More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3980 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1262  peptidase M48, Ste24p  96.86 
 
 		 478 aa  916    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349395  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1232  hypothetical protein  96.86 
 
 		 478 aa  917    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1658  peptidase M48, Ste24p  75.84 
 
 		 477 aa  714    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.782843  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3958  hypothetical protein  81.09 
 
 		 477 aa  776    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1543  peptidase M48, Ste24p  82.14 
 
 		 477 aa  782    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.457387  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1366  peptidase M48, Ste24p  83.02 
 
 		 477 aa  744    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3980  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 478 aa  966    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4186  peptidase M48 Ste24p  96.44 
 
 		 478 aa  912    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.129955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51320  hypothetical protein  71.64 
 
 		 477 aa  662    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000410651 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4392  hypothetical protein  71.85 
 
 		 477 aa  659    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35380  Peptidase, M48 family  72.93 
 
 		 411 aa  583  1.0000000000000001e-165  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2576  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.13 
 
 		 503 aa  357  2.9999999999999997e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1695  peptidase M48, Ste24p  43.27 
 
 		 490 aa  307  2.0000000000000002e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160832  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  36.75 
 
 		 484 aa  293  3e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  38.19 
 
 		 473 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2820  peptidase M48, Ste24p  41.25 
 
 		 481 aa  282  1e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2384  peptidase  37.15 
 
 		 484 aa  266  7e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2641  TPR repeat-containing protein YfgC  36.07 
 
 		 487 aa  252  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00482944  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2731  TPR repeat-containing protein YfgC  36.07 
 
 		 487 aa  252  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.211116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2689  TPR repeat-containing protein YfgC  35.86 
 
 		 487 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.534359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2862  TPR repeat-containing protein YfgC  35.86 
 
 		 487 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2753  TPR repeat-containing protein YfgC  35.86 
 
 		 487 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2868  peptidase, M48 family  37 
 
 		 487 aa  251  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1841  peptidase M48, Ste24p  35.32 
 
 		 485 aa  251  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.891186  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002788  zinc metalloprotease  35.81 
 
 		 483 aa  250  3e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1744  hypothetical protein  36.79 
 
 		 484 aa  249  5e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02386  predicted peptidase  37.15 
 
 		 487 aa  249  6e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0985911  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1175  peptidase M48 Ste24p  37.15 
 
 		 487 aa  249  6e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.108568  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3716  peptidase, M48 family  36.77 
 
 		 487 aa  249  6e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.997857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02348  hypothetical protein  37.15 
 
 		 487 aa  249  6e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14863  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2776  M48 family peptidase  37.15 
 
 		 487 aa  249  6e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00342563  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2628  M48 family peptidase  37.15 
 
 		 487 aa  249  6e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1182  peptidase M48 Ste24p  37.15 
 
 		 487 aa  249  6e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0564416 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2978  peptidase M48, Ste24p  36.3 
 
 		 487 aa  249  7e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.604124  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2641  M48 family peptidase  36.92 
 
 		 487 aa  248  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.938933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03193  protease  35.74 
 
 		 484 aa  247  4e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2169  peptidase M48 Ste24p  33.47 
 
 		 486 aa  241  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1913  peptidase M48, Ste24p  35.38 
 
 		 489 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.910226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2482  peptidase M48, Ste24p  34.75 
 
 		 488 aa  239  8e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1971  peptidase M48 Ste24p  33.48 
 
 		 486 aa  237  4e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.436824  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1356  peptidase M48 Ste24p  35.58 
 
 		 524 aa  236  8e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1239  M48 family peptidase  35.58 
 
 		 494 aa  235  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000273921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3127  M48 family peptidase  35.58 
 
 		 494 aa  235  1.0000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000135694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1069  peptidase M48 Ste24p  35.37 
 
 		 488 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3190  hypothetical protein  34.44 
 
 		 483 aa  235  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.602192  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  35.78 
 
 		 474 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  34.1 
 
 		 500 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3182  peptidase M48 Ste24p  35.75 
 
