115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4127 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_4127  CheW protein  100 
 
 
221 aa  440  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0808304  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1096  CheW protein  77.38 
 
 
221 aa  345  3e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.153582  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4231  putative CheW protein  75.57 
 
 
221 aa  335  2e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1491  CheW domain-containing protein  75.81 
 
 
215 aa  328  5e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000195231  normal  0.824381 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1055  CheW protein  63.43 
 
 
227 aa  241  5e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16460  CheW domain-containing protein  56.09 
 
 
229 aa  241  9e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.15131  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1496  CheW domain protein  62.04 
 
 
229 aa  234  1e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1306  CheW-like protein  61.79 
 
 
229 aa  230  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00397528 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1432  hypothetical protein  58.37 
 
 
229 aa  223  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320082  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3650  CheW protein  41.12 
 
 
225 aa  151  9e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.107896  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3790  CheW protein  39.29 
 
 
233 aa  145  4e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948042  normal  0.361665 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4573  CheW protein  39.29 
 
 
233 aa  145  4e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468736  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2305  CheW protein  38.18 
 
 
235 aa  145  4e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.327195 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3976  CheW protein  41.1 
 
 
226 aa  145  4e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3734  CheW protein  39.29 
 
 
233 aa  145  4e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576231  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5392  CheW protein  40.81 
 
 
233 aa  140  1e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal  0.324475 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3970  putative chemotaxis signal transduction protein CheW  38.98 
 
 
250 aa  140  1e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000212039  hitchhiker  0.0041707 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5516  CheW protein  37.66 
 
 
240 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334912  normal  0.661174 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3682  CheW protein  36.64 
 
 
238 aa  136  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358535  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2030  CheW protein  34.58 
 
 
253 aa  134  9e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2056  CheW protein  34.58 
 
 
253 aa  134  9e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0504  chemotaxis protein cheW  36.16 
 
 
239 aa  134  2e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369633  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0257  chemotaxis protein cheW  36.24 
 
 
244 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2539  CheW domain-containing protein  36.24 
 
 
244 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155706  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1598  chemotaxis protein cheW  36.24 
 
 
244 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1401  chemotaxis protein cheW  36.24 
 
 
244 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4943  CheW protein  37.12 
 
 
247 aa  132  4e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318865  normal  0.879884 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2684  CheW domain-containing protein  35.93 
 
 
246 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1524  CheW protein  32.43 
 
 
246 aa  129  5e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0965  chemotaxis protein cheW  41.45 
 
 
201 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0220  chemotaxis protein cheW  41.45 
 
 
201 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.981977  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0830  CheW-like domain-containing protein  33.65 
 
 
217 aa  100  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  32.21 
 
 
152 aa  57.8  1e-07  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2148  CheW protein  26.67 
 
 
140 aa  57.8  1e-07  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0798486  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  32.21 
 
 
152 aa  57.8  1e-07  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2493  putative CheW protein  27.33 
 
 
299 aa  52  8e-06  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1372  response regulator receiver modulated CheW protein  26.67 
 
 
299 aa  49.3  4e-05  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980078 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1437  response regulator receiver modulated CheW protein  26.67 
 
 
299 aa  49.3  4e-05  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.080472 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5306  CheW protein  35.05 
 
 
179 aa  49.3  5e-05  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0138969  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3123  chemotaxis protein CheV  26.67 
 
 
299 aa  48.9  6e-05  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1425  response regulator receiver modulated CheW protein  26.67 
 
 
299 aa  48.9  7e-05  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.419487  normal  0.0812955 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  24.16 
 
 
163 aa  48.5  8e-05  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1463  response regulator receiver modulated CheW protein  27.33 
 
 
308 aa  48.5  9e-05  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0280  CheW protein  29.41 
 
 
155 aa  47.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128089  normal  0.922662 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  27.03 
 
