35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4245 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4245  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  322  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0978  hypothetical protein  88.39 
 
 		 158 aa  290  4e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.71902  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0971  hypothetical protein  87.1 
 
 		 158 aa  286  7e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1010  hypothetical protein  85.81 
 
 		 158 aa  283  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0979  hypothetical protein  76.97 
 
 		 157 aa  250  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1261  hypothetical protein  72.08 
 
 		 174 aa  239  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.190288  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1079  hypothetical protein  69.48 
 
 		 163 aa  219  9e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5410  protein of unknown function DUF1486  65.36 
 
 		 163 aa  213  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.691604  normal  0.630541 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3555  hypothetical protein  66.67 
 
 		 156 aa  213  9e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.159937 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1198  hypothetical protein  62.99 
 
 		 159 aa  205  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198926  normal  0.424517 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14130  hypothetical protein  61.74 
 
 		 160 aa  196  9e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0339955  normal  0.12705 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5328  hypothetical protein  58.82 
 
 		 157 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0131441 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5607  hypothetical protein  58.82 
 
 		 157 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206103  normal  0.841881 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3674  hypothetical protein  58.82 
 
 		 157 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0168299  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4693  hypothetical protein  58.82 
 
 		 157 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146781  normal  0.148088 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1127  hypothetical protein  58.82 
 
 		 157 aa  186  7e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.236072 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1255  hypothetical protein  62.42 
 
 		 160 aa  179  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2797  hypothetical protein  48.37 
 
 		 156 aa  161  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0482  hypothetical protein  55.06 
 
 		 165 aa  151  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2583  hypothetical protein  42.57 
 
 		 158 aa  138  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6429  hypothetical protein  44.94 
 
 		 164 aa  135  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1448  hypothetical protein  44.52 
 
 		 162 aa  130  5e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3730  hypothetical protein  46.45 
 
 		 171 aa  130  6e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0347674 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4477  hypothetical protein  49.03 
 
 		 174 aa  114  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl176  hypothetical protein  32.64 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3840  hypothetical protein  29.38 
 
 		 170 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.223195  normal  0.195443 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3037  hypothetical protein  31.97 
 
 		 172 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3124  RNA polymerase factor sigma-70  44.23 
 
 		 334 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.093145  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2281  hypothetical protein  29.69 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0546  hypothetical protein  27.43 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000563714  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0690  hypothetical protein  29.33 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3232  RNA polymerase factor sigma-70  45.83 
 
 		 334 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0107051  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4291  hypothetical protein  31.3 
 
 		 220 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5300  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  52.08 
 
 		 351 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.016661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0629  hypothetical protein  29.69 
 
 		 133 aa  40.4  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.91146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>