More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4347 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_4347  integrase family protein  100 
 
 
402 aa  824    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000357829 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  69.17 
 
 
401 aa  581  1e-164  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  64.43 
 
 
402 aa  548  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  46.65 
 
 
402 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  47.54 
 
 
404 aa  388  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  47.29 
 
 
404 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  47.29 
 
 
404 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  45.3 
 
 
404 aa  382  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  47.27 
 
 
409 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  47.59 
 
 
396 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  47.85 
 
 
394 aa  381  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0338398 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  46.58 
 
 
394 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  46.58 
 
 
394 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  47.34 
 
 
394 aa  379  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  45.9 
 
 
404 aa  380  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  47.44 
 
 
396 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  46.15 
 
 
404 aa  377  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  47.16 
 
 
391 aa  375  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  45.66 
 
 
417 aa  372  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  46.15 
 
 
387 aa  374  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  46.48 
 
 
404 aa  375  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  47.03 
 
 
397 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  46.15 
 
 
389 aa  372  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  46.53 
 
 
402 aa  370  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  46.11 
 
 
396 aa  365  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  46.25 
 
 
410 aa  362  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  46.89 
 
 
387 aa  362  9e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  46.8 
 
 
401 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  44.81 
 
 
394 aa  361  1e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  45.66 
 
 
396 aa  355  8.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  43.93 
 
 
393 aa  352  5e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  42.71 
 
 
395 aa  345  7e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  45.66 
 
 
391 aa  345  8e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3385  site-specific recombinase, phage integrase family  43.99 
 
 
391 aa  342  1e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059991  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  44.56 
 
 
394 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  42.64 
 
 
404 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  44.39 
 
 
404 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  44.1 
 
 
404 aa  333  4e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  42.89 
 
 
404 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  42.89 
 
 
404 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2400  phage integrase family protein  43.39 
 
 
404 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0432428  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  42.61 
 
 
404 aa  325  6e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3617  phage integrase family protein  44.44 
 
 
390 aa  324  2e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3164  integrase family protein  44.55 
 
 
428 aa  319  5e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  43.78 
 
 
404 aa  318  1e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  42.2 
 
 
438 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3412  integrase family protein  42.14 
 
 
424 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  40.55 
 
 
406 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3537  integrase family protein  41.54 
 
 
419 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6353  P4-like integrase  44.33 
 
 
407 aa  311  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  0.142283 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  42.12 
 
 
445 aa  309  5e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3419  integrase family protein  41.54 
 
 
419 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.837092  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  43.51 
 
 
401 aa  309  5.9999999999999995e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3034  integrase family protein  41.65 
 
 
419 aa  309  6.999999999999999e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3372  integrase family protein  43.55 
 
 
601 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0501  integrase family protein  41.29 
 
 
419 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  42.82 
 
 
406 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3314  site-specific recombinase, phage integrase family protein  40.69 
 
 
420 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.426306  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3676  integrase family protein  40.69 
 
 
421 aa  307  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329272  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0747  integrase family protein  40.83 
 
 
420 aa  306  3e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0631504 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3878  integrase family protein  40.69 
 
 
421 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  43.4 
 
 
429 aa  306  5.0000000000000004e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4051  phage integrase family site specific recombinase  39.95 
 
 
419 aa  305  7e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102635  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0463  phage integrase family protein  41.18 
 
 
420 aa  305  7e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0356989 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0858  integrase family protein  40.55 
 
 
419 aa  305  9.000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  40.49 
 
 
421 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2483  integrase family protein  42.72 
 
 
404 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1087  prophage CP4-like integrase  43.85 
 
 
402 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.733302 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  42.64 
 
 
419 aa  303  5.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1871  putative integrase prophage protein  41.38 
 
 
405 aa  302  7.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00740779  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0871  integrase family protein  42.16 
 
 
419 aa  302  7.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3702  integrase family protein  39.32 
 
 
418 aa  302  7.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  39.9 
 
 
420 aa  301  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0697  integrase family protein  41.49 
 
 
618 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3266  site-specific recombinase, phage integrase family  43.58 
 
 
367 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4272  site-specific recombinase, phage integrase family protein  40.35 
 
 
421 aa  301  2e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.451693  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3541  integrase family protein  39.08 
 
 
418 aa  300  3e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02085  prophage CP4-like integrase  40.92 
 
 
412 aa  299  5e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4836  integrase  40.29 
 
 
421 aa  299  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.712135 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0718  integrase family protein  41.91 
 
 
419 aa  298  1e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3540  phage integrase family site specific recombinase  39.75 
 
 
411 aa  297  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000292707  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1442  phage integrase  41.48 
 
 
404 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5324  integrase  42.23 
 
 
395 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4814  site-specific recombinase, phage integrase family protein  38.48 
 
 
422 aa  293  3e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4753  phage integrase family site specific recombinase  39.71 
 
 
421 aa  293  4e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3466  integrase family protein  40.71 
 
 
644 aa  293  4e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2072  integrase family protein  40.25 
 
 
407 aa  293  5e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.841134  normal  0.685608 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0484  phage integrase family protein  40.3 
 
 
421 aa  293  5e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  39.8 
 
 
411 aa  292  7e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  39.6 
 
 
400 aa  291  1e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2005  cp4-like integrase protein  42.12 
 
 
425 aa  291  1e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2408  integrase (int)  42.93 
 
 
617 aa  291  1e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.71715  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1097  putative phage integrase  40.1 
 
 
643 aa  290  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0408493  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1669  integrase family protein  38.61 
 
 
421 aa  291  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1340  phage integrase family protein  40.33 
 
 
487 aa  290  3e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.680009  normal  0.929089 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1977  phage integrase family protein  42.69 
 
 
617 aa  288  1e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.602154  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0447  integrase family protein  38.83 
 
 
419 aa  288  1e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3554  integrase family protein  39.81 
 
 
419 aa  287  2e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1100  site-specific recombinase, phage integrase family  40.86 
 
 
395 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3717  integrase family protein  40.15 
 
 
419 aa  286  4e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>