112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4170 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1449  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  73.51 
 
 
1508 aa  2227    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.597308 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3791  filamentous haemagglutinin-like protein  37.99 
 
 
1489 aa  834    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.615569 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4272  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  73.37 
 
 
1508 aa  2208    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4642  hemolysin  41 
 
 
1651 aa  847    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.154721  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1053  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  73.24 
 
 
1508 aa  2207    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.21388  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4170  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  100 
 
 
1508 aa  3008    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0207391  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4482  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.02 
 
 
1615 aa  504  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.751989  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3922  hemagglutination activity domain-containing protein  28.22 
 
 
1635 aa  437  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0299  hemolysin  27.92 
 
 
1618 aa  433  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.420803  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2156  filamentous haemagglutinin domain-containing protein  23.77 
 
 
1631 aa  265  6.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.435206  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2044  adhesin/hemagglutinin  24.32 
 
 
1615 aa  263  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.105561  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  39.57 
 
 
1723 aa  154  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.290227  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0053  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.49 
 
 
3967 aa  148  9e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.927925 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2177  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  36.06 
 
 
1730 aa  148  9e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1528  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.32 
 
 
2670 aa  146  4e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5769  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  32.08 
 
 
2827 aa  146  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.531028 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2437  hypothetical protein  22.55 
 
 
889 aa  140  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.16487  hitchhiker  0.0003202 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2522  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  35.1 
 
 
5981 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3151  adhesin  35.82 
 
 
2758 aa  137  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00510  putative hemagglutinin  35.46 
 
 
3443 aa  137  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.443452 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32790  hypothetical protein  34.58 
 
 
5212 aa  137  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000189329 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2777  filamentous hemagglutinin  35.13 
 
 
3563 aa  135  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3229  filamentous hemagglutinin, intein-containing, putative  36.57 
 
 
6274 aa  134  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5446  adhesin  32.86 
 
 
3929 aa  134  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4402  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.42 
 
 
3040 aa  133  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.887533  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1281  haemagglutination activity domain protein  38.78 
 
 
1270 aa  133  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.326078 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2008  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  33.01 
 
 
3796 aa  132  6e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0043  adhesin/hemagglutinin  34.74 
 
 
594 aa  131  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1913  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.13 
 
 
3790 aa  130  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0155  filamentous haemagglutinin / adhesin  28.43 
 
 
1841 aa  130  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2330  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  26.28 
 
 
2600 aa  128  9e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1775  hemagglutinin-related protein  33.1 
 
 
3165 aa  127  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02477  hemagglutinin-related protein  33.12 
 
 
3322 aa  128  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0926813  normal  0.901067 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4077  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.87 
 
 
3602 aa  125  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7307  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.56 
 
 
3020 aa  125  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0209346 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3717  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.12 
 
 
923 aa  122  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.562424 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2802  haemagglutinin  30.23 
 
 
3141 aa  122  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0418  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  35.83 
 
 
812 aa  122  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.740243  normal  0.11734 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1170  adhesin/hemolysin  30.23 
 
 
3141 aa  121  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0887  hemagglutinin-related protein  33.93 
 
 
3501 aa  121  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.386493 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5341  putative adhesin/hemolysin  28.48 
 
 
3004 aa  121  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4291  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.08 
 
 
3079 aa  121  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3779  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.57 
 
 
3028 aa  120  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.321451 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3880  filamentous haemagglutinin/adhesin  34.57 
 
 
3159 aa  120  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0510  adhesin/hemagglutinin  27.68 
 
 
3350 aa  120  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2001  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  34.35 
 
 
3862 aa  119  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0377  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.37 
 
 
3128 aa  119  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0370  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.34 
 
 
2421 aa  118  6.9999999999999995e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05701  hemagglutinin-related protein  31.82 
 
 
3552 aa  118  8.999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.12 
 
 
658 aa  117  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1622  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29 
 
