129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4591 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0573  hypothetical protein  63.13 
 
 
574 aa  673    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0612  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  63.5 
 
 
554 aa  679    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.331915  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0618  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  63.31 
 
 
554 aa  665    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475083  normal  0.135926 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4591  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  100 
 
 
552 aa  1107    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0179388 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0652  hypothetical protein  48.13 
 
 
558 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4241  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  32.1 
 
 
581 aa  268  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.398994  normal  0.613369 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4351  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  32.1 
 
 
581 aa  268  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.891663 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5402  activation/secretion signal peptide protein  32.32 
 
 
555 aa  263  8e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3648  putative activation/secretion signal peptide protein  31.95 
 
 
558 aa  262  8.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02601  activation/secretion signal peptide protein  30.18 
 
 
557 aa  257  4e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591465  normal  0.415625 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1655  hypothetical protein  30.56 
 
 
588 aa  245  9.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2550  hypothetical protein  29.92 
 
 
597 aa  241  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0719761  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1491  hypothetical protein  29.37 
 
 
551 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0159  hypothetical protein  29.37 
 
 
551 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1007  hypothetical protein  29.37 
 
 
551 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1044  hypothetical protein  29.37 
 
 
559 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0938674  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1759  hypothetical protein  29.37 
 
 
551 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.301432  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1646  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  29.58 
 
 
569 aa  241  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1780  hypothetical protein  29.17 
 
 
551 aa  240  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1931  putative exported heme utilisation related protein  29.37 
 
 
559 aa  239  8e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2806  putative hemolysin activation/secretion signal peptide protein, FhaC/HxuB  29.17 
 
 
569 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1034  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  29.44 
 
 
561 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.278848  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1514  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.44 
 
 
561 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1490  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.04 
 
 
561 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00938115  hitchhiker  0.0000615286 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1739  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.64 
 
 
561 aa  231  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.484199  hitchhiker  0.0000499827 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0147  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.1 
 
 
572 aa  230  4e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4655  hemolysin activation/secretion protein  28.83 
 
 
561 aa  230  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.55265  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1396  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.63 
 
 
561 aa  229  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304051  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1436  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.63 
 
 
561 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0737479  normal  0.0360186 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1285  hypothetical protein  27.82 
 
 
565 aa  203  6e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000102142  hitchhiker  0.0000179621 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1248  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.67 
 
 
560 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000540972  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6061  hypothetical protein  27.74 
 
 
599 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0068  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.95 
 
 
559 aa  116  8.999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.503427 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3502  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.31 
 
 
553 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.898931  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61190  hypothetical protein  25.93 
 
 
568 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324339  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5270  hypothetical protein  25.93 
 
 
568 aa  104  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2095  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.56 
 
 
592 aa  90.5  6e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03098  activation/secretion signal peptide protein  27.13 
 
 
556 aa  90.5  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.604865  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  22.26 
 
 
607 aa  90.5  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37880  hypothetical protein  25.04 
 
 
550 aa  87.8  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335494  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2383  hemolysin activation/secretion protein-like  24.39 
 
 
624 aa  85.9  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.418836  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1143  surface antigen (D15)  22.91 
 
 
584 aa  84.7  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908627  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2348  surface antigen variable number  21.91 
 
 
588 aa  83.6  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.825907  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.82 
 
 
747 aa  83.6  0.000000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5176  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.6 
 
 
586 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.058555  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0351  hemolysin activation/secretion protein-like protein  25.05 
 
 
607 aa  78.2  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.410508  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3489  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  24.13 
 
 
1391 aa  76.6  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0378  surface antigen (D15)  24.09 
 
 
595 aa  75.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.799835  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3523  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.3 
 
 
548 aa  75.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.24 
 
 
585 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  24.3 
 
 
553 aa  74.7  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3704  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.51 
 
 
554 aa  74.3  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.509582 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.06 
 
 
585 aa  74.3  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4466  surface antigen (D15)  22.08 
 
 
585 aa  73.2  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1153  OMP85 family outer membrane protein  24.74 
 
 
558 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2395  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.34 
 
 
569 aa  70.9  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1288  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.06 
 
 
583 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488096  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2107  activation/secretion signal peptide protein  23.56 
 
 
548 aa  70.5  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.385271  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3266  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  23.78 
 
 
1349 aa  68.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.75 
 
 
592 aa  68.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.763446 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4182  surface antigen variable number  20.77 
 
 
608 aa  68.2  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000105717 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.86 
 
 
572 aa  67.8  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.56 
 
 
580 aa  64.3  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.203664 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4426  surface antigen variable number  22.04 
 
 
595 aa  63.9  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3487  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  23.84 
 
 
1570 aa  63.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3443  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.71 
 
 
639 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2673  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.66 
 
 
584 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.784893  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3152  hemolysin activator HlyB  29.76 
 
 
570 aa  61.6  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575639  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3431  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.93 
 
 
567 aa  61.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00052486 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2776  hypothetical protein  24.51 
 
 
562 aa  60.5  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816054  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3190  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.37 
 
 
589 aa  59.3  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376319  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0042  hypothetical protein  24.51 
 
 
562 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00490  putative hemolysin activation/secretion protein  24.56 
 
 
562 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.612794 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32780  hypothetical protein  28.26 
 
 
565 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.917181  hitchhiker  0.00000323092 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4107  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.26 
 
 
554 aa  58.5  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416704  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3763  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.09 
 
 
567 aa  58.2  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.55 
 
 
571 aa  58.2  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1126  hypothetical protein  22.22 
 
 
531 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1533  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  19.57 
 
 
692 aa  57.4  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0363151  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0011  hemolysin activation/secretion protein-like  24 
 
 
567 aa  57  0.0000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.811976  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0746  hemolysin activation/secretion protein-like  24 
 
 
567 aa  57  0.0000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.63759  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1007  hemolysin activation/secretion protein-like  24 
 
 
567 aa  57  0.0000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1782  putative heme-hemopexin utilization protein B  22.55 
 
 
554 aa  57  0.0000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1048  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.69 
 
 
561 aa  56.6  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0850333 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3061  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.83 
 
 
578 aa  56.2  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0377809  decreased coverage  0.00167141 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4169  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.57 
 
 
559 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.987649 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58890  putative hemolysin activation/secretion protein  25.63 
 
 
545 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0280329 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1989  hemolysin activation/secretion protein-like  25.33 
 
 
587 aa  54.3  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548358  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2460  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.73 
 
 
587 aa  53.9  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.118018  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3060  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.36 
 
 
590 aa  53.9  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0939  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  20.04 
 
 
561 aa  53.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.247088  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3175  putative lipoprotein  24.03 
 
 
596 aa  53.5  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.849554  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3313  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.03 
 
 
596 aa  53.5  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5055  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.71 
 
 
575 aa  52.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.208925  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1054  activation/secretion signal peptide protein  27.39 
 
 
576 aa  52.4  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000217377  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5639  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.25 
 
 
533 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000755047 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5860  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.89 
 
 
576 aa  51.6  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.680877  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4403  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.25 
 
 
557 aa  51.6  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0727  hemolysin activation/secretion protein-like  26.42 
 
 
575 aa  51.2  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.494827  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2002  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.86 
 
 
549 aa  51.2  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>