238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4570 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_4570  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  394  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  5.82787e-07  normal  0.0106541 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0638  hypothetical protein  92.27 
 
 
194 aa  367  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134379 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0633  hypothetical protein  92.27 
 
 
194 aa  345  3e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  1.02941e-11  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0593  hypothetical protein  92.27 
 
 
194 aa  345  3e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.195431  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0682  hypothetical protein  76.56 
 
 
193 aa  305  2e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  3.48018e-11  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0770  hypothetical protein  77.49 
 
 
197 aa  305  2e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.634391  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0674  hypothetical protein  77.2 
 
 
197 aa  305  3e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3700  hypothetical protein  64.89 
 
 
194 aa  230  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0248  hypothetical protein  60.85 
 
 
196 aa  227  7e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895952  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02100  hypothetical protein  60.32 
 
 
196 aa  224  7e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.482389 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1849  protein of unknown function UPF0029  49.43 
 
 
206 aa  182  4e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0820  hypothetical protein  48.9 
 
 
229 aa  170  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.647748  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0874  hypothetical protein  48.9 
 
 
229 aa  170  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0091  hypothetical protein  49.44 
 
 
194 aa  168  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4327  hypothetical protein  50.27 
 
 
199 aa  166  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01194  thymidylate synthase  45.81 
 
 
212 aa  165  3e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.43796  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3312  hypothetical protein  47.57 
 
 
209 aa  163  2e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1608  protein of unknown function UPF0029  46.49 
 
 
201 aa  156  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.172462 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1820  hypothetical protein  46.67 
 
 
198 aa  156  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0596118  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2225  protein of unknown function UPF0029  43.65 
 
 
195 aa  155  5e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  41.94 
 
 
204 aa  142  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  39.39 
 
 
203 aa  140  9e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  39.39 
 
 
203 aa  140  9e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  39.39 
 
 
203 aa  140  9e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.725e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37283  predicted protein  45.5 
 
 
239 aa  137  9e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0118938  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  40.86 
 
 
204 aa  135  5e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2969  hypothetical protein  38.86 
 
 
200 aa  129  4e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4229  hypothetical protein  37.89 
 
 
204 aa  125  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  2.19511e-05  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  39.55 
 
 
194 aa  121  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  36.65 
 
 
204 aa  119  2e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  34.2 
 
 
207 aa  119  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  6.70968e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  38.95 
 
 
290 aa  119  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0020  hypothetical protein  35.08 
 
 
204 aa  117  1e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0743784  hitchhiker  0.000738865 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0018  hypothetical protein  35.45 
 
 
204 aa  117  1e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464651  normal  0.0620683 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  38.98 
 
 
239 aa  117  1e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0026  hypothetical protein  35.42 
 
 
204 aa  116  2e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0810004  hitchhiker  2.52745e-08 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3596  hypothetical protein  40.68 
 
 
195 aa  116  2e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466647  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0023  hypothetical protein  35.64 
 
 
204 aa  116  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  37.11 
 
 
195 aa  115  4e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  36.6 
 
 
194 aa  115  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4042  hypothetical protein  35.26 
 
 
203 aa  113  2e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0955788  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4071  hypothetical protein  39.55 
 
 
195 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0233425  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0074  hypothetical protein  49.66 
 
 
207 aa  112  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  38.46 
 
 
213 aa  112  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0034  hypothetical protein  36.56 
 
 
206 aa  111  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0046667  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4232  hypothetical protein  35.42 
 
 
203 aa  111  8e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0996008  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  36.08 
 
 
194 aa  110  9e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  40.68 
 
 
195 aa  110  1e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  40.68 
 
 
195 aa  110  1e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  40.68 
 
 
195 aa  110  1e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0196  elongation factor  31.58 
 
 
207 aa  110  2e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4192  hypothetical protein  39.47 
 
 
204 aa  110  2e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.121716  normal  0.896932 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4311  hypothetical protein  39.47 
 
 
204 aa  110  2e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.521499  normal  0.36951 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4215  hypothetical protein  39.47 
 
 
204 aa  110  2e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000733457  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4371  hypothetical protein  39.47 
 
 
204 aa  110  2e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  43.18 
 
 
245 aa  110  2e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  36.81 
 
 
211 aa  110  2e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  1.86376e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0022  protein of unknown function UPF0029  36.76 
 
 
204 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.69816e-06 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  36.26 
 
 
205 aa  109  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  38.98 
 
 
195 aa  108  4e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2434  hypothetical protein  34.74 
 
 
206 aa  108  4e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206546  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0018  hypothetical protein  36.76 
 
 
204 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.919089  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4264  hypothetical protein  38.95 
 
 
204 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4412  hypothetical protein  37.89 
 
 
195 aa  108  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3042  hypothetical protein  34.03 
 
 
200 aa  107  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0022  hypothetical protein  36.22 
 
 
204 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.977624  normal  0.0115925 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8747  predicted protein  38.96 
 
 
190 aa  107  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.336863  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0944  hypothetical protein  32.8 
 
 
242 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4071  hypothetical protein  38.95 
 
 
205 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.21216e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5287  hypothetical protein  38.95 
 
 
205 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00411387  hitchhiker  0.00913074 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4318  hypothetical protein  38.42 
 
 
205 aa  106  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  6.8448e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4162  hypothetical protein  38.95 
 
 
205 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0381893  hitchhiker  8.31038e-05 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4367  hypothetical protein  38.42 
 
 
205 aa  106  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000932269  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  33.51 
 
 
213 aa  106  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3947  hypothetical protein  37.89 
 
 
204 aa  106  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  decreased coverage  0.00180988 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  33.16 
 
 
198 aa  106  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  1.27558e-07  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03739  predicted elongation factor  38.42 
 
 
204 aa  105  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.190992  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  33.51 
 
 
211 aa  104  6e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03688  hypothetical protein  38.42 
 
 
204 aa  105  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.154507  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  34.04 
 
 
198 aa  104  6e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1379  hypothetical protein  36.52 
 
 
199 aa  104  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.262935  normal  0.051322 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2244  hypothetical protein  34.55 
 
 
222 aa  104  8e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1630  protein of unknown function UPF0029  34.03 
 
 
197 aa  103  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329042  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4133  protein of unknown function UPF0029  37.89 
 
 
204 aa  104  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0235776  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  34.43 
 
 
212 aa  103  1e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0015  hypothetical protein  32.26 
 
 
204 aa  103  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.536697  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  38.85 
 
 
207 aa  103  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  36.94 
 
 
198 aa  103  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  32.99 
 
 
198 aa  103  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  1.64661e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  36.72 
 
 
201 aa  103  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  37.85 
 
 
204 aa  102  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl056  putative proline dipeptidase  32.37 
 
 
232 aa  102  5e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3648  hypothetical protein  35.94 
 
 
197 aa  102  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.987474  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  36.13 
 
 
211 aa  101  6e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0046  hypothetical protein  37.5 
 
 
191 aa  100  9e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2867  hypothetical protein  34.04 
 
 
201 aa  100  9e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2481  hypothetical protein  33 
 
 
219 aa  100  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  33.67 
 
 
209 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5286  protein of unknown function UPF0029  35.8 
 
 
196 aa  100  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0020  hypothetical protein  33.33 
 
 
204 aa  100  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>