 
2545 aa  117  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1750  hemagglutination activity domain-containing protein  32.13 
 
 
2530 aa  116  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000776384 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0433  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.3 
 
 
2345 aa  116  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365206  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1519  hemagglutinin/adhesin repeat-containing protein  32.13 
 
 
2588 aa  115  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2858  filamentous haemagglutinin/adhesin  31.87 
 
 
3301 aa  115  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.892494 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1129  cell surface protein  25.68 
 
 
3141 aa  115  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4729  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.9 
 
 
428 aa  115  9e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.257698  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2930  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  31.49 
 
 
2536 aa  114  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1277  adhesin/hemolysin  26.55 
 
 
3131 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4525  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  35.25 
 
 
3884 aa  114  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0483  adhesin  27.03 
 
 
1998 aa  113  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1122  cell surface protein  26.04 
 
 
3144 aa  112  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.691127  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0744  hemagglutination activity domain-containing protein  25.32 
 
 
1745 aa  111  1e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0630487  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6351  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  34.17 
 
 
3785 aa  111  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5133  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  48.41 
 
 
721 aa  110  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.532528 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3647  filamentous haemagglutinin  32.37 
 
 
2984 aa  109  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7346  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.54 
 
 
2666 aa  108  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.550949 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5361  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  25.33 
 
 
2847 aa  106  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5732  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.99 
 
 
2782 aa  106  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05770  hemagglutinin-related protein  32.54 
 
 
2737 aa  105  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.245553  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2221  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.33 
 
 
3475 aa  103  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0113  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  27.46 
 
 
4966 aa  102  6e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.352935 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5058  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  34.6 
 
 
2786 aa  102  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1044  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.67 
 
 
3480 aa  101  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1895  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.67 
 
 
3378 aa  101  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6766  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.38 
 
 
2818 aa  99  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5443  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.94 
 
 
730 aa  97.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.34159  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0093  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  31.65 
 
 
3081 aa  95.5  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02101  putative hemagglutinin-related protein  32.81 
 
 
2691 aa  94.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.386866 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02976  filamentous haemagglutinin; haemagglutination activity domain protein  29.48 
 
 
3526 aa  94.7  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.224102  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3188  putative hemagglutinin-related protein  32.54 
 
 
2751 aa  94  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.513834 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0152  filamentous haemagglutinin  31.32 
 
 
716 aa  87.8  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1536  hemagglutination activity domain-containing protein  26.51 
 
 
2449 aa  88.2  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.043951  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2335  putative transcriptional activator  25.83 
 
 
2350 aa  87  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3183  hemagglutinin-like signal peptide protein  31 
 
 
846 aa  87  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.855089  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1756  hemagglutinin, homlog  29.22 
 
 
905 aa  86.7  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.982994  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0801  hemagglutinin, homlog  29.22 
 
 
893 aa  87  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1614  hemagglutinin, homlog  29.22 
 
 
905 aa  86.7  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5056  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.56 
 
 
847 aa  86.7  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.776969  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1822  hemagglutinin, homlog  29.22 
 
 
898 aa  86.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2480  hemagglutinin-like protein  29.22 
 
 
914 aa  86.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.168613  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2341  hemagglutinin-like protein  29.22 
 
 
901 aa  86.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0492  hemagglutinin-like protein  29.22 
 
 
911 aa  86.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5359  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.88 
 
 
678 aa  86.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.627453 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6763  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.64 
 
 
678 aa  86.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198523  normal  0.504968 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4077  putative hemagglutinin/hemolysin  26.92 
 
 
463 aa  84.7  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04813  hemagglutinin-like signal peptide protein  29.17 
 
 
846 aa  84  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.565889  normal 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_1682  filamentous haemagglutinin family protein  25 
 
 
1719 aa  82  0.00000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4128  hypothetical protein  27.83 
 
 
463 aa  80.9  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0784897  normal  0.299338 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0085  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.83 
 
 
463 aa  80.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.741703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>