41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4703 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_4703  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  474  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0763396  normal  0.775889 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4911  hypothetical protein  93.64 
 
 
251 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4787  hypothetical protein  93.64 
 
 
251 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00573127  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4964  hypothetical protein  95.33 
 
 
214 aa  410  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340246  normal  0.72478 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4959  lipoprotein, putative  70.34 
 
 
231 aa  342  4e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0555  hypothetical protein  69.07 
 
 
232 aa  340  2e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0504  hypothetical protein  70.46 
 
 
237 aa  329  3e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0320775  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0600  hypothetical protein  54.91 
 
 
241 aa  234  7e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65590  hypothetical protein  47.68 
 
 
236 aa  219  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5692  hypothetical protein  47.68 
 
 
236 aa  217  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43450  hypothetical protein  49.8 
 
 
242 aa  217  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140988  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0041  protein of unknown function DUF330  34.04 
 
 
197 aa  72.4  6e-12  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0327  protein of unknown function DUF330  28.86 
 
 
204 aa  65.5  7e-10  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  27.92 
 
 
201 aa  65.1  1e-09  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  28.73 
 
 
204 aa  61.2  1e-08  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1055  protein of unknown function DUF330  24.73 
 
 
198 aa  59.7  4e-08  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0404  hypothetical protein  26.37 
 
 
203 aa  57.8  1e-07  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2220  protein of unknown function DUF330  28.57 
 
 
197 aa  56.6  3e-07  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.2506e-07 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0667  hypothetical protein  27.66 
 
 
211 aa  55.1  1e-06  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  26.87 
 
 
212 aa  53.9  2e-06  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44160  hypothetical protein  26.09 
 
 
192 aa  53.9  2e-06  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266274  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3139  hypothetical protein  29.08 
 
 
200 aa  54.3  2e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  27.78 
 
 
195 aa  53.5  3e-06  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0256  hypothetical protein  25.68 
 
 
205 aa  53.1  4e-06  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0231  hypothetical protein  21.98 
 
 
241 aa  52  8e-06  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1569  hypothetical protein  30.47 
 
 
209 aa  51.2  1e-05  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.849012  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2832  hypothetical protein  27.37 
 
 
183 aa  50.4  2e-05  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.766034  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2579  hypothetical protein  27.32 
 
 
191 aa  50.8  2e-05  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.621383 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1444  hypothetical protein  26.18 
 
 
208 aa  50.8  2e-05  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2001  protein of unknown function DUF330  31.43 
 
 
196 aa  50.4  3e-05  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142199  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0230  hypothetical protein  22.94 
 
 
241 aa  49.3  5e-05  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4087  hypothetical protein  28.57 
 
 
188 aa  48.9  7e-05  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00226644  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02852  hypothetical protein  24.46 
 
 
189 aa  46.6  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1959  hypothetical protein  24.82 
 
 
199 aa  46.6  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000996139  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0652  hypothetical protein  23.15 
 
 
196 aa  45.8  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.049729  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2448  hypothetical protein  28.21 
 
 
201 aa  45.1  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5507  hypothetical protein  24.75 
 
 
201 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003027  putative lipoprotein  22.89 
 
 
192 aa  44.7  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2112  hypothetical protein  27.53 
 
 
197 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.178277  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1866  hypothetical protein  26.97 
 
 
197 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3241  protein of unknown function DUF330  23.7 
 
 
199 aa  42.4  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>