More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4399 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_4399  1-phosphofructokinase  100 
 
 
315 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  82.86 
 
 
315 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  82.86 
 
 
315 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0828  1-phosphofructokinase  85.08 
 
 
315 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.904747 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0794  PfkB  66.13 
 
 
313 aa  403  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0909395  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0955  1-phosphofructokinase  65.18 
 
 
313 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12200  1-phosphofructokinase  65.58 
 
 
308 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0822  1-phosphofructokinase  64.86 
 
 
313 aa  359  3e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.866329  normal  0.0627299 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0787  1-phosphofructokinase  62.5 
 
 
306 aa  344  1e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347436  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1584  1-phosphofructokinase  58.03 
 
 
315 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18260  1-phosphofructokinase  58.03 
 
 
314 aa  326  3e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00550374  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05959  1-phosphofructokinase  47.88 
 
 
324 aa  270  2e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0091  1-phosphofructokinase  49.35 
 
 
325 aa  266  4e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.720236  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0450  1-phosphofructokinase  48.04 
 
 
317 aa  266  5e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000223  1-phosphofructokinase  48.4 
 
 
323 aa  265  8e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3552  1-phosphofructokinase  45.45 
 
 
313 aa  255  7e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1653  1-phosphofructokinase  45.57 
 
 
312 aa  239  4e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000747305  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1925  1-phosphofructokinase  45.57 
 
 
312 aa  239  5.999999999999999e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0601047  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2647  PfkB  49.35 
 
 
322 aa  230  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150018  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02097  1-phosphofructokinase  46.23 
 
 
312 aa  228  1e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00508947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1490  1-phosphofructokinase  46.23 
 
 
312 aa  228  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119891  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2305  1-phosphofructokinase  46.23 
 
 
312 aa  228  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000269227  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2315  1-phosphofructokinase  46.23 
 
 
312 aa  228  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000477642  hitchhiker  0.000599069 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1480  1-phosphofructokinase  46.23 
 
 
312 aa  228  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00345053  unclonable  0.000000014871 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02056  hypothetical protein  46.23 
 
 
312 aa  228  1e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0795  1-phosphofructokinase  46.23 
 
 
312 aa  228  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412726  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2328  1-phosphofructokinase  45.9 
 
 
312 aa  228  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3304  1-phosphofructokinase  46.23 
 
 
312 aa  228  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000243379  normal  0.0139965 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2465  1-phosphofructokinase  46.23 
 
 
312 aa  226  4e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000474355  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2682  1-phosphofructokinase  45.48 
 
 
312 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000785688  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2397  1-phosphofructokinase  46.23 
 
 
312 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.296088  hitchhiker  0.000165824 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2441  1-phosphofructokinase  46.23 
 
 
312 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151265  hitchhiker  0.00000493552 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2763  1-phosphofructokinase  45.48 
 
 
312 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0176318  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2353  1-phosphofructokinase  46.23 
 
 
312 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000249505  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2555  1-phosphofructokinase  46.23 
 
 
312 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0672567  hitchhiker  0.000484792 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1525  1-phosphofructokinase  45.48 
 
 
312 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0144942  normal  0.0682972 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2444  1-phosphofructokinase  46.23 
 
 
312 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00105747  normal  0.37193 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2425  1-phosphofructokinase  45.25 
 
 
312 aa  225  8e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2762  1-phosphofructokinase  45.57 
 
 
312 aa  223  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3229  1-phosphofructokinase  45.9 
 
 
313 aa  224  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000483919 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2174  1-phosphofructokinase  46.55 
 
 
326 aa  199  3.9999999999999996e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2896  1-phosphofructokinase  42.38 
 
 
322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.931372  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1188  1-phosphofructokinase  48.51 
 
 
315 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95293  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0188  1-phosphofructokinase  42.72 
 
 
317 aa  192  6e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1971  PfkB  45.32 
 
 
327 aa  190  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.808112  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4713  1-phosphofructokinase  40.38 
 
 
330 aa  186  6e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  35.08 
 
 
311 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  33.8 
 
 
310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2862  1-phosphofructokinase protein  39.17 
 
 
316 aa  179  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.558464  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2031  1-phosphofructokinase  43.87 
 
 
318 aa  178  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.832407  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  36.64 
 
 
315 aa  177  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  38.71 
 
 
312 aa  176  5e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  38.46 
 
 
308 aa  175  7e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0907  1-phosphofructokinase  42.43 
 
 
349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  36.16 
 
 
324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  37.21 
 
 
303 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  37.98 
 
 
303 aa  172  5e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  37.98 
 
 
303 aa  172  5e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  37.6 
 
 
303 aa  172  5e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  37.98 
 
 
303 aa  172  5e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2224  tagatose-6-phosphate kinase  36.88 
 
 
310 aa  172  5.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  37.6 
 
 
303 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2263  tagatose-6-phosphate kinase  36.88 
 
 
310 aa  172  5.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.925431  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  37.21 
 
 
303 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  32.37 
 
 
306 aa  172  9e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  37.6 
 
 
303 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0434  1-phosphofructokinase  44.78 
 
 
328 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.89166  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  37.84 
 
 
303 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1787  1-phosphofructokinase  44.78 
 
 
328 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.661815  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  37.21 
 
 
303 aa  170  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1511  1-phosphofructokinase  35.14 
 
 
303 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000166616  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2744  1-phosphofructokinase  38.1 
 
 
318 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656221  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1715  1-phosphofructokinase  39.72 
 
 
310 aa  169  6e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0124399  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2664  1-phosphofructokinase  44.52 
 
 
321 aa  169  7e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.877221  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22720  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  36.33 
 
 
315 aa  168  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.727681  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  34.62 
 
 
316 aa  168  1e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1793  tagatose-6-phosphate kinase  35.71 
 
 
310 aa  167  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.354584  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  35.66 
 
 
303 aa  167  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2650  1-phosphofructokinase  38.54 
 
 
303 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00488  1-phosphofructokinase  42.01 
 
 
318 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1776  1-phosphofructokinase  30.03 
 
 
308 aa  163  3e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1268  1-phosphofructokinase  40.53 
 
 
314 aa  162  5.0000000000000005e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3109  1-phosphofructokinase  37.26 
 
 
318 aa  162  7e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0138  1-phosphofructokinase  34.26 
 
 
318 aa  159  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  31.94 
 
 
307 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0650  1-phosphofructokinase  32.32 
 
 
307 aa  156  5.0000000000000005e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1929  tagatose-6-phosphate kinase  33.93 
 
 
310 aa  152  8.999999999999999e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0551  1-phosphofructokinase  32.95 
 
 
306 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0382  1-phosphofructokinase  29.87 
 
 
302 aa  150  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000931152  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  31.08 
 
 
310 aa  149  4e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  30.9 
 
 
307 aa  149  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0611  1-phosphofructokinase  41.95 
 
 
328 aa  149  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  30.74 
 
 
310 aa  149  8e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1956  tagatose-6-phosphate kinase  31.1 
 
 
310 aa  148  9e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247641  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  31.3 
 
 
311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1347  1-phosphofructokinase  34.56 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.50692  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0109  1-phosphofructokinase  29.68 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1834  ribokinase-like domain-containing protein  29.22 
 
 
306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0565  1-phosphofructokinase  31.78 
 
 
306 aa  146  5e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3183  ribokinase-like domain-containing protein  39.18 
 
 
318 aa  146  5e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>