More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4526 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_4526  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
128 aa  261  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4169  carboxymuconolactone decarboxylase  61.16 
 
 
127 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.944589  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0934  carboxymuconolactone decarboxylase  63.72 
 
 
124 aa  160  6e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4478  4-carboxymuconolactone decarboxylase  60.33 
 
 
127 aa  157  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0850  4-carboxymuconolactone decarboxylase  61.98 
 
 
127 aa  155  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.89978  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58220  hypothetical protein  63.72 
 
 
128 aa  156  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.876359  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5100  hypothetical protein  63.72 
 
 
128 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.696619  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0832  4-carboxymuconolactone decarboxylase  62.83 
 
 
126 aa  155  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190386  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0681  carboxymuconolactone decarboxylase  58.77 
 
 
128 aa  147  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0673  Carboxymuconolactone decarboxylase  58.77 
 
 
128 aa  147  5e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3703  carboxymuconolactone decarboxylase  58.77 
 
 
128 aa  147  5e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5046  carboxymuconolactone decarboxylase  62.28 
 
 
154 aa  146  7e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.336576 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5410  carboxymuconolactone decarboxylase  59.32 
 
 
132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0441836  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0571  4-carboxymuconolactone decarboxylase  57.38 
 
 
134 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3552  4-carboxymuconolactone decarboxylase  57.38 
 
 
134 aa  143  9e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3382  4-carboxymuconolactone decarboxylase  57.38 
 
 
134 aa  143  9e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3905  Carboxymuconolactone decarboxylase  57.63 
 
 
131 aa  142  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00819268  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4019  Carboxymuconolactone decarboxylase  57.63 
 
 
131 aa  142  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000710611  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3566  carboxymuconolactone decarboxylase  59.32 
 
 
132 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.199431  hitchhiker  0.00916142 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1458  4-carboxymuconolactone decarboxylase  57.26 
 
 
132 aa  140  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2734  4-carboxymuconolactone decarboxylase  58.77 
 
 
127 aa  140  4e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.888805  hitchhiker  0.0000628107 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2446  carboxymuconolactone decarboxylase  58.77 
 
 
132 aa  140  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1901  carboxymuconolactone decarboxylase  53.39 
 
 
129 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4700  carboxymuconolactone decarboxylase  58.77 
 
 
155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3662  carboxymuconolactone decarboxylase  58.77 
 
 
155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.318309  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2542  4-carboxymuconolactone decarboxylase  54.4 
 
 
132 aa  138  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0234299  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1289  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase  54.4 
 
 
132 aa  138  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.880163  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1368  4-carboxymuconolactone decarboxylase  54.4 
 
 
132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1291  4-carboxymuconolactone decarboxylase  55.93 
 
 
132 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1029  4-carboxymuconolactone decarboxylase  55.93 
 
 
132 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0268  4-carboxymuconolactone decarboxylase  55.93 
 
 
132 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.578525  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0538  4-carboxymuconolactone decarboxylase  55.93 
 
 
185 aa  137  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3859  carboxymuconolactone decarboxylase  57.89 
 
 
132 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.604596 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3646  carboxymuconolactone decarboxylase  52.46 
 
 
128 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2661  carboxymuconolactone decarboxylase  55.08 
 
 
125 aa  135  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2931  carboxymuconolactone decarboxylase  53.51 
 
 
129 aa  133  8e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000640912  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4188  carboxymuconolactone decarboxylase  54.39 
 
 
152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.412642 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1912  carboxymuconolactone decarboxylase  47.37 
 
 
126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.955365  normal  0.169242 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1326  4-carboxymuconolactone decarboxylase  50 
 
 
129 aa  123  8.000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.171416  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4821  carboxymuconolactone decarboxylase  43.86 
 
 
126 aa  122  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0925911  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2260  carboxymuconolactone decarboxylase  45.61 
 
 
129 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3648  carboxymuconolactone decarboxylase  43.8 
 
 
129 aa  120  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00963465  normal  0.158809 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13050  4-carboxymuconolactone decarboxylase  51.67 
 
 
134 aa  120  5e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2296  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45.9 
 
 
123 aa  120  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0265397  normal  0.659303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2082  carboxymuconolactone decarboxylase  45.61 
 
 
129 aa  120  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.984068 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2255  carboxymuconolactone decarboxylase  44.74 
 
