11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4047 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4047  phage protein  100 
 
 		 165 aa  335  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000148405  hitchhiker  0.00000000000068714 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08000  hypothetical protein  35.67 
 
 		 171 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000019047  hitchhiker  0.000226613 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0759  hypothetical protein  34.12 
 
 		 171 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0770889  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3404  hypothetical protein  32.74 
 
 		 175 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1203  hypothetical protein  32.94 
 
 		 176 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00632413 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3050  hypothetical protein  31.33 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1295  hypothetical protein  25.15 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.324893 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1869  hypothetical protein  24 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0686  hypothetical protein  25.5 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0407  hypothetical protein  45.83 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1146  hypothetical protein  45.83 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>