198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4584 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_4584  dehydratase  100 
 
 
283 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0580  MaoC domain-containing protein  81.27 
 
 
283 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.648773 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0625  dehydratase  81.63 
 
 
283 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00406567 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0619  dehydratase  80.92 
 
 
283 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965685  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0654  MaoC-like dehydratase  61.43 
 
 
284 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0742  MaoC-like domain protein  56.79 
 
 
285 aa  323  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81902  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0643  MaoC-like dehydratase  56.43 
 
 
286 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0742  dehydratase  54.77 
 
 
285 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.780848  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5510  hypothetical protein  56.18 
 
 
285 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63290  hypothetical protein  55.48 
 
 
285 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.230888  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38940  acyl dehydratase  45.61 
 
 
286 aa  192  6e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.234343 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0197  MaoC domain protein dehydratase  42.59 
 
 
297 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0308  MaoC domain protein dehydratase  42.19 
 
 
284 aa  185  9e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.188637  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2849  dehydratase  42.98 
 
 
288 aa  177  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0140  dehydratase  44.44 
 
 
297 aa  176  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1308  hypothetical protein  40.66 
 
 
305 aa  171  1e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000275009  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2077  dehydratase  43.7 
 
 
291 aa  171  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0146  dehydratase  40.15 
 
 
306 aa  168  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.861571  decreased coverage  0.0000240434 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1070  MaoC-like dehydratase  39.84 
 
 
305 aa  166  5.9999999999999996e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000325805  normal  0.560447 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2776  putative (R)-specific enoyl-CoA hydratase, MaoC- like  40.37 
 
 
311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.272996  normal  0.286691 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2939  MaoC domain protein dehydratase  42.93 
 
 
300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1388  dehydratase  40.55 
 
 
298 aa  162  9e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000424588  unclonable  0.000000000439784 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6974  MaoC domain protein dehydratase  41.49 
 
 
267 aa  161  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2189  MaoC-like dehydratase  42.4 
 
 
284 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4026  MaoC domain protein dehydratase  38.16 
 
 
292 aa  159  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.139302  normal  0.123863 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21230  acyl dehydratase  38.58 
 
 
335 aa  158  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1689  MaoC domain protein dehydratase  42.99 
 
 
284 aa  155  9e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0315419  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1760  MaoC domain protein dehydratase  42.52 
 
 
284 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3017  MaoC domain-containing protein dehydratase  41.63 
 
 
285 aa  152  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176864  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1674  MaoC domain protein dehydratase  37.73 
 
 
314 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.394438 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2380  MaoC domain protein dehydratase  38.78 
 
 
317 aa  149  7e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.087809 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1258  dehydratase  41.1 
 
 
280 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.196595  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3587  MaoC domain protein dehydratase  39.5 
 
 
311 aa  145  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3115  MaoC domain protein dehydratase  38.91 
 
 
333 aa  144  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34970  acyl dehydratase  35.36 
 
 
339 aa  144  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.486477  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2146  dehydratase  35.8 
 
 
307 aa  139  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139128  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11740  MaoC-like protein  35.29 
 
 
297 aa  137  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0694748  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4455  MaoC domain protein dehydratase  37.75 
 
 
296 aa  136  5e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00945579  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0559  dehydratase  32.51 
 
 
287 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3471  dehydratase  32.51 
 
 
287 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0558  dehydratase  32.94 
 
 
287 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.742818  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3750  MaoC domain protein dehydratase  32.55 
 
 
287 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0600605  normal  0.381685 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0413  dehydratase  37.05 
 
 
282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0697277 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1893  MaoC domain protein dehydratase  37.78 
 
 
335 aa  133  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109024 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0559  MaoC domain-containing protein  33.61 
 
 
276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3806  dehydratase  32.35 
 
 
276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000417553  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0524  MaoC-like dehydratase  31.85 
 
 
289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000449112  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0430  MaoC domain protein dehydratase  34.88 
 
 
306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.183193  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0229  dehydratase  36.44 
 
 
281 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200402  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3522  dehydratase  33.62 
 
 
288 aa  130  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23460  acyl dehydratase  39.36 
 
 
301 aa  130  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.260821  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3932  dehydratase  32.79 
 
 
276 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.212138  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0518  dehydratase  32.79 
 
 
276 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177397  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3315  dehydratase  34.8 
 
 
276 aa  130  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000241426  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3157  MaoC-like dehydratase  36.24 
 
 
320 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00547969  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0239  MaoC-like dehydratase  36 
 
 
281 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1702  dehydratase  36.82 
 
 
305 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00665806  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0249  dehydratase  36 
 
 
281 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.315586 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0258  dehydratase  35.68 
 
 
284 aa  127  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.115215 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0426  MaoC domain protein dehydratase  31.16 
 
 
294 aa  125  9e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.252327  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0441  dehydratase  32.48 
 
 
279 aa  124  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000513118  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0415  MaoC domain protein dehydratase  35.86 
 
 
306 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134356 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3148  MaoC domain-containing protein  30.69 
 
 
287 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0113837  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3721  dehydratase  30.66 
 
 
288 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000101981  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10244  hypothetical protein  33.77 
 
 
280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0093701  normal  0.943124 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03008  MaoC domain protein dehydratase  33.33 
 
 
291 aa  119  4.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104203  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0611  dehydratase  33.33 
 
 
288 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000129975  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4341  dehydratase  30.89 
 
 
294 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.18708  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3954  dehydratase  28.08 
 
 
293 aa  65.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21274  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3316  hypothetical protein  28.91 
 
 
297 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07690  acyl dehydratase  34.82 
 
 
144 aa  57  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.961228  normal  0.0437858 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1594  dehydratase  37.33 
 
 
161 aa  55.8  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.691822  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4100  MaoC-like domain protein  31.36 
 
 
173 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4356  MaoC-like dehydratase  37.66 
 
 
156 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3315  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  33.33 
 
 
470 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.287925  normal  0.745735 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3838  MaoC-like dehydratase  38.96 
 
 
156 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2665  hypothetical protein  34.23 
 
 
141 aa  54.7  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26639  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1255  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  42.86 
 
 
473 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1822  hypothetical protein  31.67 
 
 
156 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2915  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  42.86 
 
 
473 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2693  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  42.86 
 
 
473 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3886  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  32.43 
 
 
464 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271652  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4552  MaoC domain protein dehydratase  37.97 
 
 
156 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228955  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4051  dehydratase  39.24 
 
 
140 aa  53.5  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46056  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4059  dehydratase  37.97 
 
 
156 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21310  hypothetical protein  31.67 
 
 
156 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.288859  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1337  dehydratase  37.97 
 
 
156 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.574177  normal  0.282303 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0671  dehydratase  35.79 
 
 
127 aa  53.1  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0318034  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3847  dehydratase  33.02 
 
 
156 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1493  dehydratase  41.54 
 
 
156 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0447243  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4529  MaoC domain protein dehydratase  34.91 
 
 
142 aa  52.4  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2692  MaoC domain protein dehydratase  35.87 
 
 
142 aa  52  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0899  MaoC domain protein dehydratase  33.64 
 
 
142 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344654  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1203  dehydratase; 3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.06 
 
 
147 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1205  dehydratase; 3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.06 
 
 
147 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1633  (acyl-carrier-protein) S-malonyltransferase  31.11 
 
 
3172 aa  51.2  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5041  dehydratase  39.02 
 
 
157 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0522475  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1326  MaoC family protein  35.06 
 
 
147 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3980  maoC family protein  35.06 
 
 
147 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1466  maoC family protein  35.06 
 
 
147 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>