 
176 aa  47.8  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  28.03 
 
 
158 aa  46.6  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  26.15 
 
 
154 aa  46.6  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3396  putative CheW protein  28.57 
 
 
295 aa  46.6  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.591298  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2676  CheW protein  35.64 
 
 
212 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0640816  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1348  CheW protein  28.28 
 
 
167 aa  46.2  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1195  CheW protein  35.29 
 
 
212 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4612  CheW protein  29.66 
 
 
531 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0927  CheW protein  23.74 
 
 
157 aa  46.2  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.176763  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5776  CheW protein  30.37 
 
 
185 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.727432  normal  0.120994 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4816  CheW protein  32.11 
 
 
189 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00422429 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2771  CheW protein  35.29 
 
 
212 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0420843  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  25.66 
 
 
167 aa  45.4  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  25.87 
 
 
183 aa  45.4  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  20.95 
 
 
158 aa  45.1  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03881  putative response regulator transcription regulator protein  31.86 
 
 
313 aa  45.1  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  0.59764 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1566  putative CheW protein  31.03 
 
 
169 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  normal  0.497426 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1369  putative CheW protein  24.49 
 
 
302 aa  44.7  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  7.15462e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  27.45 
 
 
139 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4573  response regulator receiver modulated CheW protein  30.7 
 
 
316 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.639433 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3501  response regulator receiver modulated CheW protein  30.7 
 
 
316 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.598076 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6784  CheW protein  31.47 
 
 
199 aa  43.9  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.428989 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3734  response regulator receiver modulated CheW protein  29.17 
 
 
309 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4393  chemotaxis protein CheV  29.58 
 
 
309 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0324  CheW protein  25.52 
 
 
161 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4120  CheW protein  25.52 
 
 
151 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.27849e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1777  chemotaxis protein CheV  25.53 
 
 
302 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.782238  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  25.69 
 
 
189 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1445  CheW protein  32.33 
 
 
161 aa  43.5  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001360  chemotaxis protein CheV  22.67 
 
 
304 aa  43.9  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1832  chemotaxis protein CheV  25.53 
 
 
302 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1461  putative CheW protein  29.58 
 
 
309 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3954  response regulator receiver modulated CheW protein  27.85 
 
 
309 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3623  chemotaxis protein CheV  25.53 
 
 
302 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1723  chemotaxis protein CheV  25.53 
 
 
302 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0357  CheW protein  36.71 
 
 
183 aa  43.1  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0717557  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0405  putative CheW protein  34.23 
 
 
177 aa  43.5  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  25.85 
 
 
162 aa  43.5  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3205  CheW protein  26.53 
 
 
162 aa  43.1  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200572  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1533  chemotaxis protein  25.53 
 
 
302 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1544  chemotaxis protein  25.53 
 
 
302 aa  43.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0242489  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0924  response regulator receiver modulated CheW protein  27.33 
 
 
309 aa  42.7  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  41.51 
 
 
161 aa  42.7  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0744  CheW protein  34.44 
 
 
170 aa  43.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  22.88 
 
 
159 aa  42.7  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1754  chemotaxis protein CheV  25.53 
 
 
302 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2215  putative chemotaxis protein  25.33 
 
 
316 aa  42.4  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3624  CheW protein  28.29 
 
 
159 aa  42.4  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0874566 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0878  CheW protein  29.69 
 
 
192 aa  42.7  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00285186  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1068  putative CheW protein  28.47 
 
 
309 aa  42.4  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0334866  normal  0.0302452 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2817  CheW protein  26.26 
 
 
141 aa  42.4  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  21.23 
 
 
163 aa  42.4  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2285  CheW protein  24.75 
 
 
141 aa  42.4  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.126917  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1485  CheW protein  27.94 
 
 
170 aa  42.4  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.02816 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1573  response regulator receiver modulated CheW protein  24.48 
 
 
302 aa  42  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204601  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  28.28 
 
 
163 aa  42  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>