291  2e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000532238  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1169  peptidase M23B  35.85 
 
 		 468 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000504545  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  35.65 
 
 		 468 aa  289  6e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2972  peptidase M23B  34.31 
 
 		 512 aa  289  6e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000246824  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1246  peptidase M23B  35.8 
 
 		 468 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00321659  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1103  peptidase M23B  41.39 
 
 		 475 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.123313 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01618  Peptidase, M23/M37 family protein  40.56 
 
 		 441 aa  287  2.9999999999999996e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1127  peptidase M23B  35.68 
 
 		 468 aa  286  5e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000608337  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  42.06 
 
 		 498 aa  286  5.999999999999999e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  41.58 
 
 		 471 aa  285  2.0000000000000002e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  43.59 
 
 		 472 aa  283  4.0000000000000003e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  39.23 
 
 		 438 aa  283  5.000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  41.32 
 
 		 471 aa  283  6.000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  34.78 
 
 		 433 aa  279  8e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  40.63 
 
 		 353 aa  277  3e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  40.62 
 
 		 429 aa  273  5.000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  40.91 
 
 		 470 aa  273  6e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0270  M23 peptidase domain-containing protein  39.01 
 
 		 423 aa  273  7e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00486213  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1920  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  39.01 
 
 		 452 aa  272  1e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0283385  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  37.63 
 
 		 503 aa  268  2e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2568  putative membrane associated peptidase  38.32 
 
 		 436 aa  264  3e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0102631  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0554  peptidase M23B  37.89 
 
 		 457 aa  263  4e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0864407  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  38.74 
 
 		 430 aa  258  1e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  34.63 
 
 		 441 aa  256  6e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  36.11 
 
 		 417 aa  249  7e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  38.76 
 
 		 533 aa  249  1e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  34.01 
 
 		 465 aa  247  3e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  37.82 
 
 		 441 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0727  peptidase M23B  36.41 
 
 		 465 aa  241  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  36.15 
 
 		 457 aa  238  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  35.03 
 
 		 490 aa  234  2.0000000000000002e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  35.84 
 
 		 437 aa  233  5e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  35.88 
 
 		 523 aa  233  8.000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  34.01 
 
 		 464 aa  232  9e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  36.24 
 
 		 440 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  36.24 
 
 		 440 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  38.59 
 
 		 569 aa  229  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  36.78 
 
 		 441 aa  228  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  33.42 
 
 		 464 aa  227  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  34.89 
 
 		 464 aa  226  8e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2136  Peptidase M23  35.04 
 
 		 437 aa  226  9e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3784  M24/M37 family peptidase  37.54 
 
 		 439 aa  224  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  36.16 
 
 		 429 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  33.24 
 
 		 491 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  37.8 
 
 		 465 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  34.55 
 
 		 457 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  35.34 
 
 		 462 aa  220  5e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  34.3 
 
 		 446 aa  219  6e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0631  peptidase M23B  36.84 
 
 		 454 aa  219  7.999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0610  Peptidase M23  36.84 
 
 		 454 aa  219  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  34.77 
 
 		 435 aa  218  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0823  Peptidase M23  33.75 
 
 		 429 aa  218  2e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  34.46 
 
 		 464 aa  217  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1234  hypothetical protein  33.91 
 
 		 439 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00307381  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2044  hypothetical protein  33.91 
 
 		 439 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.713076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2104  hypothetical protein  33.91 
 
 		 439 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.391602  normal  0.665324 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1358  hypothetical protein  33.91 
 
 		 439 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370523 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2448  peptidase M23B  35.15 
 
 		 431 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.093884  hitchhiker  0.000000000665253 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2518  peptidase M23B  35.15 
 
 		 431 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0290484  unclonable  0.0000200771 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2610  peptidase M23B  35.49 
 
 		 431 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.326466  hitchhiker  0.000000038042 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4046  peptidase M23B  36.47 
 
 		 453 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  35.62 
 
 		 460 aa  214  3.9999999999999995e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1784  Peptidase M23  33.81 
 
 		 440 aa  213  5.999999999999999e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000497391  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2086  hypothetical protein  33.81 
 
 		 440 aa  213  5.999999999999999e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000391864  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1776  hypothetical protein  33.81 
 
 		 440 aa  213  5.999999999999999e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000317074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2592  hypothetical protein  33.81 
 
 		 440 aa  213  5.999999999999999e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000737786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1330  hypothetical protein  33.81 
 
 		 440 aa  213  5.999999999999999e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147983  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>