33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4035 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4035  tail X family protein  100 
 
 		 68 aa  144  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.743163  unclonable  0.0000000000000167658 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3391  tail protein X  65.67 
 
 		 68 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1217  tail X family protein  57.35 
 
 		 68 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000611286 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0771  hypothetical protein  55.88 
 
 		 68 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32140  Phage tail X protein  62.9 
 
 		 64 aa  87.8  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08140  hypothetical protein  55.88 
 
 		 68 aa  87  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  3.77075e-17  hitchhiker  0.000171752 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3064  pyocin R2_PP, tail component protein  55.22 
 
 		 68 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.471622  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1855  phage tail X family protein  58.21 
 
 		 68 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.520238  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3176  tail X family protein  47.46 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4370  phage Tail Protein X  47.54 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.621111  hitchhiker  0.00000000857758 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3047  phage tail protein GpX  44.26 
 
 		 67 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000083115 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3496  phage tail X family protein  43.28 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.147017 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4328  phage tail protein GpX  44.26 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292132 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2646  tail X family protein  35.94 
 
 		 67 aa  50.1  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00667297  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2290  phage tail X family protein  40 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.525878  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3320  phage tail X  40 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2863  phage Tail Protein X  40.62 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2372  phage tail X  41.43 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1829  tail X family protein  36.07 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00586529  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2332  tail X family protein  42.37 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0325995  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37560  Phage P2 tail gpX-like protein  41.79 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.881867  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0752  hypothetical protein  40.32 
 
 		 70 aa  47.4  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.286797  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_002978  WD0568  prophage P2W3, tail protein X, putative  33.33 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.37075  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2088  tail X family protein  37.7 
 
 		 67 aa  45.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0545873  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1624  P2-like protein prophage tail protein X-like protein  37.74 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1934  bacteriophage protein  36.92 
 
 		 68 aa  45.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.5631  normal  0.801255 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2911  tail X family protein  35.29 
 
 		 69 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.125785  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1346  Phage tail protein X  43.48 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3294  phage tail X family protein  35.38 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0873  tail X family protein  38.1 
 
 		 67 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0899137 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0882  tail X family protein  36.11 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1279  phage tail X  34.38 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.439324 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01358  phage Tail Protein X  38.1 
 
 		 64 aa  40  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00715171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>