219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4527 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4527  outer membrane porin  100 
 
 		 424 aa  867    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.321558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3451  outer membrane porin  71.25 
 
 		 395 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0903  outer membrane porin  67.87 
 
 		 422 aa  594  1e-169  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4430  outer membrane porin  65.39 
 
 		 418 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138033 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1054  outer membrane porin, OprD family  66.43 
 
 		 422 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4340  outer membrane porin  68.45 
 
 		 418 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00498222  normal  0.156563 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1383  BenF-like porin  67.94 
 
 		 418 aa  578  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.435313 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1023  outer membrane porin  67.17 
 
 		 417 aa  579  1e-164  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0827168 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3077  outer membrane porin  66.26 
 
 		 416 aa  579  1e-164  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0293927  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2343  outer membrane porin, OprD family  67.34 
 
 		 418 aa  569  1e-161  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2127  outer membrane porin  67.35 
 
 		 418 aa  566  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265599  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1173  porin, putative  65.09 
 
 		 412 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121205  normal  0.068345 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1206  outer membrane porin  64.62 
 
 		 412 aa  559  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4239  outer membrane porin  65.46 
 
 		 412 aa  559  1e-158  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1277  outer membrane porin  64.48 
 
 		 419 aa  555  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1190  outer membrane porin  64.15 
 
 		 412 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569611  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3201  outer membrane porin  65.83 
 
 		 415 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27407  normal  0.0173746 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2517  BenF-like porin  64.07 
 
 		 410 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.274233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02980  putative porin  63.78 
 
 		 421 aa  518  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100388 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0324  putative porin  61.02 
 
 		 416 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00920  OprD family outer membrane porin  58.37 
 
 		 423 aa  499  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26920  OprD family outer membrane porin  58.94 
 
 		 424 aa  492  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291151  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22450  OprD family outer membrane porin  57.74 
 
 		 422 aa  494  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38130  OprD family outer membrane porin  58.23 
 
 		 426 aa  483  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.764823  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1339  outer membrane porin  56.97 
 
 		 422 aa  478  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.868317  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49300  OprD family outer membrane porin  55.7 
 
 		 428 aa  472  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.32887  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17140  outer membrane porin  54.3 
 
 		 405 aa  460  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.209334  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31300  OprD family outer membrane porin  58.02 
 
 		 429 aa  456  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38140  outer membrane porin, OprD family  54.48 
 
 		 420 aa  434  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35855  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5281  outer membrane porin  51.72 
 
 		 413 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.746207 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2167  outer membrane porin  49.14 
 
 		 417 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2024  outer membrane porin  49.75 
 
 		 417 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5621  putative porin  47.48 
 
 		 417 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64720  putative porin  47.48 
 
 		 417 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3076  putative porin  48.54 
 
 		 416 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36090  putative porin  48.05 
 
 		 416 aa  388  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000105785 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  43.3 
 
 		 423 aa  352  8.999999999999999e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2145  outer membrane porin  43.81 
 
 		 431 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832891  normal  0.088551 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3574  outer membrane porin  44.89 
 
 		 430 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.135647  normal  0.538607 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2681  outer membrane porin  44.67 
 
 		 416 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340362  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3939  porin, putative  44.61 
 
 		 430 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.38519  normal  0.0206091 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2547  outer membrane porin  43.67 
 
 		 416 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.789024  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3168  benzoate-specific porin  43.67 
 
 		 416 aa  329  6e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143323  normal  0.69398 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1898  outer membrane porin  44.11 
 
 		 430 aa  325  6e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000146891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2701  outer membrane porin  44.62 
 
 		 416 aa  319  6e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584042  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1458  outer membrane porin  42.89 
 
 		 421 aa  315  7e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  40.93 
 
 		 429 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1739  outer membrane porin  42.31 
 
 		 415 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  42.54 
 
 		 427 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  42.46 
 
 		 429 aa  309  8e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  41.96 
 
 		 429 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48920  outer membrane porin  43.33 
 
 		 422 aa  307  3e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  41.96 
 
 		 429 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  41.92 
 
 		 427 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11340  outer membrane porin  39.46 
 
 		 428 aa  300  3e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.703793  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10440  putative porin  40.41 
 
 		 418 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  41.29 
 
 		 421 aa  293  5e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  41.16 
 
 		 421 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0953  putative porin  40.15 
 
 		 418 aa  290  4e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3121  outer membrane porin  39.8 
 
 		 424 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2139  outer membrane porin  38.61 
 
 		 433 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0667606  hitchhiker  0.0000330448 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3764  outer membrane porin  38.37 
 
 		 433 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.522082  normal  0.130801 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37260  putative porin  41.63 
 
 		 409 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.618786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1999  outer membrane porin  37.65 
 
 		 429 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175202 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2058  outer membrane porin  40.05 
 
 		 417 aa  275  9e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3198  putative porin  40.67 
 
 		 409 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2103  outer membrane porin  36.93 
 
 		 433 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3682  outer membrane porin  39.8 
 
 		 417 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1577  outer membrane porin  39.05 
 
 		 417 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107742  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2632  outer membrane porin  37.38 
 
 		 433 aa  268  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3160  outer membrane porin  38.9 
 
 		 418 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4356  outer membrane porin  38.19 
 
 		 421 aa  268  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18150  outer membrane porin  38.94 
 
 		 411 aa  265  8.999999999999999e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0914  putative porin  37.47 
 
 		 431 aa  264  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3656  aromatic compound-specific porin, putative  35.25 
 
 		 420 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.755961  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49310  outer membrane porin  38.35 
 
 		 412 aa  263  4.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17890  putative porin  38.02 
 
 		 416 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31180  OprE-like outer membrane porin  37.36 
 
 		 439 aa  261  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09850  putative porin  37.24 
 
 		 431 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.881809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2074  outer membrane porin  34.7 
 
 		 420 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.695569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51070  porin  38.36 
 
 		 416 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000811517 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2638  outer membrane porin  38.02 
 
 		 410 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00757787  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3271  outer membrane porin  37.72 
 
 		 417 aa  255  9e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2488  outer membrane porin  37.72 
 
 		 410 aa  255  9e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.246443  normal  0.663679 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2625  outer membrane porin  37.72 
 
 		 410 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0951208  normal  0.228202 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4332  outer membrane porin  36.43 
 
 		 439 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.994922 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1272  outer membrane porin OprE  37.29 
 
 		 417 aa  253  6e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0382  outer membrane porin OprE precursor  35.26 
 
 		 460 aa  252  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21290  OprE-like outer membrane porin  36.3 
 
 		 457 aa  252  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25950  OprE-like outer membrane porin  36.19 
 
 		 443 aa  251  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.249173  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01240  OprE-like outer membrane porin  36.14 
 
 		 440 aa  251  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.464345  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42090  outer membrane porin, OprD family  36.43 
 
 		 427 aa  251  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03800  anaerobically-induced outer membrane porin OprE precursor  34.82 
 
 		 463 aa  249  5e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.314855  normal  0.413921 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1987  outer membrane porin  35.87 
 
 		 430 aa  249  6e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.6739 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05170  OprE-like outer membrane porin  35.98 
 
 		 439 aa  249  6e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0885067  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3390  porin, putative  35.24 
 
 		 426 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.808043  normal  0.355784 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2730  outer membrane porin  36.12 
 
 		 440 aa  247  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49580  OprE-like outer membrane porin  36.38 
 
 		 441 aa  247  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.607029  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4212  outer membrane porin  36.43 
 
 		 427 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1554  putative porin  35.78 
 
 		 416 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515342  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>