 		 487 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258553  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3517  peptidase M48 Ste24p  34.89 
 
 		 487 aa  233  5e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000725556  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2987  peptidase M48 Ste24p  35.47 
 
 		 487 aa  233  8.000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.595956  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2792  peptidase M48 Ste24p  35.9 
 
 		 479 aa  232  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  32.6 
 
 		 487 aa  232  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  32.77 
 
 		 605 aa  231  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1134  peptidase M48 Ste24p  35.65 
 
 		 487 aa  230  4e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1647  peptidase M48, Ste24p  35.94 
 
 		 490 aa  229  7e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2869  hypothetical protein  33.82 
 
 		 489 aa  229  9e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1790  peptidase M48 Ste24p  33.19 
 
 		 489 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1827  peptidase M48 Ste24p  33.19 
 
 		 489 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.223751  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2495  peptidase M48 Ste24p  33.19 
 
 		 489 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1783  peptidase M48 Ste24p  33.19 
 
 		 489 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.510736  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1649  peptidase M48, Ste24p  33.76 
 
 		 489 aa  228  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1695  peptidase M48, Ste24p  34.74 
 
 		 485 aa  228  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2347  peptidase M48, Ste24p  33.76 
 
 		 489 aa  228  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.300143  decreased coverage  0.00000000108832 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2419  peptidase M48, Ste24p  33.76 
 
 		 489 aa  228  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.339461  hitchhiker  0.00116652 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2437  peptidase M48, Ste24p  33.68 
 
 		 486 aa  227  4e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00870552 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1755  peptidase M48, Ste24p  34.91 
 
 		 489 aa  223  8e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0568  M48 family peptidase  38.27 
 
 		 518 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  31.78 
 
 		 475 aa  220  5e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0926  peptidase M48, Ste24p  33.11 
 
 		 481 aa  218  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.240705 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  31.64 
 
 		 502 aa  216  7e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0661  peptidase M48 Ste24p  34.89 
 
 		 593 aa  213  9e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2684  peptidase M48, Ste24p  34.29 
 
 		 564 aa  210  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.678599  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2557  peptidase M48 Ste24p  34.29 
 
 		 564 aa  210  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2637  peptidase M48, Ste24p  33.83 
 
 		 588 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2026  peptidase M48, Ste24p  33.83 
 
 		 588 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339174  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2666  peptidase M48 Ste24p  33.69 
 
 		 564 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  31.71 
 
 		 573 aa  207  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0450  peptidase M48 Ste24p  31.91 
 
 		 562 aa  206  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  32.91 
 
 		 567 aa  206  7e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  31.98 
 
 		 561 aa  205  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  33.1 
 
 		 480 aa  204  4e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5968  peptidase M48, Ste24p  33.47 
 
 		 588 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0680  hypothetical protein  32.26 
 
 		 590 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  32.07 
 
 		 569 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  33.33 
 
 		 589 aa  200  5e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0825  peptidase M48 Ste24p  30.23 
 
 		 566 aa  197  3e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0287  hypothetical protein  32.83 
 
 		 560 aa  196  7e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0028  hypothetical protein  32.83 
 
 		 572 aa  196  7e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189438  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0824  hypothetical protein  32.83 
 
 		 572 aa  196  7e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2415  hypothetical protein  32.83 
 
 		 572 aa  196  7e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0582  hypothetical protein  32.83 
 
 		 572 aa  196  7e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10883  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0827  hypothetical protein  32.83 
 
 		 589 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0985  M48 family peptidase  32.83 
 
 		 589 aa  196  9e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399945  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3286  peptidase M48 Ste24p  32.05 
 
 		 569 aa  193  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  34.69 
 
 		 483 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1823  peptidase M48, Ste24p  32.09 
 
 		 562 aa  184  3e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02491  protease  29.9 
 
 		 533 aa  183  5.0000000000000004e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1179  hypothetical protein  27.09 
 
 		 478 aa  181  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1185  hypothetical protein  26.86 
 
 		 478 aa  181  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1538  peptidase M48 Ste24p  29.54 
 
 		 565 aa  177  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>