70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3944 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_3944  HK97 family phage prohead protease  100 
 
 
213 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130087  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3708  HK97 family phage prohead protease  41.26 
 
 
371 aa  122  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0589  prohead protease  38.97 
 
 
222 aa  114  7.999999999999999e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0588  protease, putative  38.97 
 
 
222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0905  HK97 family phage prohead protease  40.43 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.963792  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1337  phage prohead protease HK97 family  41.61 
 
 
189 aa  99.8  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00130891  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1718  peptidase U35, phage prohead HK97  37.16 
 
 
176 aa  98.2  9e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.806315  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0447  phage prohead protease  36 
 
 
177 aa  97.4  1e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0713063  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1428  phage prohead protease, HK97 family  39.55 
 
 
157 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.84162  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0338  peptidase U35, phage prohead HK97  37.34 
 
 
177 aa  94.4  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.04025  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1432  HK97 family phage prohead protease  38.81 
 
 
156 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1706  phage prohead protease, HK97 family  38.81 
 
 
156 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  0.0428753 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2026  peptidase U35, phage prohead HK97  36.71 
 
 
177 aa  92  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0032  HK97 family phage prohead protease  33.8 
 
 
177 aa  90.5  2e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.378426  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4964  HK97 family phage prohead protease  40.91 
 
 
184 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000100699 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1189  HK97 family phage prohead protease  32.7 
 
 
216 aa  88.6  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000250589 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2264  phage prohead protease, HK97 family  35.23 
 
 
216 aa  88.2  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0493377 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1338  HK97 family phage prohead protease  32.27 
 
 
248 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.155288 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1681  hypothetical protein  32.7 
 
 
228 aa  85.9  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0012  prohead peptidase  31.47 
 
 
177 aa  84.7  9e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1163  peptidase U35, phage prohead HK97  35.04 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.446656  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1634  prohead peptidase  37.68 
 
 
183 aa  84  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.457432  normal  0.754513 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2095  phage prohead protease, HK97 family  31.45 
 
 
248 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1969  peptidase U35, phage prohead HK97  32.62 
 
 
235 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150043  normal  0.71487 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1804  peptidase U35, phage prohead HK97  32.24 
 
 
220 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409036  normal  0.116646 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3484  peptidase U35, phage prohead HK97  30.72 
 
 
240 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1413  peptidase U35, phage prohead HK97  34.31 
 
 
215 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3154  HK97 family phage prohead protease  36.22 
 
 
159 aa  80.5  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071533  normal  0.0125341 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2175  putative phage prohead protease  37.31 
 
 
205 aa  79.7  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1132  HK97 family phage prohead protease  34.48 
 
 
187 aa  79  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.431565 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2899  HK97 family phage prohead protease  37.24 
 
 
185 aa  77.8  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575479  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1566  head maturation protease, putative  30.45 
 
 
233 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000525183 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2470  prohead peptidase  35.17 
 
 
187 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1060  peptidase U35, phage prohead HK97  32.68 
 
 
190 aa  76.6  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0756377 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0648  prohead peptidase  31.63 
 
 
231 aa  75.9  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.857863  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1601  phage prohead protease, HK97 family  31.77 
 
 
240 aa  75.1  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0868  HK97 family phage prohead protease  32.8 
 
 
250 aa  74.7  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.844474  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3395  HK97 family phage prohead protease  33.16 
 
 
236 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296315  hitchhiker  0.00000000423537 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1077  HK97 family phage prohead protease  35.04 
 
 
187 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0554  HK97 family phage prohead protease  33.94 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2996  prohead peptidase  32.91 
 
 
174 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.102454  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1853  prophage LambdaSa2, protease, putative  30 
 
 
180 aa  74.7  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.812797  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1335  HK97 family phage prohead protease  34 
 
 
243 aa  73.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.348898  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0921  HK97 family phage prohead protease  35.38 
 
 
144 aa  73.6  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.340053 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1669  prohead peptidase  30.41 
 
 
228 aa  72.8  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1656  phage prohead protease, HK97 family  35.48 
 
 
233 aa  72.4  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1896  prohead peptidase  33.12 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3485  HK97 family phage prohead protease  30.82 
 
 
244 aa  68.2  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2490  peptidase U35, phage prohead HK97  35.21 
 
 
165 aa  63.9  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.810682  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3914  HK97 family phage prohead protease  36.64 
 
 
139 aa  61.6  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768445  normal  0.030965 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1483  peptidase U35, phage prohead HK97  31.37 
 
 
165 aa  59.7  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1626  peptidase U35, phage prohead HK97  31.37 
 
 
165 aa  59.7  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.468737  normal  0.616924 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0860  phage prohead protease, HK97 family  26.17 
 
 
183 aa  59.3  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0276  HK97 family phage prohead protease  33.13 
 
 
168 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3979  phage prohead protease, HK97 family  33.8 
 
 
165 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2000  peptidase U35, phage prohead HK97  30.97 
 
 
149 aa  50.4  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.639084  hitchhiker  0.00378226 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5466  hypothetical protein  27.81 
 
 
167 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2917  HK97 family phage prohead protease  30.57 
 
 
579 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.595306  normal  0.164671 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1358  HK97 family phage prohead protease  31.52 
 
 
171 aa  48.5  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.272379 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3121  prohead peptidase  29.58 
 
 
150 aa  47.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4383  prohead protease  27.44 
 
 
239 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3313  phage major capsid protein, HK97 family  33.78 
 
 
562 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000533544 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3514  prohead peptidase  32 
 
 
526 aa  45.1  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3562  prohead peptidase  32 
 
 
526 aa  45.1  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.530159 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0462  prohead peptidase  29.55 
 
 
248 aa  44.7  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.523107 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3586  prohead peptidase  32 
 
 
526 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.286744  normal  0.0669671 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0672  HK97 family phage major capsid protein  28.75 
 
 
506 aa  43.5  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0569  phage major capsid protein, HK97 family  32.11 
 
 
514 aa  42  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.361307  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3891  peptidase U35 phage prohead HK97  26.62 
 
 
249 aa  42  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0472754 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1585  HK97 family phage prohead protease  28.65 
 
 
201 aa  41.6  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00257234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>