22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4441 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_4441  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  322  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0789  hypothetical protein  79.62 
 
 
157 aa  263  6e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0748  hypothetical protein  77.71 
 
 
157 aa  255  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0117939  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0776  hypothetical protein  75.16 
 
 
157 aa  248  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5293  hypothetical protein  66.03 
 
 
157 aa  210  6e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61450  hypothetical protein  64.74 
 
 
157 aa  209  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.428854 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0560  hypothetical protein  45.39 
 
 
159 aa  140  5e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.95108 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0732  hypothetical protein  42.11 
 
 
154 aa  129  1e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.136479  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3327  hypothetical protein  43.42 
 
 
154 aa  128  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3247  hypothetical protein  37.5 
 
 
156 aa  115  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1896  hypothetical protein  41.67 
 
 
165 aa  109  1e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.936352 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2080  hypothetical protein  38.26 
 
 
158 aa  107  6e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0620  hypothetical protein  35.53 
 
 
159 aa  103  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.573395  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0034  hypothetical protein  37.4 
 
 
159 aa  100  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0187  hypothetical protein  35.46 
 
 
159 aa  99.8  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02633  hypothetical protein  36.55 
 
 
180 aa  99  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0984  hypothetical protein  34.69 
 
 
160 aa  96.3  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.229596  normal  0.532531 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3978  hypothetical protein  36.43 
 
 
169 aa  91.3  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0248075  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0927  hypothetical protein  31.39 
 
 
156 aa  76.6  1e-13  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  5.34724e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12991  hypothetical protein  25.26 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5656  hypothetical protein  25.66 
 
 
167 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1319  O-antigen related protein  32.81 
 
 
67 aa  44.3  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0766792  normal  0.774627 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>