More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4267 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4267  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  100 
 
 		 90 aa  185  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0948  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  96.67 
 
 		 90 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0955  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  96.67 
 
 		 90 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.38141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0987  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  95.56 
 
 		 90 aa  179  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57980  putative phosphoryl carrier protein  84.44 
 
 		 90 aa  158  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5039  phosphocarrier protein HPr  84.44 
 
 		 90 aa  157  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.37142  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0866  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  82.22 
 
 		 90 aa  156  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.176719  normal  0.959659 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4151  phosphocarrier HPr protein  78.89 
 
 		 90 aa  155  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4457  phosphocarrier protein HPr  80 
 
 		 90 aa  154  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.576235  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12750  Phosphocarrier NPr protein  81.11 
 
 		 90 aa  153  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0853  HPrNtr  76.67 
 
 		 91 aa  146  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914753 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3182  HNH nuclease  56.67 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4897  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  55.56 
 
 		 89 aa  103  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0408  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  57.65 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0296  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  55.56 
 
 		 89 aa  100  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166635 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2420  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  54.44 
 
 		 89 aa  100  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.11815 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0291  phosphocarrier, HPr family  54.44 
 
 		 89 aa  100  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2719  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  58.89 
 
 		 89 aa  99.8  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0353  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  56.67 
 
 		 89 aa  99.8  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000307134 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0222  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  57.78 
 
 		 89 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000064621 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4083  phosphoryl transfer system, HPr  52.22 
 
 		 89 aa  99.4  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1657  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  55.56 
 
 		 89 aa  99  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.769211 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0324  phosphocarrier protein HPr  53.33 
 
 		 89 aa  99  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0273003  normal  0.0186594 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0296  phosphoryl transfer system, HPr  57.78 
 
 		 89 aa  98.2  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1952  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  55.56 
 
 		 89 aa  98.6  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0203  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  56.67 
 
 		 89 aa  97.4  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405136  normal  0.268008 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0245  hypothetical protein  56.67 
 
 		 89 aa  97.1  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.519653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2234  HPr family phosphocarrier protein  54.02 
 
 		 119 aa  95.9  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0376  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  53.41 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.293876 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0347  phosphohistidinoprotein-hexose phosphotransferase  55.56 
 
 		 89 aa  93.6  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2799  phosphoryl transfer system, HPr  54.44 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0298  HPrNtr  52.22 
 
 		 89 aa  91.3  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1031  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  51.76 
 
 		 89 aa  90.1  9e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6190  HPrNtr  51.11 
 
 		 89 aa  90.1  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0720  phosphoryl transfer system, HPr  51.11 
 
 		 89 aa  89.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0147  HPrNtr  51.11 
 
 		 89 aa  90.1  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.377653 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2916  HPr family phosphocarrier protein  51.11 
 
 		 89 aa  88.2  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1281  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  52.94 
 
 		 89 aa  88.6  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2778  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  51.11 
 
 		 89 aa  88.2  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2247  phosphotransferase system, HPr  51.11 
 
 		 89 aa  88.2  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2861  HPr family phosphocarrier protein  51.11 
 
 		 89 aa  88.2  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324976  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2872  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  51.11 
 
 		 89 aa  88.2  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424776  normal  0.410297 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0412  phosphocarrier protein HPr  50 
 
 		 89 aa  87  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.889761  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2966  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  52.27 
 
 		 88 aa  87  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.351605  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0442  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  48.89 
 
 		 89 aa  86.7  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0530  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  47.78 
 
 		 89 aa  86.7  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0602783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0238  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  50 
 
 		 89 aa  86.7  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.610305  normal  0.320844 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2833  phosphocarrier protein HPr  50 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.858125  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0492  phosphocarrier protein HPr  50 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0473  phosphocarrier protein HPr  50 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3212  phosphocarrier protein HPr  50 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0657  phosphocarrier protein HPr  50 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.300797  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4185  HPrNtr  47.78 
 
 		 89 aa  86.3  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0186  phosphocarrier protein HPr  50 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1406  phosphocarrier protein HPr  50 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1288  HPrNtr  52.27 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.12196  hitchhiker  0.00000200864 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0219  HPrNtr  48.89 
 
 		 89 aa  85.9  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0540  hypothetical protein  50 
 
 		 89 aa  84.7  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0516  hypothetical protein  50 
 
 		 89 aa  84.7  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0261  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  47.78 
 
 		 89 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0468  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  48.89 
 
 		 89 aa  83.2  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.278707  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2161  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  47.73 
 
 		 88 aa  82  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1757  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  46.59 
 
 		 88 aa  81.3  0.000000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0744  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  48.89 
 
 		 89 aa  81.3  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4626  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  47.73 
 
 		 92 aa  80.9  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.563542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0371  phosphotransferase system, HPr  51.14 
 
 		 111 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0255941 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3385  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  52.38 
 
 		 88 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0357  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  51.14 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1882  phosphocarrier protein HPr  46.59 
 
 		 88 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38742  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1930  phosphocarrier protein HPr  47.73 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000294443  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1209  phosphocarrier protein HPr  44.32 
 
 		 89 aa  79  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0874  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  52.38 
 
 		 88 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0756  phosphocarrier protein HPr  44.32 
 
 		 89 aa  79  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2413  HPrNtr  45.45 
 
 		 89 aa  78.2  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.981961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002399  phosphocarrier protein nitrogen regulation associated  43.18 
 
 		 91 aa  78.2  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3446  HPrNtr  52.33 
 
 		 112 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0948  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  46.59 
 
 		 89 aa  77.4  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.660983 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2760  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  46.99 
 
 		 93 aa  77.4  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0566866 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03668  hypothetical protein  42.05 
 
 		 91 aa  77  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0467  HPrNtr  50 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.319274  normal  0.40713 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0602  HPrNtr  54.76 
 
 		 89 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02220  phosphotransferase system HPr enzyme  45.45 
 
 		 89 aa  74.3  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.340612  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0593  HPrNtr  50 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.040328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7372  PTS system phosphocarrier protein HPr  46.51 
 
 		 109 aa  73.6  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.912866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2848  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  47.13 
 
 		 96 aa  73.6  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0751  phosphotransferase system HPr enzyme  42.05 
 
 		 89 aa  72.8  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.862158  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1900  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  49.4 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0610024 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0665  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  42.05 
 
 		 89 aa  72.4  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0251  phosphocarrier, HPr family  43.68 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2132  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  45.56 
 
 		 91 aa  72.8  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.595795  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3315  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  43.68 
 
 		 91 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.297486  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0229  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  45.45 
 
 		 106 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0207173 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0439  HPrNtr  46.59 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3092  phosphocarrier protein NPR  42.35 
 
 		 91 aa  70.1  0.000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.429943  normal  0.129077 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5437  phosphocarrier, HPr family  44.83 
 
 		 106 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0438288  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03197  phosphocarrier protein NPR  41.38 
 
 		 90 aa  69.7  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.789521  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0682  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  44.19 
 
 		 91 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.520502  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0015  HPrNtr  40.45 
 
 		 93 aa  69.3  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000952712 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0152  HPrNtr  43.33 
 
 		 90 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28673  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0485  phosphotransferase system, HPr  39.53 
 
 		 91 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.467636  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>