65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4049 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4049  putative phage repressor  100 
 
 		 248 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00309972  hitchhiker  0.0000000001929 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1135  phage repressor  83.47 
 
 		 270 aa  413  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  47.76 
 
 		 259 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  42.44 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  42.44 
 
 		 256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  44.69 
 
 		 237 aa  175  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  44.69 
 
 		 237 aa  175  7e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  41.67 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  44.17 
 
 		 263 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  41.13 
 
 		 243 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2563  putative phage repressor  41.33 
 
 		 225 aa  164  9e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2990  prophage LambdaSo, Cro/CI family transcriptional regulator  53.95 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  40.36 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  39.56 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  39.56 
 
 		 233 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  38.94 
 
 		 229 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  38.05 
 
 		 229 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  51.01 
 
 		 229 aa  152  4e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  43.3 
 
 		 240 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  49.33 
 
 		 240 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1011  putative phage repressor  38.05 
 
 		 218 aa  134  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.763396  unclonable  0.00000301408 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  34.54 
 
 		 241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  31.76 
 
 		 244 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1875  putative phage repressor  32.55 
 
 		 244 aa  111  9e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0721  transcriptional regulator, putative  38.13 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0623  peptidase S24, S26A and S26B  37.06 
 
 		 243 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4997  transcriptional regulator  32 
 
 		 246 aa  102  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3211  putative phage repressor  30.99 
 
 		 248 aa  92.4  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.02032 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  28.93 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  28.7 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  33.5 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  27.83 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4418  putative phage repressor  31.79 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000888993  normal  0.473724 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0582  transcriptional regulator  31.58 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.794333 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  28.79 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0537  transcriptional regulator, putative  29.82 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0641  putative phage repressor  33.86 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0576  hypothetical protein  29.82 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.664353  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  25.22 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  32.41 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1268  repressor protein, putative  25.98 
 
 		 230 aa  55.1  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.019488  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  27.32 
 
 		 222 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0248  hypothetical protein  23.33 
 
 		 233 aa  53.1  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  25.55 
 
 		 247 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0191  hypothetical protein  38.1 
 
 		 215 aa  52.4  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2128  putative phage repressor  25.69 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4113  putative phage repressor  33.88 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0271974  hitchhiker  0.00000000858644 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  26.81 
 
 		 213 aa  50.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1272  putative phage repressor  26.09 
 
 		 263 aa  49.7  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.343387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0589  transcriptional regulator  24.69 
 
 		 233 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1192  putative phage repressor  29.88 
 
 		 252 aa  48.9  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1619  putative phage repressor  26.14 
 
 		 237 aa  48.5  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0134521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  27.41 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 229 aa  47  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  23.75 
 
 		 205 aa  46.6  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0176  hypothetical protein  33.78 
 
 		 239 aa  47  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  33.68 
 
 		 292 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  26.46 
 
 		 261 aa  46.2  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  27.14 
 
 		 233 aa  45.4  0.0009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  26.67 
 
 		 264 aa  43.9  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  24.86 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  26.61 
 
 		 227 aa  43.5  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  26.67 
 
 		 264 aa  43.9  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  24.51 
 
 		 225 aa  42.7  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4195  XRE family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 204 aa  42.4  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>