 
129 aa  120  8e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344767  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5222  Carboxymuconolactone decarboxylase  42.98 
 
 
126 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3235  4-carboxymuconolactone decarboxylase  46.3 
 
 
129 aa  117  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621974  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3215  carboxymuconolactone decarboxylase  43.33 
 
 
124 aa  116  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0939  carboxymuconolactone decarboxylase  42.11 
 
 
126 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.947177  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0750  putative carboxymuconolactone decarboxylase  48.28 
 
 
149 aa  114  3e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.061099  normal  0.343107 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3442  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.86 
 
 
127 aa  115  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222691  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2568  carboxymuconolactone decarboxylase  43.86 
 
 
132 aa  114  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.136392 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0900  carboxymuconolactone decarboxylase  46.4 
 
 
133 aa  114  5e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.405074 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2974  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.86 
 
 
125 aa  114  6e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0745  carboxymuconolactone decarboxylase  48.28 
 
 
153 aa  114  6e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.186139  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3257  carboxymuconolactone decarboxylase  45 
 
 
148 aa  113  8.999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.146193  normal  0.0594926 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0830  carboxymuconolactone decarboxylase  42.98 
 
 
126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1473  Carboxymuconolactone decarboxylase  47.66 
 
 
137 aa  110  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.362759  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5508  Carboxymuconolactone decarboxylase  41.23 
 
 
129 aa  110  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000984625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7932  4-carboxymuconolactone decarboxylase  49.57 
 
 
132 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.729855 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1577  4-carboxymuconolactone decarboxylase  47.24 
 
 
128 aa  108  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00107459  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  45.76 
 
 
393 aa  107  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4519  carboxymuconolactone decarboxylase  40 
 
 
125 aa  107  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591188  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01252  conserved hypothetical protein  44.74 
 
 
157 aa  106  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  44.35 
 
 
391 aa  105  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3459  carboxymuconolactone decarboxylase  40.48 
 
 
136 aa  105  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.462387  hitchhiker  0.00164993 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4316  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.32 
 
 
131 aa  105  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146371  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0647  4-carboxymuconolactone decarboxylase (PcaC)  43.48 
 
 
130 aa  104  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.153527 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2249  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  44.74 
 
 
131 aa  104  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0833929  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7078  4-carboxymuconolactone decarboxylase  42.11 
 
 
134 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0342158  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6127  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.74 
 
 
136 aa  103  8e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4461  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.53 
 
 
128 aa  103  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.273934 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  42.11 
 
 
373 aa  103  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0521  carboxymuconolactone decarboxylase  45.22 
 
 
136 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00445095  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4207  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.86 
 
 
135 aa  102  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2190  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.74 
 
 
133 aa  103  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  42.11 
 
 
132 aa  102  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0594936 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1984  4-carboxymuconolactone decarboxylase  40.18 
 
 
134 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3726  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.12 
 
 
135 aa  102  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1381  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.23 
 
 
130 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.760953  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.23 
 
 
130 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0210047  normal  0.0491818 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2454  4-carboxymuconolactone decarboxylase  42.98 
 
 
132 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.835529  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4433  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.23 
 
 
130 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145648  hitchhiker  0.00893399 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2322  4-carboxymuconolactone decarboxylase  40 
 
 
129 aa  101  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254356  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1204  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.38 
 
 
128 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1557  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.38 
 
 
128 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2687  4-carboxymuconolactone decarboxylase  40.35 
 
 
140 aa  99.8  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.22317 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1487  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.38 
 
 
128 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0058  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.38 
 
 
128 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161595  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0318  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  42.11 
 
 
133 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623335  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5284  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.18 
 
 
128 aa  99.4  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.327444  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2061  4-carboxymuconolactone decarboxylase  42.98 
 
 
132 aa  99.8  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0060  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.38 
 
 
128 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.34038  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0644  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.12 
 
 
138 aa  98.6  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0606  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.12 
 
 
138 aa  98.6  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0050  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.38 
 
 
128 aa  99  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3162  4-carboxymuconolactone decarboxylase  40.35 
 
 
128 aa  98.6  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2960  carboxymuconolactone decarboxylase  35.65 
 
 
126 aa  98.6  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00839552  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  40.35 
 
 
128 aa  98.6  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>